17β羟基类固醇脱氢酶13和线粒体融合蛋白2在肝细胞癌组织中的表达变化及生物信息学分析

17β羟基类固醇脱氢酶13和线粒体融合蛋白2在肝细胞癌组织中的表达变化及生物信息学分析

论文摘要

目的探索17β羟基类固醇脱氢酶13(HSD17B13)和线粒体融合蛋白2(MFN2)在临床肝细胞癌(以下简称肝癌)组织样本中的表达变化及临床意义;同时采用生物信息学方法,进行目标基因分析。方法选取2017年9月-2018年3月于福建省立医院接受手术治疗的15例肝癌患者,手术后获取肝癌及其周围癌组织进行实验研究。通过实时荧光定量PCR及Western Blot法检测HSD17B13和MFN2基因在肝癌组织和癌旁组织中的表达变化情况,并分析其临床意义。采用单细胞测序数据库、GTEx数据库及TCGA数据库分析HSD17B13和MFN2在肝癌组织中的表达量、肝癌不同分期的表达水平及与肝癌总体生存的关系,并分析二者之间的相关性。符合正态分布的计量资料两组间比较采用t检验,多组间比较采用方差分析;非正态分布的计量资料两组间比较采用Mann-Whitney U检验,多组间比较采用Kruskal-Wallis H检验。采用log-rank检验变量对生存率的影响,Kaplan-Meier法绘制生存曲线。采用Pearson相关分析检验两个变量之间的关系。结果实时荧光定量PCR及Western Blot检测结果显示,相对于癌旁组织,HSD17B13和MFN2基因在肝癌组织中的表达明显下调(PCR检测t值分别为-2. 467、-3. 933,P值分别为0. 020、0. 001;Western Blot检测t值分别为-5. 357、-5. 771,P值分别为0. 006、0. 026)。生物信息学分析结果表明,肝癌组织中HSD17B13表达明显下调(P <0. 05);随着肝癌分期越高,HSD17B13表达水平越低(F=3. 220,P=0. 023);低HSD17B13表达与不良生存相关(风险比=0. 630,P=0. 011);在肝癌组织中,MFN2与HSD17B13表达呈显著正相关(r=0. 190,P <0. 001)。结论 MFN2与HSD17B13在肝癌中表达下调,是潜在的具有临床相关性的抑癌基因,可能参与肝癌发生发展过程中的生物学行为,也可成为肝癌筛查、临床分级、预后评估的分子标志物及有效的肝癌治疗靶点。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 主要材料和设备
  •   1.2 临床组织样本
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 real-time PCR检测
  •     1.3.2 Western Blot检测
  •     1.3.3 生物信息学分析
  •   1.4 统计学方法
  • 2 结果
  •   2.1 肝癌组织及癌旁组织中HSD17B13和MFN2的表达
  •   2.2 基于生物信息学数据库分析HSD17B13及MFN2在肝癌中表达情况及两者的关系
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 曾钗明,严茂林,石益海,郭太林,梅爱农,陈建康,许桂平,何晓红

    关键词: 肝细胞,孕酮还原酶,线粒体膜转运蛋白质类,基因,肿瘤抑制,计算生物学

    来源: 临床肝胆病杂志 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 肿瘤学

    单位: 福建省立医院干部特诊科,福建省立医院肝胆外科,海军军医大学附属公利医院消化内科

    基金: 福建省自然科学基金(2017J01244),福建省卫计委医学创新课题(2018-CX-8)

    分类号: R735.7

    页码: 2736-2740

    总页数: 5

    文件大小: 1418K

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