导读:本文包含了白蛋白信号肽论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:生物信息学,青枯病,分泌信号肽,质粒基因组
白蛋白信号肽论文文献综述
杨俊誉,张志超,韩永花,李婕,张彧[1]（2016）在《马铃薯青枯菌Po82菌株质粒基因组分泌蛋白信号肽的分析》一文中研究指出应用计算机技术和生物信息学的方法,采用Signal P4.0、Lipo P1.0、Target P1.0.1、TMHMM2.0蛋白质分析软件对植物病原细菌Ralstonia solanacearum Po82质粒基因组的1680个ORFs编码的分泌蛋白信号肽氨基酸序列进行预测分析。结果表明,质粒基因组的1680个ORFs中有102个ORFs所编码的蛋白质具有N-端信号肽序列,包括85个Ⅰ型信号肽,1个Ⅱ型信号肽,15个Prepilin-like信号肽和1个细菌素和信息素信号肽,所有的分泌蛋白中具有RR-motif信号肽结构的有14个,且均为Ⅰ型信号肽。在102个具有可切割信号肽的分泌蛋白中,有50.98%的蛋白质为胞外分泌型(S型),33.33%为线粒体分泌型(M型),6.87%为叶绿体分泌型(C型),8.82%为其他类型的分泌蛋白。信号肽切割位点的氨基酸组成中非极性氨基酸为53.27%,极性氨基酸为18.79%,带负电荷的酸性氨基酸为19.12%,带正电荷的碱性氨基酸为8.82%。比较R.solanacearum GMI1000和R.solanacearum Po82质粒基因组信号肽类型的区别,发现这2种菌在信号肽类型上存在很大差异。文章通过对R.solanacearum Po82质粒基因组信号肽分泌蛋白的研究,揭示了该病原菌与寄主互作的致病机制在长期进化中的独特地位。(本文来源于《西南农业学报》期刊2016年05期）
孙彦刚,赵建军,白雪,牛登云,邵西群[2]（2015）在《水貂、狐狸和貉源犬瘟热病毒F蛋白信号肽区基因克隆及遗传变异分析》一文中研究指出为了解近年来犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)在中国毛皮动物主要养殖区的流行情况及遗传变异情况,本试验于2012-2014年从山东、河北、辽宁收集疑似犬瘟热的水貂、狐狸和貉病料,经犬瘟热抗原检测试纸条检测和RT-PCR检测为阳性后,克隆测序了15株CDV F蛋白信号区(Fsp)基因序列。序列分析结果显示,15株CDV野毒株Fsp基因核苷酸序列和氨基酸序列的相似性均为93.6%~100.0%,与疫苗株相似性为80.7%~81.7%。基因系统进化分析结果显示,15株野毒株均属于中国当前流行的Asia-1基因型。氨基酸序列比对分析结果显示,Fsp蛋白在氨基酸3-14、16-37、47-67位等处存在高变异。通过对当前流行CDV野毒株Fsp基因序列分析,结果表明该Fsp基因区具有较高的变异率,可作为CDV基因分型的依据,同时本试验结果为毛皮动物犬瘟热的防控提供了参考依据。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2015年04期）
Thaa,B,刘萌[3]（2013）在《猪繁殖与呼吸综合征病毒的GP5蛋白信号肽切割:一小部分分子保留诱饵肽可能是引起病毒持续感染的分子机理》一文中研究指出猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductiveand respiratory syndrome virus,PRRSV)是影响猪产业的主要病原菌之一,成功防控和净化该病毒的最大阻碍是抗原的多样性和持续性感染。作为PRRSV主要的结构蛋白,GP5虽只在病毒侵染宿主后期产生,却被认为是重要的引起中和抗体的靶蛋白。这种现象的产生可能原因是靠近GP5蛋白高变区的"诱饵肽"出现。这个区域也存在可能的信号肽的切割位点和大量的N端糖基化位点(取决于病毒毒株不同)。合成GP5蛋白的分子机理至今尚未有试验揭示信号肽何时何地被切割及"诱饵肽"是否存在病毒颗粒中。试验结果证实了不管是在体外微粒体中翻译还是在转染细胞中,美洲株2型参考毒株VR-2332的GP5信号肽均能被切割。本试验结果发现,这种切割是不依赖于邻近的糖基化位点;且在含有PRRSV 2型的GP5序列的猪源细胞里也会发生。精确的信号肽切割位点是通过模拟病毒和重组GP5蛋白质谱分析法发现的,结果显示,GP5的信号肽存在2个位点切割,所以GP5蛋白的混合物存在于病毒粒子中,且某些仍保留了"诱饵表位"序列。高变区的糖基化位点显现出了病毒的多样性。最后,作者设计了能阻碍1个信号肽切割位点的GP5突变体,原始的GP5和只能在第2位点切割的突变体用SDS-PAGE显现出同样大小条带,表明绝大多数GP5分子是不含有"诱饵肽"的。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2013年08期）
乔斌,段铭,关振宏,栾维民,钱爱东[4]（2013）在《狂犬病病毒糖蛋白信号肽序列分析》一文中研究指出为比较不同狂犬病病毒株糖蛋白信号肽序列的差异,测定了2株固定毒(CVS、3aG株)及2株街毒(SX、PB3)的糖蛋白核苷酸序列,并推导了氨基酸序列。DNAstar软件分析表明:2株街毒糖蛋白信号肽同源性为100%,2株固定毒株同源性为84.2%,街毒株与CVS、3aG的同源性分别为78.9%和73.7%;2株街毒的信号肽序列与NCBI收录的我国近年来分离的街毒株的序列完全相同;街毒株与常用疫苗株间的同源性介于68.4%~84.2%,疫苗株PV与SRV9、PV与ERA、PV与SAG同源性均为100%。对糖蛋白信号肽疏水区(-15位到-4位)的二级结构预测和疏水值计算显示,街毒株信号肽的二级结构和疏水值均与常用疫苗株和固定株存在明显差异;在N2A细胞上效价测定显示,2株街毒的效价明显低于2株固定毒。(本文来源于《吉林农业大学学报》期刊2013年03期）
王世民,苏艳[5]（2012）在《金黄色葡萄球菌纤连结合蛋白信号肽的生物信息学分析及其真核分泌表达》一文中研究指出参考GenBank中收录的金黄色葡萄球菌FnBPA(fibronectin-binding protein A)基因和牛IFN-γ序列进行了信号肽序列的分析。分析结果显示,牛IFN-γ信号肽序列相关指标优于金黄色葡萄球菌FnBPA基因自身的信号肽序列。在此基础上利用重迭延伸PCR法以牛IFN-γ信号肽序列取代金黄色葡萄球菌FnBPA基因的信号肽序列,并构建分泌型真核表达载体PV-SFn。该重组表达载体转染BHK-21细胞后经ELISA及Western-blot检测证实可有效分泌表达目的蛋白。(本文来源于《新疆农业大学学报》期刊2012年03期）
刘建巨,关继奎,王琳,赵秀梅,郑建秋[6]（2011）在《真核表达质粒PcDNA3.1(+)-带有白蛋白信号肽的Vasostatin(120-180aa)的构建及其在体内外细胞中的表达》一文中研究指出目的构建真核表达质粒PcDNA3.1(+)-带有白蛋白信号肽的Vasostatin(120-180aa)并了解其在体内外真核细胞中的表达。方法将带有白蛋白信号肽的Vasostatin(120-180aa)的逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)产物克隆至pcDNA3.1(+)真核表达载体上,经酶切鉴定及测序分析证明构建成功后,以脂质体介导法转染体外培养的真核293T细胞及注射入鼠骨骼肌细胞中,了解其在体内外真核细胞中的表达情况。结果我们获取了包含带有白蛋白信号肽的Vasostatin(120-180aa)成熟肽及HA抗原在内的一段cDNA片段,并成功地与真核表达载体PcDNA3.1(+)连接,经测序表明,其中含有的带有白蛋白信号肽的Vasostatin(120-180aa)成熟肽的序列与Genebank上报道的序列完全一致。即我们成功构建了真核表达质粒PcDNA3.1(+)-带有白蛋白信号肽的Vasostatin(120-180aa)。之后,在转染了该质粒的体外真核293T细胞的上清液中及骨骼肌注射了该质粒的鼠血液中,利用Western-blot法检测到了目的基因的蛋白质。结论带有白蛋白信号肽的真核表达质粒PcDNA3.1(+)-Vasostatin(120-180aa)增强了蛋白分泌表达能力,这为进一步应用该质粒治疗全身新生血管类病奠定了一定基础.(本文来源于《中国实验诊断学》期刊2011年01期）
丁轲,余祖华,程相朝,王天奇,刘一尘[7]（2008）在《短小乳杆菌S-层蛋白信号肽基因的克隆及特性分析》一文中研究指出根据GeneBank上注册的短小乳酸杆菌S-层蛋白基因序列设计了1对引物,采用PCR法获得了S-层蛋白信号肽基因,将其克隆到pMD18-T载体并测序。序列分析表明,序列全长为370bp,其中编码信号肽部分的90bp的碱基与GeneBank中的完全相同,生物信息学分析也表明这是一段信号肽基因,氨基酸序列分析也表明它具备信号肽的典型特征。试验克隆得到了短小乳酸杆菌S-层信号肽基因。(本文来源于《湖北农业科学》期刊2008年12期）
王凤雪,闫喜军,柴秀丽,吴威,邵西群[8]（2008）在《犬瘟热病毒临床流行野毒株F蛋白信号肽区分析》一文中研究指出根据GenBank上发表的犬瘟热病毒(CDV)融合蛋白基因(F)序列,设计引物扩增F蛋白部分信号肽区,片段长369bp。对2005年～2007年收集的河北、辽宁和山东等地的犬瘟热阳性的水貂、狐、貉实质脏器、血液、尿液等样品进行扩增,获得了13(本文来源于《中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第七次研讨会论文集》期刊2008-07-01）
王凤雪,闫喜军,柴秀丽,吴威,邵西群[9]（2008）在《犬瘟热病毒临床流行野毒株F蛋白信号肽区分析》一文中研究指出根据GenBank上发表的犬瘟热病毒(CDV)融合蛋白基因(F)序列,设计引物扩增F蛋白部分信号肽区,片段长369bp。对2005年~2007年收集的犬瘟热阳性的水貂、狐、貉实质脏器、血液、尿液等样品进行扩增,获得了13个CDVF蛋白部分信号肽区基因片段。序列分析发现,CDV野毒F蛋白该区段核苷酸与氨基酸序列与目前我国使用疫苗株CDV3及其他国内外疫苗株比较存在较大差异,与CDV3对应区段的核苷酸同源性在80.7%~83.2%之间,而推导的对应氨基酸序列同源性只有64.8%~71.3%。部分信号肽区的氨基酸疏水性分析,推测其调控功能也发生变化,本研究为CDV遗传变异和分子流行病学提供理论数据。(本文来源于《微生物学通报》期刊2008年04期）
周晓罡,丁玉梅,张绍松,孙茂林,李建平[10]（2008）在《马铃薯青枯病(Ralstonia solanacearum)质粒基因组分泌蛋白信号肽初步分析》一文中研究指出应用SignalP 3.0,TMHMM 2.0,THUMBUP,big-PI,TargetP 1.01,Lipop 1.0,TatP 1.0等7种软件分别对马铃薯青枯病菌Ralstonia solanacearum GMI1000质粒基因组1 681个氨基酸序列进行预测分析.结果表明,该物种质粒基因组分泌蛋白有85个,占其基因组编码蛋白的5.1%.通过对质粒分泌蛋白切割位点信号肽类型分析后发现具Ⅰ型信号肽的分泌蛋白有73个,Ⅱ型的有12个,所有分泌蛋白中具RR-motif信号肽结构的有3个,且均为Ⅰ型信号肽.质粒分泌蛋白中,59个具可预测功能,26个为未知功能蛋白.已知功能的分泌蛋白主要集中于细胞代谢,细胞调控及转运,细胞膜结构等领域.在质粒分泌蛋白中发现3个Ⅲ型信号肽分泌蛋白,该类蛋白是由hip基因编码产生,在植物及动物病原细菌中相当保守,负责将效应蛋白分子转运到寄主细胞中从而产生致病作用.这些功能是该物种在长期进化过程中与环境中各种因子发生互作,相互适应的结果.(本文来源于《云南大学学报(自然科学版)》期刊2008年S1期）
白蛋白信号肽论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为了解近年来犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)在中国毛皮动物主要养殖区的流行情况及遗传变异情况,本试验于2012-2014年从山东、河北、辽宁收集疑似犬瘟热的水貂、狐狸和貉病料,经犬瘟热抗原检测试纸条检测和RT-PCR检测为阳性后,克隆测序了15株CDV F蛋白信号区(Fsp)基因序列。序列分析结果显示,15株CDV野毒株Fsp基因核苷酸序列和氨基酸序列的相似性均为93.6%~100.0%,与疫苗株相似性为80.7%~81.7%。基因系统进化分析结果显示,15株野毒株均属于中国当前流行的Asia-1基因型。氨基酸序列比对分析结果显示,Fsp蛋白在氨基酸3-14、16-37、47-67位等处存在高变异。通过对当前流行CDV野毒株Fsp基因序列分析,结果表明该Fsp基因区具有较高的变异率,可作为CDV基因分型的依据,同时本试验结果为毛皮动物犬瘟热的防控提供了参考依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
白蛋白信号肽论文参考文献
[1].杨俊誉,张志超,韩永花,李婕,张彧.马铃薯青枯菌Po82菌株质粒基因组分泌蛋白信号肽的分析[J].西南农业学报.2016
[2].孙彦刚,赵建军,白雪,牛登云,邵西群.水貂、狐狸和貉源犬瘟热病毒F蛋白信号肽区基因克隆及遗传变异分析[J].中国畜牧兽医.2015
[3].Thaa,B,刘萌.猪繁殖与呼吸综合征病毒的GP5蛋白信号肽切割:一小部分分子保留诱饵肽可能是引起病毒持续感染的分子机理[J].中国畜牧兽医.2013
[4].乔斌,段铭,关振宏,栾维民,钱爱东.狂犬病病毒糖蛋白信号肽序列分析[J].吉林农业大学学报.2013
[5].王世民,苏艳.金黄色葡萄球菌纤连结合蛋白信号肽的生物信息学分析及其真核分泌表达[J].新疆农业大学学报.2012
[6].刘建巨,关继奎,王琳,赵秀梅,郑建秋.真核表达质粒PcDNA3.1(+)-带有白蛋白信号肽的Vasostatin(120-180aa)的构建及其在体内外细胞中的表达[J].中国实验诊断学.2011
[7].丁轲,余祖华,程相朝,王天奇,刘一尘.短小乳杆菌S-层蛋白信号肽基因的克隆及特性分析[J].湖北农业科学.2008
[8].王凤雪,闫喜军,柴秀丽,吴威,邵西群.犬瘟热病毒临床流行野毒株F蛋白信号肽区分析[C].中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第七次研讨会论文集.2008
[9].王凤雪,闫喜军,柴秀丽,吴威,邵西群.犬瘟热病毒临床流行野毒株F蛋白信号肽区分析[J].微生物学通报.2008
[10].周晓罡,丁玉梅,张绍松,孙茂林,李建平.马铃薯青枯病(Ralstoniasolanacearum)质粒基因组分泌蛋白信号肽初步分析[J].云南大学学报(自然科学版).2008