市售禽蛋表面耐药菌和耐药基因污染研究

论文摘要

耐药基因是近年来引起人类重视的一类新型污染物。禽蛋可作为耐药基因的食源性污染源和传播媒介。本研究创新性地结合宏基因组学、传统微生物培养法、药敏试验法对禽蛋表面菌种群落多样性、耐药菌比例和耐药基因丰度进行的研究。结果表明:1、禽蛋清洁程度对细菌总数的影响,鸡蛋生产的洁蛋操作在一定程度上降低了禽蛋表面的细菌总数。磺胺类（SMZ）、四环素类（TET）、喹诺酮类（CIP）、大环内酯类（ERY）是三类禽蛋乳糖发酵型肠杆菌明显的耐药种类。2、禽蛋上乳糖发酵型肠杆菌的耐药性很高。在三类禽蛋表面乳糖发酵型肠杆菌耐药性情况不同,但均对四环素类耐药率达98.7-99.6%,对氯霉素也具有高耐药率;检测到的菌株多为多重耐药菌株,甚至发现八重耐药菌的存在。3、在不同类型禽蛋表面均检测到耐药基因,高达21种耐药基因类别,其中共检测到耐药基因亚型洁鸡蛋299种、非洁鸡蛋195种、非洁鸭蛋274种。禽蛋表面含较多multidrug类（多药类）、tetracycline类（四环素类）、aminoglycoside类（氨基糖苷类）、macrolide-lincosamide-streptogramin类（大环内酯类-林克酰胺类-链霉素类）、sulfonamide类（磺胺类）耐药基因。乳糖发酵型肠杆菌中高丰度的耐药基因类别和耐四环素乳糖发酵型肠杆菌的具有相似性,且携带的耐药基因丰度比禽蛋表面总微生物的高。实验所得的禽蛋耐药基因数据和目前研究发现的禽畜数据集一致。结果显示了禽蛋对人类健康潜在风险。

论文目录

• 内容摘要
• abstract
• 第一章 绪论
•   1.1 抗生素、耐药菌及耐药基因简介
•   1.2 环境中抗生素和耐药基因的机理研究
•   1.3 耐药菌和耐药基因检测分析方法研究
•   1.4 禽畜业的抗生素及耐药基因
•   1.5 禽蛋抗生素、耐药菌和耐药基因研究现状
•   1.6 乳糖发酵型肠杆菌
•   1.7 研究框架
•     1.7.1 研究意义
•     1.7.2 研究内容
•     1.7.3 技术路线
• 第二章 市售禽蛋表面微生物污染情况
•   2.1 禽蛋采样
•   2.2 实验材料与设备
•   2.3 实验方法
•     2.3.1 抗生素母液配制
•     2.3.2 培养基配制
•     2.3.3 细菌、乳糖发酵型肠杆菌和耐药乳糖发酵肠杆菌计数
•     2.3.4 DNA提取
•     2.3.5 宏基因组测序
•   2.4 测序数据物种多样性分析
•   2.5 实验结果与讨论
•     2.5.1 禽蛋表面细菌和乳糖发酵型肠杆菌计数结果
•     2.5.2 禽蛋表面耐药乳糖发酵型肠杆菌计数结果
•     2.5.3 禽蛋表面微生物物种多样性分析
•   2.6 小结
• 第三章 市售禽蛋乳糖发酵型肠杆菌耐药性分析
•   3.1 实验菌株
•   3.2 实验材料与设备
•   3.3 实验方法
•     3.3.1 实验材料制备
•     3.3.2 药敏试验
•   3.4 实验结果与讨论
•   3.5 小结
• 第四章 禽蛋表面耐药基因类型及丰度比较
•   4.1 实验菌株
•   4.2 实验材料与设备
•   4.3 实验方法
•     4.3.1 培养基配制
•     4.3.2 菌落筛选培养和等细胞浓度混匀
•     4.3.3 DNA提取
•     4.3.4 宏基因组测序
•   4.4 测序数据耐药基因处理分析
•   4.5 实验结果与讨论
•     4.5.1 洁鸡蛋耐药基因类型及丰度比较
•     4.5.2 非洁鸡蛋耐药基因类型及丰度比较
•     4.5.3 非洁鸭蛋耐药基因类型及丰度比较
•     4.5.4 各类禽蛋间耐药基因类型和丰度比较
•     4.5.5 各类禽蛋间beta多样性分析
•   4.6 小结
• 第五章 结论与展望
•   5.1 结论
•   5.2 展望
• 附录一 数据linux本地分析
• 附录二 耐药基因数据
• 附录三 药敏试验数据
• 参考文献
• 致谢

文章来源

类型: 硕士论文

作者: 傅学聪

导师: 张明

关键词: 禽蛋,乳糖发酵型肠杆菌,耐药基因,宏基因组,药敏试验

来源: 华东师范大学

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 环境科学与资源利用

单位: 华东师范大学

分类号: X56

总页数: 90

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