体细胞胚胎论文_申序,陈晓慧,徐小萍,霍雯,李晓斐

导读:本文包含了体细胞胚胎论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:体细胞,胚胎,陆地棉,发生,植株,胚轴,湿地松。

体细胞胚胎论文文献综述

申序,陈晓慧,徐小萍,霍雯,李晓斐^[1]（2019）在《龙眼体细胞胚胎发生早期SDG基因家族的全基因组鉴定与表达分析》一文中研究指出SET domain group(SDG)基因家族控制的组蛋白赖氨酸甲基化,是参与染色质功能调控和表观遗传调控基因表达的重要部分。为了解龙眼(DlSDG)家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法进行龙眼全基因组SDG家族成员的鉴定,并对蛋白质结构域、保守基序、基因结构、启动子顺势作用元件、进化树、相关基因的蛋白互作和体胚发生早期的基因表达情况进行预测和分析。结果显示,龙眼SDG家族基因包括32个成员,分为Suv、Ash、ATXR5/ATXR6、Trx、E(z)、SMYD和SETD7个亚家族,其中Suv亚族成员数量最多;外显子数量在1～22个不等,蛋白结构域保守,都含有一个SET结构域,DlSDG蛋白保守motif不同亚家族间差异较大;DlSDG启动子包含许多诸如低温、干旱和压力等非生物胁迫响应元件和激素响应元件;龙眼SDG成员在体胚发生早期均能不同程度表达,其中DlSUVR4b在EC和ICpEC阶段可能发挥着较为重要的作用;DlSUVH4可以和DNA甲基转移酶MET1发生互作。本研究表明,龙眼DlSDG 32个组蛋白赖氨酸甲基转移酶基因可能除了在生物钟的调节、植物发枝数量、根的生长发育、种子的萌发、花的发育和植株的形态建成等方面发挥重要功能外,也可能直接参与胁迫响应和体细胞胚胎发生的调控,并且还可能在参与DNA甲基化、染色质重塑的过程中形成体细胞胚胎发生的协作调控网络,表现其具有功能上的多样性、复杂性。(本文来源于《热带作物学报》期刊2019年10期）

李健英^[2]（2019）在《棉花响应烟粉虱胁迫的分子机制及棉花体细胞胚胎表观基因组学研究》一文中研究指出棉花作为全球叁大转基因作物之一,其纤维品质和产量受到农业害虫的影响。随着转Bt基因棉花推广,鳞翅目害虫棉铃虫、红铃虫得到控制,但其抗性逐渐丧失。烟粉虱(Bemisia tabaci)等刺吸式口器害虫对全球棉花生产造成了巨大的危害,但关于棉花如何感知和防御烟粉虱的信息是非常有限的。本研究以棉花与烟粉虱互作为模型,利用RNA-Seq和sRNA-Seq数据挖掘棉花内源的抗虫机制,构建棉花响应烟粉虱非编码RNA共表达调控网络。在全基因组水平上,利用全基因关联分析(GWAS)挖掘棉花抗性位点。为了更好地进行棉花遗传转化,拓展棉花遗传转化的受体范围,我们建立了连续再生驯化体系,获得了高转化效率棉花受体材料-Jin668,同时系统解析棉花再生和体细胞胚胎发生表观遗传调控机制。因此本研究分两大部分内容,分别探讨棉花内源的抗虫基因鉴定和功能分析以及棉花再生DNA甲基化图谱。主要结果如下:1.棉花-烟粉虱互作转录组分析利用RNA-Seq比较了烟粉虱强抗性品种(HR)和敏感性品种(ZS)在不同侵染时间点转录组差异。功能富集分析表明棉花对烟粉虱侵染的转录反应涉及编码蛋白激酶、转录因子、代谢物合成和植物激素信号的基因。结合GO和KEGG富集分析,HR和ZS感染烟粉虱后抗性基因的转录水平不同。RNA-Seq数据集构建的加权基因共表达网络显示WRKY40和铜转运蛋白是棉花响应烟粉虱侵染的枢纽基因。通过病毒诱导的基因沉默(VIGS)研究GhMPK3,抑制了MPK-WRKY-JA通路,增强烟粉虱的易感性。本研究为棉花防御烟粉虱响应提供了全面见解,并鉴定了几类控制韧皮部害虫的候选基因。2.棉花响应烟粉虱非编码RNA分子机制解析本研究我们构建了抗性材料(HR)和易感材料(ZS)在烟粉虱侵染下小RNA和降解组测序。总共鉴定出260个miRNA家族和241个靶标。定量PCR分析显示几种miRNA及其相应的靶标呈现出动态的时空表达模式。在RNA-Seq数据集鉴定了2,365个基因间区长链非编码RNA(lincRNAs)。进一步分析发现29个lincRNA转录本中产生17个miRNA前体。全基因组分析鉴定出85个同相位干扰小RNA(phasiRNA)位点,9个PHAS基因由6个miRNA触发,包括编码富含亮氨酸重复序列(LRR)的抗病蛋白,生长素响应因子(ARF)和MYB转录因子。通过构建模型和实验数据,我们探索和扩展了miR390-tasiARF在棉花响应烟粉虱侵染转录调控机制。VIGS沉默ARF8增加了生长素和茉莉酸,导致对烟粉虱侵染耐受性增加。通过对不同的非编码RNA进行综合分析,为植虫互作提供了有用的转录组数据资源。3.关联分析挖掘棉花抗虫位点本研究收集了269份陆地棉材料组成的自然群体,鉴定了2.88百万SNPs并进行群体进化树,群体结构,PCA分析和连锁不平衡分析。269份棉花材料在叁个环境中进行棉花四个抗虫指数调查,叶片危害率(LDR),整体植株危害率(PDR),感抗等级(SRL)以及盲蝽蟓指数(MI)。我们在叁个环境下鉴定了7个LDR,PDR和SRL显着候选位点,其中有一个位点共定位。结合LD分析,整合转录组数据,筛选了一个铜转运子CRC1候选基因。4.多组学数据揭示棉花再生和体细胞胚发育表观基因组学基础本研究通过连续再生驯化(SRA)策略,从母体自交系Y668中选育出具有高再生能力的优质棉花Jin668。我们构建了体细胞胚胎发育过程中的非胚性愈伤组织(NEC),胚性愈伤组织(EC),体细胞胚(SE)以及再生后代植株的叶片全基因组单碱基分辨率甲基化图谱。结果表明,Jin668显示出低DNA甲基化,再生后代中整体甲基化呈下降趋势。在NEC到EC中DNA甲基化上升由RNA介导的DNA甲基化(RdDM)和H3K9me2途径协同调控。在EC到SE中DNA甲基化下降,24-nt siRNA和H3K9me2丰度不变,进一步分析发现DNA去甲基化酶ROS1和DME显着上调,该过程可能依赖于DNA去甲基化途径。整合RNA-Seq和差异甲基化区域(DMR),体细胞胚胎发生过程中低CHH-DMR激活了生长素和WUSCHEL相关基因表达。在NEC中添加DNA甲基化抑制剂增加了胚胎的数量。我们多组学数据为植物组织培养和再生后代植物中DNA甲基化的动态提供了新的见解。该研究还表明诱导的低甲基化可以更好的促进植物再生能力并优化母本遗传栽培品种。(本文来源于《华中农业大学》期刊2019-06-01）

娜苏勒玛^[3]（2019）在《沙地云杉体细胞胚胎不同发育时期生理生化特性研究》一文中研究指出沙地云杉(Picea mongolica)是稀有珍贵树种,是我国特有新种。因自然因素和人为因素导致沙地云杉的资源越来越少,生态系统严重受损。利用胚性愈伤组织可以有效地保护沙地云杉的种质资源。体细胞胚胎发生是植物细胞全能性的表达,是一种快速繁殖的新途径。体细胞胚胎发生的机制、调控和胚性愈伤的维持是体细胞胚胎发生的重要研究课题。以成熟胚为外植体诱导的不同发育阶段的沙地云杉胚性愈伤组织及体细胞胚胎发生为材料,分别从形态学、组织细胞学、可溶性蛋白含量、可溶性糖含量、可溶性淀粉含量及POD活性、SOD活性和CAT活性等多方面对沙地云杉体细胞胚胎发生的机理进行了研究。研究结果如下:(1)根据沙地云杉体细胞胚胎的发育过程和形态特征,将其分为:分化5～15 d时为球形胚发育时期,分化15～25 d时为心形胚发育时期,分化25～35 d时为子叶胚早期发育时期,分化35 d之后进入子叶胚成熟期,其中35～45 d时为子叶胚中期,45～55 d时为子叶胚后期。(2)通过沙地云杉体细胞胚胎组织结构表明,胚性愈伤组织由胚性细胞和分裂产生的胚性细胞团组成。胚性细胞团细胞核较大、细胞质较厚。体细胞胚胎发育经过原胚、球形胚、心形胚、子叶胚四个阶段,与形态学观察结果一致。(3)沙地云杉体细胞胚胎发生过程中可溶性蛋白含量的变化反映了不同发育阶段体细胞胚胎发生的生理生化和代谢特异性,与不同发育阶段体细胞胚胎发生的生理状态密切相关,并且对胚性细胞的分化和体细胞胚胎的发育、萌发提供了物质和能量基础。(4)可溶性糖和可溶性淀粉含量的变化与胚性细胞的分化能力密切相关,也反映了沙地云杉体细胞胚胎在不同发育阶段的生理活性,对体细胞胚胎的分化和发育提供了物质和能量基础,并且有着重要的促进作用。(5)沙地云杉体细胞胚胎发育过程中,POD、SOD、CAT等叁种酶相互协同作用,对体细胞内氧代谢所产生的H2O2进行分解,使胚性细胞内的活性氧的产生和清除达到平衡状态,并调控和促进体细胞胚胎的分化和发育。(本文来源于《内蒙古农业大学》期刊2019-06-01）

吴高殷,韦小丽,王晓,刘盈盈,陈胜群^[4]（2019）在《林木体细胞胚胎发生机理研究进展》一文中研究指出体细胞胚胎发生技术能够实现优良林木品种的规模化繁育及优良性状保留,为林木扩繁、种质资源保存、遗传改良和机理研究等提供材料。但其仍存在诱导率低、褐化现象严重、愈伤分化困难和再生植株生长较弱等问题。文中从生理生化学、细胞生物学和分子生物学3个方面阐述体胚发生机理,包括内源激素含量、细胞程序性死亡和体胚发生相关基因等,并在当前研究基础上对未来林木体胚发生深入研究进行展望,旨在为建立高效林木体胚发生体系及其机理研究提供参考。(本文来源于《世界林业研究》期刊2019年05期）

魏喜,王倩华,葛晓阳,陈艳丽,丁颜朋^[5]（2019）在《不同红蓝配比的光质对棉花体细胞胚胎发生和植株再生的影响》一文中研究指出【目的】设置不同的光质组合,明确不同光质对棉花体细胞胚胎发生的影响,为提高棉花体细胞胚胎发生能力和加快棉花转基因过程提供依据。【方法】分别设置不同红蓝配比的光质组合B﹕R(蓝﹕红)=1﹕1、B﹕R(蓝﹕红)=3﹕1、B﹕R(蓝﹕红)=1﹕3和DL(日光灯),将CCRI12(中棉所12)棉花下胚轴切段依次在愈伤诱导培养基上(callus induction medium,CIM)、胚性愈伤组织诱导培养基上(embryogenic callus differentiation medium,ECDM)、体细胞胚诱导培养基上(embryoid induction medium,EIM)和再生植株诱导培养基(regenerated-plantlet induced medium,RIM)上培养。统计在4种不同光质配比下,体细胞胚胎发生各个阶段对应的指标,包括愈伤增殖率(callus proliferation rate,CPR)、愈伤增殖量、胚性愈伤分化率、体细胞胚数量、生根率、下胚轴数量、再生棉花植株数量、叶绿素浓度等。【结果】与B﹕R=1﹕3和DL光质组合相比,B﹕R=1﹕1和B﹕R=3﹕1的光质组合均显着促进了愈伤的增殖率,但抑制体细胞胚长出下胚轴;与B﹕R=1﹕1和B﹕R=3﹕1相比,B﹕R=1﹕3和DL光质组合均促进胚性愈伤分化和诱导体细胞胚的产生,在诱导下胚轴生根方面,B﹕R=1﹕1组合生根率明显高于其他3种处理;B﹕R=1﹕3和B﹕R=1﹕1处理后下胚轴成苗数、植株高度和叶绿素浓度明显高于B﹕R=3﹕1和DL光质组合,B﹕R=1﹕3的促进效果最明显。【结论】明确了不同光质组合在体细胞胚胎发生各个阶段的调控作用,在体细胞胚胎发生各个阶段可以选择性地应用最优的光质组合。其中红蓝配比为B﹕R=1﹕3的光质组合在整体上能促进棉花体细胞胚胎的发生。(本文来源于《中国农业科学》期刊2019年06期）

苏南^[6]（2019）在《基于体细胞胚胎发生的甜瓜转基因体系构建》一文中研究指出转基因技术是植物基因功能研究的最有效技术之一,也是未来作物精准育种的候选途径。但是由于再生体系不成熟等因素,转基因技术在大多数蔬菜作物中应用还存在障碍。甜瓜是我国乃至全世界的重要蔬菜作物。传统的甜瓜转基因体系存在着再生效率低、嵌合体概率高等缺陷。本研究从建立高效甜瓜体细胞胚途径再生体系入手,研究了以不同基因型甜瓜种子切块为外植体,诱导愈伤组织从而萌发胚胎,最后再生为完整植株的再生体系。并在此基础上,建立了基于农杆菌介导的甜瓜转基因技术体系。取得主要成果如下:1、建立了基于体细胞胚胎发生的甜瓜再生体系:通过筛选激素种类和激素浓度配比,以及对十二种甜瓜基因型进行体胚的诱导,发现粗皮甜瓜材料'Vedrantais'在激素组合2,4-D和6-BA中诱导体胚效率最高,其余几种基因型甜瓜能够诱导愈伤组织形成,且愈伤组织不断膨大,但是体细胞胚产生概率极低。此外,诱导体细胞胚形成最佳培养基配方(1L)为:MS + 30g蔗糖+ 2 mg/L 2,4-D+ 0.1mg/L6-BA,液体培养7-8周,再生固体培养基:MS + 30g蔗糖;生根培养基配方:MS+15g蔗糖。2、利用二元质粒法构建了基于pBBRacdS的超级农杆菌:为提高根癌农杆菌介导的甜瓜转化效率,导入pBBRacdS质粒载体,实现在农杆菌工程菌中表现ACC脱氨酶活性,可降低农杆菌侵染后外植体或愈伤组织细胞中乙烯含量,提高再生效率。此后,通过二元质粒法将目标基因CmWRKY27过表达载体经历两次电转导入含有pBBRacdS的根癌农杆菌,对甜瓜进行侵染。3、获得了甜瓜转基因植株:将种子切块预培养两天,用含双载体的农杆菌菌液进行侵染后共培养,液体选择培养基:EI液体培养基+5mg/LHygromycin+ 25 mg/L Timentin;固体选择培养基:MS + 30g 蔗糖 +15 mg/L Hygromycin +100mg/LTimentin。结果显示,转化体系的转化率为0.18%。该体系筛选效率高,有效节省后续鉴定工作量。本实验建立了基于体细胞胚途径的甜瓜再生及转基因体系,提高再生效率并降低嵌合体概率。有助于甜瓜的功能基因研究,为将来的甜瓜分子设计育种提供重要技术储备,并为其他葫芦科作物提供借鉴。(本文来源于《浙江大学》期刊2019-01-01）

胡继文,郭文冰,邓乐平,钟岁英,王为民^[7]（2019）在《湿地松及其杂种的体细胞胚胎发生与植株再生》一文中研究指出【目的】明确适合湿地松Pinus elliottii及其杂交种的体细胞胚胎发生条件,建立体胚成熟萌发的技术。【方法】以2016年6月采集的2个湿地松家系(EE1,EE2)、2个湿地松杂交种家系(EC,EH)的未成熟合子胚(含胚乳)为材料,从诱导、增殖、成熟到萌发配制3个系列培养基,比较外植体采集时间、家系、基本培养基对胚性愈伤组织诱导的影响。用显微镜进行胚性愈伤组织鉴别后,进一步挑选诱导形成的胚性愈伤组织进行增殖、成熟、萌发,最终获得再生植株。【结果】湿地松及其杂交种合子胚的发育进程可划分为8个阶段,阶段Ⅱ、Ⅲ为未成熟胚,适合体胚发生,EC最早出现阶段Ⅲ合子胚。外植体诱导产生具有胚性胚柄团(ESM)结构的胚性愈伤组织,可进一步增殖。诱导培养基对愈伤组织形成及胚性愈伤组织占比具有较大影响,3种诱导培养基(T1、T2和T3)产生愈伤组织效率最高的为T1培养基(49.0%),胚性愈伤组织所占愈伤组织的比例最高为T2培养基(22.4%)。培养基配方的诱导率存在基因型间的差异,T1培养基整体诱导率低;T2培养基对家系EE1诱导率最高,为5.82%;T3培养基对参试材料均能诱导成功,且平均诱导率最高,为3.75%。随采样时间延后,家系EE1、EH的体胚诱导率逐渐增加,家系EE2、EC的体胚诱导率则随采样时间延后逐渐降低。体胚诱导率与合子发育阶段结果基本一致,阶段Ⅲ合子胚均出现较晚,前期诱导率低。胚性愈伤组织继代24次以后,胚活性逐渐降低。成熟培养基T1S和T3S可完成胚的成熟,平均每克成熟培养基分别成熟23.3和15.9个子叶胚,萌发率为32.1%,移栽保存率为47.8%。【结论】诱导培养基T3对参试家系均能诱导成功,T3具有较广泛适用性,各家系在阶段Ⅲ合子胚出现时表现出较大的诱导率,阶段Ⅲ合子胚可能为体细胞胚发生的最佳诱导阶段。建立了湿地松及其杂种体细胞胚发生方法并形成了再生植株。(本文来源于《华南农业大学学报》期刊2019年01期）

葛书娅,沈秋平,何积明,吕尊富,郑海彪^[8]（2018）在《陆地棉新陆早45号体细胞胚胎发生及再生体系的建立》一文中研究指出【目的】拓展胚胎发生再生的陆地棉基因型,为棉花遗传转化提供优良受体材料。【方法】以新疆推广的陆地棉品种新陆早45号下胚轴为外植体,设计了6种不同激素组合的培养基进行初生愈伤组织诱导,建立其胚胎发生的再生体系。【结果】新陆早45号下胚轴在激素组合C1 [0.1 mg·L~(-1) 2,4-D(二氯苯氧乙酸)+0.1 mg·L~(-1) KT(呋喃氨基嘌呤)]和C5 [0.1 mg·L~(-1) 2,4-D+0.5 mg·L~(-1) IBA(吲哚-3-丁酸)+0.1 mg·L~(-1) KT]均可诱导出淡黄色疏松状的初生愈伤组织。将增殖后的愈伤组织培养在去掉激素、 KNO_3加倍的MS3培养基上可诱导出胚性愈伤组织,实现胚胎发生和植株再生,初生愈伤组织诱导率和分化率最高分别可达到92.2%和40.3%。研究发现C1和C5激素组合的新陆早45号下胚轴出愈率没有显着差异,但C1诱导愈伤组织的胚胎发生率明显优于C5。【结论】成功建立了陆地棉新陆早45号的胚胎发生再生体系,可为下一步通过农杆菌介导转化新陆早45号提供技术支持。(本文来源于《棉花学报》期刊2018年06期）

邹玉霞,马云桐,申婵,钟芙蓉,裴瑾^[9]（2018）在《瘤毛獐牙菜体细胞胚胎发生过程中生理生化特性研究》一文中研究指出目的从生理生化层面探讨瘤毛獐牙菜体细胞胚胎发生过程中生理生化指标与愈伤组织生长发育的关系,并确定愈伤组织最佳继代时间。方法自转接分化培养基起,每隔7 d测定愈伤组织内可溶性糖、可溶性蛋白含量;超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、多酚氧化酶(PPO)活性。结果瘤毛獐牙菜体细胞胚胎发生过程中,愈伤组织内可溶性糖、可溶性蛋白含量在35 d左右达到最高值; SOD、POD活性整体呈上升趋势,PPO在14-35 d间活性相对较低。结论根据生理生化指标在体细胞胚胎发生过程中呈现出的变化趋势可推断愈伤组织的生长发育情况;愈伤组织最佳继代时间为28-35 d。(本文来源于《陕西中医药大学学报》期刊2018年06期）

郭生虎,陈虞超,朱永兴,关雅静^[10]（2018）在《濒危中药材桃儿七体细胞胚胎发生及植株再生研究》一文中研究指出桃儿七(Sinopodophyllum emodi (Wall.) Ying)为小檗科桃儿七属多年生草本植物,是我国珍稀濒危中药材,其次生代谢产物鬼臼毒素具有较强的抗癌活性,自然资源濒临灭绝,本研究利用桃儿七体细胞胚发生途径建立桃儿七再生种苗培养体系,为桃儿七种质资源保存和种苗快速繁殖奠定基础。论文以桃儿七种子胚为材料,经无菌培养获得无菌苗,以无菌苗的下胚轴和子叶为外植体进行愈伤组织诱导,获得胚性愈伤组织,经进一步诱导分化获得体细胞胚,进而分化得到体细胞胚再生苗,建立了桃儿七体细胞胚再生种苗培养技术体系。研究结果表明:最佳愈伤组织诱导培养基为Ms+1.0mg/L 6-BA+0.2mg/L NAA+0.1mg/L GA3,诱导率达79.3%,最佳胚性愈伤组织转化和增殖的培养基为Ms+1.0mg/L 6-BA+0.1mg/L NAA+0.1 mg/L GA3+300 mg/L CH+40.0g/L蔗糖,体细胞胚萌发及丛生芽分化培养基Ms+6-BA0.5mg/L+GA3 0.1mg/L+NAA0.01mg/L,再生苗生根培养基为1/2Ms+IBA0.5 mg/L+IAA1.0 mg/L,生根率达51.7%,本研究为桃儿七通过体细胞胚胎途径获得再生种苗奠定基础,也为进一步研究桃儿七体细胞胚胎发生机理提供研究材料。(本文来源于《中国植物学会八十五周年学术年会论文摘要汇编（1993-2018）》期刊2018-10-10）

体细胞胚胎论文开题报告

（1）论文研究背景及目的

此处内容要求：

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例：

棉花作为全球叁大转基因作物之一,其纤维品质和产量受到农业害虫的影响。随着转Bt基因棉花推广,鳞翅目害虫棉铃虫、红铃虫得到控制,但其抗性逐渐丧失。烟粉虱(Bemisia tabaci)等刺吸式口器害虫对全球棉花生产造成了巨大的危害,但关于棉花如何感知和防御烟粉虱的信息是非常有限的。本研究以棉花与烟粉虱互作为模型,利用RNA-Seq和sRNA-Seq数据挖掘棉花内源的抗虫机制,构建棉花响应烟粉虱非编码RNA共表达调控网络。在全基因组水平上,利用全基因关联分析(GWAS)挖掘棉花抗性位点。为了更好地进行棉花遗传转化,拓展棉花遗传转化的受体范围,我们建立了连续再生驯化体系,获得了高转化效率棉花受体材料-Jin668,同时系统解析棉花再生和体细胞胚胎发生表观遗传调控机制。因此本研究分两大部分内容,分别探讨棉花内源的抗虫基因鉴定和功能分析以及棉花再生DNA甲基化图谱。主要结果如下:1.棉花-烟粉虱互作转录组分析利用RNA-Seq比较了烟粉虱强抗性品种(HR)和敏感性品种(ZS)在不同侵染时间点转录组差异。功能富集分析表明棉花对烟粉虱侵染的转录反应涉及编码蛋白激酶、转录因子、代谢物合成和植物激素信号的基因。结合GO和KEGG富集分析,HR和ZS感染烟粉虱后抗性基因的转录水平不同。RNA-Seq数据集构建的加权基因共表达网络显示WRKY40和铜转运蛋白是棉花响应烟粉虱侵染的枢纽基因。通过病毒诱导的基因沉默(VIGS)研究GhMPK3,抑制了MPK-WRKY-JA通路,增强烟粉虱的易感性。本研究为棉花防御烟粉虱响应提供了全面见解,并鉴定了几类控制韧皮部害虫的候选基因。2.棉花响应烟粉虱非编码RNA分子机制解析本研究我们构建了抗性材料(HR)和易感材料(ZS)在烟粉虱侵染下小RNA和降解组测序。总共鉴定出260个miRNA家族和241个靶标。定量PCR分析显示几种miRNA及其相应的靶标呈现出动态的时空表达模式。在RNA-Seq数据集鉴定了2,365个基因间区长链非编码RNA(lincRNAs)。进一步分析发现29个lincRNA转录本中产生17个miRNA前体。全基因组分析鉴定出85个同相位干扰小RNA(phasiRNA)位点,9个PHAS基因由6个miRNA触发,包括编码富含亮氨酸重复序列(LRR)的抗病蛋白,生长素响应因子(ARF)和MYB转录因子。通过构建模型和实验数据,我们探索和扩展了miR390-tasiARF在棉花响应烟粉虱侵染转录调控机制。VIGS沉默ARF8增加了生长素和茉莉酸,导致对烟粉虱侵染耐受性增加。通过对不同的非编码RNA进行综合分析,为植虫互作提供了有用的转录组数据资源。3.关联分析挖掘棉花抗虫位点本研究收集了269份陆地棉材料组成的自然群体,鉴定了2.88百万SNPs并进行群体进化树,群体结构,PCA分析和连锁不平衡分析。269份棉花材料在叁个环境中进行棉花四个抗虫指数调查,叶片危害率(LDR),整体植株危害率(PDR),感抗等级(SRL)以及盲蝽蟓指数(MI)。我们在叁个环境下鉴定了7个LDR,PDR和SRL显着候选位点,其中有一个位点共定位。结合LD分析,整合转录组数据,筛选了一个铜转运子CRC1候选基因。4.多组学数据揭示棉花再生和体细胞胚发育表观基因组学基础本研究通过连续再生驯化(SRA)策略,从母体自交系Y668中选育出具有高再生能力的优质棉花Jin668。我们构建了体细胞胚胎发育过程中的非胚性愈伤组织(NEC),胚性愈伤组织(EC),体细胞胚(SE)以及再生后代植株的叶片全基因组单碱基分辨率甲基化图谱。结果表明,Jin668显示出低DNA甲基化,再生后代中整体甲基化呈下降趋势。在NEC到EC中DNA甲基化上升由RNA介导的DNA甲基化(RdDM)和H3K9me2途径协同调控。在EC到SE中DNA甲基化下降,24-nt siRNA和H3K9me2丰度不变,进一步分析发现DNA去甲基化酶ROS1和DME显着上调,该过程可能依赖于DNA去甲基化途径。整合RNA-Seq和差异甲基化区域(DMR),体细胞胚胎发生过程中低CHH-DMR激活了生长素和WUSCHEL相关基因表达。在NEC中添加DNA甲基化抑制剂增加了胚胎的数量。我们多组学数据为植物组织培养和再生后代植物中DNA甲基化的动态提供了新的见解。该研究还表明诱导的低甲基化可以更好的促进植物再生能力并优化母本遗传栽培品种。

（2）本文研究方法

调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

体细胞胚胎论文参考文献

[1].申序,陈晓慧,徐小萍,霍雯,李晓斐.龙眼体细胞胚胎发生早期SDG基因家族的全基因组鉴定与表达分析[J].热带作物学报.2019

[2].李健英.棉花响应烟粉虱胁迫的分子机制及棉花体细胞胚胎表观基因组学研究[D].华中农业大学.2019

[3].娜苏勒玛.沙地云杉体细胞胚胎不同发育时期生理生化特性研究[D].内蒙古农业大学.2019

[4].吴高殷,韦小丽,王晓,刘盈盈,陈胜群.林木体细胞胚胎发生机理研究进展[J].世界林业研究.2019

[5].魏喜,王倩华,葛晓阳,陈艳丽,丁颜朋.不同红蓝配比的光质对棉花体细胞胚胎发生和植株再生的影响[J].中国农业科学.2019

[6].苏南.基于体细胞胚胎发生的甜瓜转基因体系构建[D].浙江大学.2019

[7].胡继文,郭文冰,邓乐平,钟岁英,王为民.湿地松及其杂种的体细胞胚胎发生与植株再生[J].华南农业大学学报.2019

[8].葛书娅,沈秋平,何积明,吕尊富,郑海彪.陆地棉新陆早45号体细胞胚胎发生及再生体系的建立[J].棉花学报.2018

[9].邹玉霞,马云桐,申婵,钟芙蓉,裴瑾.瘤毛獐牙菜体细胞胚胎发生过程中生理生化特性研究[J].陕西中医药大学学报.2018

[10].郭生虎,陈虞超,朱永兴,关雅静.濒危中药材桃儿七体细胞胚胎发生及植株再生研究[C].中国植物学会八十五周年学术年会论文摘要汇编（1993-2018）.2018

论文知识图

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