健康蒙古族人肠道中乳酸菌和双歧杆菌多样性

论文摘要

【背景】越来越多的研究发现人类的诸多疾病与肠道菌群失衡有关。乳酸菌和双歧杆菌属于肠道中的有益菌,在不同人群肠道中的多样性不尽相同。【目的】在种水平上分析健康蒙古族人群肠道菌群中乳酸菌和双歧杆菌的多样性。【方法】以27名健康蒙古族志愿者为研究对象,其中14名来自中国内蒙古,13名来自蒙古国。首次采用乳酸菌和双歧杆菌的特异性引物扩增与PacBioSMRT三代测序技术相结合,在种水平上探讨志愿者肠道中乳酸菌和双歧杆菌的丰度和生物多样性,并进一步分析性别、BMI(Bodymassindex)值和地域对上述两者可能的影响,以及优势菌种之间的相关性。【结果】在种的水平上,27名志愿者肠道样品中共鉴定到68个乳酸菌和11个双歧杆菌,其中平均相对含量在1%以上的乳酸菌有8个,包括唾液链球菌(Streptococcus salivarius,36.41%)、瘤胃乳酸杆菌(Lactobacillus ruminis,17.94%)、德氏乳杆菌(Lactobacillus delbrueckii,3.11%)、罗氏乳杆菌(Lactobacillus rogosae,2.23%)、轻型链球菌(Streptococcus mitis,2.18%)、阴道乳杆菌(Lactobacillus vaginalis,2.02%)、魏斯氏乳杆菌(Weissella confusa,1.54%)和鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus,1.09%);双歧杆菌有5个,包括青春双歧杆菌(Bifidobacterium adolescentis,39.88%)、长双歧杆菌(Bifidobacterium longum,27.15%)、链状双歧杆菌(Bifidobacterium catenulatum,26.30%)、两歧双歧杆菌(B. bifidum,3.92%)和角双歧杆菌(Bifidobacterium angulatum,1.71%),聚类分析分为链状双歧杆菌和青春双歧杆菌2个主要的类群。分析结果显示:性别、BMI值和地域均未能显著影响志愿者肠道中乳酸菌和双歧杆菌的菌群结构(P>0.05),但男性和女性之间、中国内蒙古地区和外蒙古国的志愿者之间的个别乳酸菌菌种相对含量存在显著差异(P<0.05)。对样品中的优势乳酸菌和双歧杆菌进行Spearman相关性分析发现,乳酸菌和双歧杆菌彼此之间相关性较为密切,不同菌种间相关性不尽相同,与具体的菌种有关。【结论】首次采用PacBio SMRT测序技术在种的水平揭示了健康蒙古族人肠道中乳酸菌和双歧杆菌菌种多样性,为在种水平上解析肠道中乳酸菌和双歧杆菌多样性提供了新的研究思路和实施方案。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料和试剂
•     1.1.1 实验志愿者信息及样品收集
•     1.1.2 主要试剂和仪器
•   1.2 方法
•     1.2.1 样品采集
•     1.2.2 样品细菌宏基因组DNA提取
•     1.2.3 乳酸菌和双歧杆菌的基因组目的片段扩增、建库及测序
•     1.2.4 高质量序列的提取
•     1.2.5 数据处理
•     1.2.6 核酸序列登记号
• 2 结果与分析
•   2.1 乳酸菌组成与差异分析
•     2.1.1 志愿者肠道中乳酸菌组成
•     2.1.2 性别、BMI值和地域对志愿者肠道菌群的影响
•     2.1.3 志愿者肠道乳酸菌群落结构影响因素比较分析
•   2.2 志愿者肠道中双歧杆菌组成
•     2.2.1 志愿者肠道中双歧杆菌的组成分析
•     2.2.2 志愿者肠道双歧杆菌群落结构的影响因素比较分析
•   2.3 志愿者肠道中乳酸菌和双歧杆菌相关性分析
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 白梅,侯强川,孙志宏,王记成,郭帅,韩之皓,王月娇,孟和毕力格

关键词: 肠道菌群,乳酸菌,双歧杆菌,特异性引物,单分子实时测序技术

来源: 微生物学通报 2019年10期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学,基础医学

单位: 内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业农村部奶制品加工重点实验室

基金: 国家自然科学基金(31660450)~~

分类号: R37

DOI: 10.13344/j.microbiol.china.180884

页码: 2697-2709

总页数: 13

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