导读:本文包含了代谢通量分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:通量,大肠杆菌,转录,高通,血液,量测,渗透压。
代谢通量分析论文文献综述
洪铭,李岩,张苏龙,李雪松,封彬[1]（2019）在《利用甜菜碱提升赖氨酸发酵及其代谢通量分析》一文中研究指出赖氨酸发酵后期会产生很高的渗透压。甜菜碱可以有效提高大肠杆菌对渗透压的耐受性,大肠杆菌菌体自身对渗透压的耐受机制反而会受其抑制。激活菌体自身的渗透压耐受机制,可以提高发酵指标。实验结果表明:在菌体生长到OD_(562)为19.5后添加甜菜碱,可以使赖氨酸的发酵强度从5.6 g/(L·h)提升至6.3 g/(L·h),转化率从65%提升至68.5%。提高初糖质量浓度也能激活菌体渗透压耐受性,可以进一步提高发酵强度至6.6 g/(L·h)。代谢通量分析结果表明:高转化率工艺条件下6-磷酸果糖的逆向转化进入磷酸戊糖途径的通量较对照提高43%,而TCA循环通量较对照降低18.6%。研究结果表明:除去发酵初期的甜菜碱并提高初糖质量浓度有利于提高赖氨酸发酵水平,要提高转化率需将更多6-磷酸果糖导入磷酸戊糖途径并降低TCA循环通量。(本文来源于《发酵科技通讯》期刊2019年03期）
金实[2]（2019）在《高通量血液透析治疗老年尿毒症患者钙磷代谢异常的临床疗效分析》一文中研究指出目的探究高通量血液透析治疗老年尿毒症患者钙磷代谢异常的临床疗效。方法选取选取2015年2月至2017年10月在我院进行尿毒症治疗的76例老年患者,将其随机分为两组,并分别进行常规血液透析(常规组)及高通量血液透析(高通量组),比较两组患者血钙、血磷、血肌酐(Scr)及及血甲状旁腺素(iPTH)水平,并观察其不良反应情况。结果治疗后,高通量组患者Scr及i PTH水平分别为(603.25±102.64)μmol/L及(310.25±127.26)mg/mL,显着低于治疗前及常规组(P <0.05),且高通量组血磷及血钙水平分别为(1.79±0.30)mmol/L及(2.48±0.29)mmol/L,其钙磷水平显着优于常规组(P <0.05),且两组均无不良反应发生。结论对老年尿毒症患者进行高通量血液透析,能够有效改善其钙磷代谢异常症状,同时降低患者血肌酐及血甲状旁腺素水平,对改善患者症状具有重要意义。(本文来源于《中国医药指南》期刊2019年08期）
向丽娟,汪圣毅,包楚阳,张焱,韩坤[3]（2019）在《胃癌脂代谢通路基因表达的转录组学高通量分析》一文中研究指出目的探讨胃癌(GC)脂代谢(LM)通路的基因表达情况。方法转录组测序筛选8例GC及4例癌旁组织之间的差异表达基因,京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析GC脂代谢相关通路中的关键基因(KGS)。结果高通量测序获得3 198个长度大于200 bp的差异表达基因。KEGG富集分析发现6个显着富集代谢通路,其中脂肪消化与吸收代谢通路有9个基因(MOGAT3、FABP2、FABP1、APOA4、NPC1L1、PLA2G2A、ABCG5、PLA2G4A、PLA2G12B)显着上调,2个基因(LIPF、PLA2G1B)显着下调。结论 GC脂代谢关键基因表达的异常状态为寻求胃癌诊断标志物提供了线索。(本文来源于《安徽医科大学学报》期刊2019年01期）
左正叁,张柯,宋萍,黄宝琪,方心草[4]（2019）在《大肠杆菌产脂肪酶代谢通量分析》一文中研究指出考察了5 L发酵罐中大肠杆菌表达枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA的发酵特性,诱导2 h后,脂肪酶比活达到最高值18. 11 U/mg。建立了E. coli代谢合成脂肪酶的反应网络,并通过代谢通量分析发现,经诱导产酶后,乳酸代谢通量增加,碳流通过糖酵解途径(embden-meyerhof-parnas pathway,EMP)生成乳酸,分流了部分合成生物量的碳流,降低了生物量合成的速率;缬氨酸通量的增加满足了脂肪酶合成的需求; ATP通量的减少,限制了脂肪酶的高效合成。该研究为进一步指导提高生产脂肪酶菌种的发酵条件优化和代谢途径改造提供了理论依据。(本文来源于《食品与发酵工业》期刊2019年01期）
张皖君,蓝蔚青,段贤源,孙晓红,谢晶[5]（2019）在《基于高通量测序分析不同保鲜冰处理对鲈鱼菌群组成与代谢功能的影响》一文中研究指出目的:分析不同保鲜冰处理下鲈鱼微生物菌群变化及其与品质指标的相关性。方法:分别采用流化冰(slurry ice,SI)、酸性电解水冰(acidic electrolyzed water ice,AEWI)和碎冰(crushed ice,CI)对鲈鱼进行处理,测定鲈鱼的总挥发性盐基氮(total volatile basic nitrogen,TVB-N)含量与K值,并利用高通量测序技术对样品菌群结构和代谢功能进行比较分析。结果:SI和AEWI对鲈鱼均有一定的保鲜作用,其中SI抑制鲈鱼蛋白质和核苷酸降解速度的效果最显着。在冰藏前期(0～3 d),AEWI与CI组样品中芽孢杆菌属(Bacillus)、乳球菌属(Lactococcus)、大洋芽孢杆菌属(Oceanobacillus)相对丰度明显高于SI组。冰藏中、后期(12～21 d),SI组样品中假单胞菌属(Pseudomonas)、希瓦氏菌属(Shewanella)、摩替亚氏菌属(Moritella)、埃希氏杆菌属(Escherichia)和别弧菌属(Aliivibrio)相对丰度明显增加,AEWI组样品假单胞菌属(Pseudomonas)和不动杆菌属(Acinetobacter)相对丰度所占比例逐渐增大,CI组中不动杆菌属在21 d时达27.77%,成为造成鲈鱼贮藏中、后期腐败的主要菌属。主成分分析表明,冰藏方式及贮藏时间对鲈鱼菌群结构组成有较大影响。鲈鱼菌群中与TVB-N含量、K值呈正相关的有假单胞菌属、不动杆菌属、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和希瓦氏菌属,它们可能是鲈鱼冰藏期间的优势菌。CI和AEWI组鲈鱼细菌中参与氨基酸、脂质和碳水化合物代谢的相关基因相对丰度高于同一时期的SI组,这在一定程度上从细菌代谢水平解释了SI能延缓鲈鱼腐败的原因,为后期进一步从微生物抑制机制上优化鲈鱼贮藏保鲜技术提供了理论参考。(本文来源于《食品科学》期刊2019年05期）
高岩[6]（2018）在《基于动态代谢通量分析的发酵过程建模与优化》一文中研究指出在现代生物技术的发展历程中,发酵过程是实现生物技术产业化的重要环节。当代发酵工程技术融合了代谢工程、基因工程等,已在食品、化工与医药领域取得了巨大成就。建立准确有效的发酵过程模型是实现控制、优化与过程监测的关键前提。现阶段通常采用动力学模型或智能化模型,此类模型均描述了发酵过程的近似宏观特性,而微生物生长过程错综复杂,现有模型缺少对发酵代谢机理的分析与利用,无法利用宏观操作变量调控微观元素。本文根据代谢网络信息提出了一种基于动态代谢通量分析(Dynamic Metabolic Flux Analysis,DMFA)的发酵过程建模与优化策略。具体研究内容如下:(1)代谢网络的通量分布求解。代谢通量是构成细胞生理学的重要因素,决定了细胞的生化特征,论文采用DMFA方法对代谢网络中的通量分布进行定量分析。首先根据非稳态特征建立通量均衡方程,同时将代谢通量描述为一组自由通量的组合,再引入一个DMFA时刻的概念,在各时间区间内对自由通量进行分段线性化,获得基于时间序列的代谢通量函数,并采用最小二乘方法进行求解。最后通过青霉素仿真实验和赖氨酸小试规模实验对DMFA方法进行验证。(2)通过建立宏观操作变量与代谢通量之间的映射模型,将微观和宏观信息进行关联。DMFA方法能够精确计算代谢通量分布,却无法描述代谢通量与宏观操作变量之间的映射关系,因此论文提出建立基于宏观、微观双层面信息的发酵过程模型。针对发酵过程的非线性、多阶段特性,论文采用多模型建模策略。首先通过高斯混合模型(Gaussian Mixture Model,GMM)聚类算法对发酵过程进行阶段划分,利用期望最大化(Expectation Maximization,EM)方法估计各子高斯成分的参数,每个子成分利用加权偏最小二乘(Weighted Partial Least Squares,WPLS)建模算法,再将各子模型融合获得全局输出。该模型充分结合代谢机理信息,能够准确描述操作变量与代谢通量之间的映射关系。最后通过青霉素仿真实验和赖氨酸小试规模实验验证模型的有效性与通用性。(3)基于宏观-微观操作模型的发酵工艺优化。当前发酵过程优化策略中所使用的模型通常缺乏代谢机理的表达,致使包含信息量较少,极大限制了优化模型的设计。论文根据所建新型模型,提出了基于宏观、微观双层面信息的优化策略。首先将发酵过程划分为菌体生长和产物合成两个阶段,考虑菌体、能量、产物、副产物等代谢物于不同阶段中的代谢要求进行优化目标设计,并根据常规动力学特征和代谢信息添加约束条件,最后采用多目标粒子群优化(Multi-Objective Particle Swarm Optimization,MOPSO)算法求解优化模型。通过对青霉素发酵过程中的底物流加速率和pH进行优化实验,证明所提优化策略能够有效节约成本、提高产量。(本文来源于《江南大学》期刊2018-06-01）
段淼[7]（2018）在《高通量测序及代谢组学分析对母乳性黄疸患儿肠道菌群结构与功能的研究》一文中研究指出第一部分通过高通量测序的方法探讨母乳性黄疸患儿肠道微生物群的特征及功能目的:通过高通量测序探讨母乳性黄疸婴幼儿肠道微生物群的特征及功能。方法:收集并选取2015年10月至2016年3月遵义市第一人民医院新生儿科和产科共34例婴幼儿为研究对象,分为母乳性黄疸(BMJ)病例组(16例)和母乳喂养未有黄疸对照组(18例),提取粪便DNA并通过PCR扩增和1%琼脂糖凝胶电泳分析,然后用Mi Seq系统测序。采用相对生物信息学方法分析DNA测序数据,利用Illumina高通量测序平台分析婴儿粪便样品中的16S r DNA V3和V4片段进行相关生物信息学分析。结果:母乳性黄疸患儿与母乳喂养未发生黄疸婴幼儿的菌群相比,大便中的肠道菌群在属水平链球菌属比对照组显着增多,肠球菌属比对照组显着减少(P<0.05);物种差异分析结果显示在门水平两组大便中变形菌门、厚壁菌门、放线菌及拟杆菌均没有统计学差异;母乳性黄疸患儿肠道菌群的多样性与对照组菌群多样性相比,两组没有统计学差异(P>0.05);16S功能预测结果显示在lever3水平,青霉素和头孢菌素生物合成代谢通路差别有统计学意义,在母乳性黄疸组中青霉素和头孢菌素的生物合成增多(P<0.05)。结论:母乳性黄疸婴儿肠道微生物组中链球菌属比例显着增多,而肠球菌属比例显着减少,这提示母乳喂养婴儿肠道中的链球菌和肠球菌对于降低母乳性黄疸的发生是有重要作用的。第二部分:代谢组学的方法分析母乳性黄疸的肠道菌群特点目的:代谢组学方法分析母乳性黄疸患儿肠道菌群的差异代谢物,以期找到与母乳性黄疸相关的生物标记物。方法:收集并选取2015年10月至2017年4月遵义市第一人民医院新生儿科和产科共65例婴幼儿为研究对象,分为母乳性黄疸病例组(30例)和母乳喂养未发生黄疸对照组(35例),利用气相色谱仪-质谱仪(Gas chromatograph-mass spectrometer,GC-MS)对细菌的代谢产物进行靶向测定短链脂肪酸分析研究。结果:共有65例粪便标本纳入研究,分析发现乙酸在母乳性黄疸(BMJ)组中含量低于对照组(734.4±95.41ug/g vs 1148±134.5ug/g),两组比较有统计学差异(t=2.56,P<0.05);丙酸在BMJ组中含量低于对照组【46.81(44.26,56.06)ug/g vs 53.13(45.1,127.41)ug/g】,两组比较差异有统计学意义(F=-2.12,P<0.05)。结论:母乳性黄疸婴儿肠道菌群代谢物中乙酸和丙酸(短链脂肪酸)显着减少,提示母乳喂养婴儿代谢产物中的乙酸和丙酸与母乳性黄疸的发生有着重要的关系,同时肠道菌群组成分析结果与代谢组学分析结果有着良好的联系,为多组学深入研究BMJ的发病机制提供可能。(本文来源于《重庆医科大学》期刊2018-05-01）
高岩,赵忠盖,刘飞[8]（2018）在《基于动态代谢通量分析的发酵过程多目标优化》一文中研究指出通过动态代谢通量分析方法建立发酵过程模型,提出了一种基于微观代谢信息的发酵过程多目标优化策略,该策略基于所建微观模型,根据动态特性将发酵过程分为菌体生长和产物合成两个阶段,进行特征分析并从微观通量层面分别设计优化目标与约束条件,采用多目标粒子群算法求得最优解。该方法用于青霉素发酵过程底物流加速率和p H的操作轨迹优化,仿真实验结果表明,采用基于微观通量的多目标优化策略能够提高产物终端浓度,表明优化策略的有效性。(本文来源于《化工学报》期刊2018年06期）
赵胡,唐开静,范小莹,吕伟健[9]（2017）在《‘黑油椿’香椿嫩芽高通量转录组测序及萜类代谢物质初步分析》一文中研究指出‘黑油椿’香椿(Toona sinensis ‘Heiyouchun’)嫩芽富含萜类物质,主要以倍半萜为主,其中去氢香橙烯、9,10–脱氢异长叶烯和β–石竹烯含量分别高达4440.71,1932.02和1799.89 ng·g~(-1)。采用高通量RNA-seq测序技术(Illumina HiSeq~(TM) 4000)对嫩芽进行转录组测序,获得高质量的碱基数据量为4.70 Gb,共计86870个转录本(Transcript),对这些转录本进一步组装,得到55850个单基因簇(Unigene),平均长度为1013 bp。序列同源性比对表明,39408个单基因簇与数据库中其他物种基因存在不同程度的同源性,功能注释匹配度最高的物种为甜橙(Citrus sinensis)。将全部单基因簇进行GO数据库比对,19704个单基因簇获得GO功能注释,分为细胞组分、分子功能和生物学过程等3大类群和54个亚类,其中与代谢过程、细胞组分、结合和催化活性及细胞过程相关的单基因簇占绝大多数。利用COG数据库进行比对,14186个单基因簇分布于25个功能区域。KEGG代谢通路数据库比对,有28400个单基因簇获得功能注释,分为6大类,21个亚类和135个代谢途径分支。通过对转录组数据进一步分析发现,参与‘黑油椿’嫩芽风味形成相关萜类合成的单基因簇共计467个,其中参与萜类骨架生物合成、单萜生物合成、倍半萜和叁萜类合成、二萜合成的单基因簇分别为226、71、86、84个,这为进一步研究香椿萜类物质生物合成相关的基因功能及解析其风味物质形成的分子机制提供了基础数据。(本文来源于《园艺学报》期刊2017年11期）
方卫东[10]（2017）在《高通量透析器在血液透析中的应用及对患者血脂代谢的影响分析》一文中研究指出目的分析高通量透析器在血液透析中的应用效果以及对患者血脂代谢的影响。方法选取2014年—2016年间我院进行血液透析的患者87例,随机分为治疗组43例与对照组44例,对照组患者采取常规透析方式进行血液透析,治疗组患者采取高通量透析器进行血液透析。对比分析2组患者透析后的甲状旁腺激素(PTH)、β_2微球蛋白(β_2-MG)、血红蛋白(Hb)等指标的差异,并对不良反应发生率与血脂代谢情况进行对比。结果经过1年时间的血液透析后,治疗组患者PTH等指标以及血脂代谢情况显着优于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05);治疗组患者的不良反应发生率为2.3%,对照组患者为9.1%,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论高通量透析器应用于血液透析中具有理想的临床效果,并明显改善患者的血脂代谢,临床应用价值高。(本文来源于《基层医学论坛》期刊2017年31期）
代谢通量分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的探究高通量血液透析治疗老年尿毒症患者钙磷代谢异常的临床疗效。方法选取选取2015年2月至2017年10月在我院进行尿毒症治疗的76例老年患者,将其随机分为两组,并分别进行常规血液透析(常规组)及高通量血液透析(高通量组),比较两组患者血钙、血磷、血肌酐(Scr)及及血甲状旁腺素(iPTH)水平,并观察其不良反应情况。结果治疗后,高通量组患者Scr及i PTH水平分别为(603.25±102.64)μmol/L及(310.25±127.26)mg/mL,显着低于治疗前及常规组(P <0.05),且高通量组血磷及血钙水平分别为(1.79±0.30)mmol/L及(2.48±0.29)mmol/L,其钙磷水平显着优于常规组(P <0.05),且两组均无不良反应发生。结论对老年尿毒症患者进行高通量血液透析,能够有效改善其钙磷代谢异常症状,同时降低患者血肌酐及血甲状旁腺素水平,对改善患者症状具有重要意义。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
代谢通量分析论文参考文献
[1].洪铭,李岩,张苏龙,李雪松,封彬.利用甜菜碱提升赖氨酸发酵及其代谢通量分析[J].发酵科技通讯.2019
[2].金实.高通量血液透析治疗老年尿毒症患者钙磷代谢异常的临床疗效分析[J].中国医药指南.2019
[3].向丽娟,汪圣毅,包楚阳,张焱,韩坤.胃癌脂代谢通路基因表达的转录组学高通量分析[J].安徽医科大学学报.2019
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[5].张皖君,蓝蔚青,段贤源,孙晓红,谢晶.基于高通量测序分析不同保鲜冰处理对鲈鱼菌群组成与代谢功能的影响[J].食品科学.2019
[6].高岩.基于动态代谢通量分析的发酵过程建模与优化[D].江南大学.2018
[7].段淼.高通量测序及代谢组学分析对母乳性黄疸患儿肠道菌群结构与功能的研究[D].重庆医科大学.2018
[8].高岩,赵忠盖,刘飞.基于动态代谢通量分析的发酵过程多目标优化[J].化工学报.2018
[9].赵胡,唐开静,范小莹,吕伟健.‘黑油椿’香椿嫩芽高通量转录组测序及萜类代谢物质初步分析[J].园艺学报.2017
[10].方卫东.高通量透析器在血液透析中的应用及对患者血脂代谢的影响分析[J].基层医学论坛.2017
论文知识图
