广西会仙湿地不同植物根际细菌群落结构及多样性研究

论文摘要

为了研究会仙喀斯特湿地不同植物根际细菌的群落结构和多样性以及环境因子对细菌群落的影响,以秋、冬两季植物根际土壤中提取的总DNA为模板,运用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术,对细菌16S rDNA基因V4+V5进行测序和分析。结果表明,共获得细菌有65门、160纲、219目、391科、677属和246种,不同植物根际土壤中占主导的细菌类群相同,主要包含变形菌门（Proteobacteria）、绿弯菌门（Chloroflexi）、酸杆菌门（Acidobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）等10个主要门类细菌,其中变形菌门为第一优势菌（平均含量42.4%）;优势菌纲有γ-、β-、δ-变形菌纲（Gammaproteobacteria、 Betaproteobacteria、 Deltaproteobacteria）、厌氧绳菌纲（Anaerolineae）、unidentifiedActinobacteria纲、全噬菌纲（Holophagae）,以β-变形菌纲为主（平均含量为13.5%）;优势菌属以地杆属（Geobacter）、芽孢杆菌属（Bacillus）、厌氧粘菌属（Anaeromyxobacter）为主,以芽孢杆菌属占比最高（占3.8%）。芦苇（Phragmites australis）多样性和丰富度最高,华克拉莎（Cladium chinense）和苦草（Vallisneria natans）次之,美人蕉（Canna indica）最低;冬季土壤细菌多样性高于秋季;美人蕉两季根际细菌群落差异最大,华克拉莎最小。环境因子对细菌群落结构有较大影响,其中土壤TOC、TN影响最显著。从植物根际微生物多样性和丰富度来看,在会仙湿地中增植芦苇和华克拉莎,对维持湿地系统中微生物多样性和湿地的保护有重要意义。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 样品采集和前处理
•   1.2 植物根际土壤DNA的提取和PCR扩增
•   1.3 文库及系统发育
•   1.4 数据分析
• 2 结果与分析
•   2.1 采样点水质及土壤的理化性质
•   2.2 群落结构分析
•     2.2.1 在门分类水平上
•     2.2.2 在属分类水平上
•   2.3 细菌群落多样性和环境因子相关性
•   2.4 细菌群落相似性和差异性分析
• 3 讨论
•   3.1 细菌群落结构
•   3.2 细菌群落结构多样性和环境因子
•   3.3 细菌群落结构相似性和差异性
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 凃月,李海翔,姜磊,董堃,王敦球

关键词: 会仙湿地,植物根际细菌,群落结构,多样性,高通量测序

来源: 生态环境学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 农业科技,工程科技Ⅰ辑,基础科学

专业: 生物学,农业基础科学,农艺学

单位: 桂林理工大学环境科学与工程学院

基金: 国家自然科学基金项目(51638006),广西科技计划项目(桂科AD18126018),广西“八桂学者”岗位专项经费

分类号: S154.3

DOI: 10.16258/j.cnki.1674-5906.2019.02.005

页码: 252-261

总页数: 10

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