基于TRAP标记的苹果属种间遗传多样性分析

论文摘要

【目的】了解苹果属资源遗传多样性,以期为种间亲缘关系分析提供分子水平上的可靠依据。【方法】利用TRAP(Target Region Amplified Polymorphism)分子标记对苹果属30个种和梨属3个种共33份材料进行了遗传多样性分析。【结果】筛选出的16对引物组合共扩增出407条有效条带,其中多态性条带404条,多态性百分率达99.26%。UPGMA聚类结果显示,当遗传相似系数GS=0.666时能很好地区分苹果属与梨属材料,当GS=0.680时可将苹果属30个种分为Ⅰ和Ⅱ两个亚类。主坐标分析中材料所属类群同UPGMA聚类结果有较高的符合度,基本与传统系谱一致。但群体结构分析结果同UPGMA聚类和主坐标聚类结果有一定的差异性,其中23份材料的协变量Q值≥0.6,亲缘关系相对单一。【结论】开发出TRAP标记引物组合16对,可有效地区分苹果属种质材料的遗传多样性,为苹果属种间亲缘关系分析提供了新的分子证据。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
•     1.2.1 基因组DNA提取
•     1.2.2 引物筛选与PCR扩增
•     1.2.3 数据处理与统计分析
• 2 结果与分析
•   2.1 TRAP标记多态性分析
•   2.2 遗传相似性系数聚类分析
•   2.3 主坐标聚类分析
•   2.4 群体结构分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 索相敏,郝婕,冯建忠,鄢新民,王献革,李学营

关键词: 苹果属,遗传多样性,标记,群体结构分析

来源: 果树学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 园艺

单位: 河北省农林科学院石家庄果树研究所

基金: 国家苹果产业技术体系专项资金(CARS-27),河北省科技支撑计划项目(16226312D-2),河北省农林科学院创新工程课题资助,河北省农林科学院人才工程课题资助

分类号: S661.1

DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20190211

页码: 1609-1618

总页数: 10

文件大小: 1556K

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