禾谷炭疽菌Pth11 GPCR预测及生物信息学分析

禾谷炭疽菌Pth11 GPCR预测及生物信息学分析

论文摘要

目前,炭疽菌属真菌约包括600个种,可以侵染3 200多种单了叶植物和双子叶植物。作为该属中重要的病菌——禾谷炭疽菌Colletotrichum graminicola (Cesati) Wilson,其可以侵染玉米、小麦、高粱等禾本科农作物引起炭疽病,给各国农业生产造成巨大的经济损失。自20世纪70年代以来,由该病菌引起的玉米炭疽病在美国、印度等国家非常普遍。2012年,随着禾谷炭疽菌全基因组序列的公布,人们对该炭疽菌开展了诸多方面的研究工作,主要涉及该菌的MAPK途径蛋白预测及其生物信息学分析,以及致病基因鉴定、功能解析、分泌蛋白预测及RGS、14-3-3蛋白、磷酸二酯酶、AC、PITP等G蛋白信号途径相关蛋白的生物信息学分析等。G蛋白偶联受体蛋白(GPCR)一直是学术界基础研究的热点和重要的药物靶点,以GPCR作为靶点的处方药物占据全世界药物市场的50%。前人对诸如酿酒酵母、裂殖酵母、粗糙脉孢霉、构巢曲霉、新型隐球酵母等模式真菌以及大豆疫霉、橡树疫霉、致病疫霉等卵菌GPCR的研究开展了较多工作,然而,尚未见有关禾谷炭疽菌中Pth11 GPCR预测及理化性质分析的研究报道。因此,本研究通过关键词搜索及Blastp比对获得该菌中具有的20条Pth11 GPCR蛋白,并以此序列为基础,采用SignalP v4.0、ProtCompB、TMHMM、Phobius、SMART等在线分析程序对氨基酸序列进行预测分析,对该蛋白的理化性质、二级结构、疏水性、转运肽及保守结构域等性质进行分析,以期为深入解析该病菌侵染机制的研究打下坚实的理论基础。

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文章来源

类型: 国内会议

作者: 刘宏莉,祝友朋,韩长志

关键词: 禾谷炭疽菌,跨膜区,信号肽,生物信息学

来源: 中国植物病理学会2019年学术年会 2019-07-20

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,农业基础科学,植物保护

单位: 西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室

分类号: S432.4

DOI: 10.26914/c.cnkihy.2019.020174

页码: 152

总页数: 1

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