基于高通量测序研究厚朴“发汗”过程中微生物群落多样性及其特征

论文摘要

厚朴为常用中药,"发汗"是厚朴药材初加工的关键步骤,也是药材质量上乘的重要体现。为探究厚朴药材"发汗"过程中的微生物群落变化特征及其在整个"发汗"过程中的变化规律,该研究采用高通量测序技术对厚朴"发汗"过程中的微生物多样性进行研究。13个送试样品共检出334个真菌菌属,674个细菌菌属。"发汗"初期,优势菌属不很明显。"发汗"中期优势真菌为假丝酵母属Candida(45. 01%～71. 93%),"发汗"后期以曲霉属Aspergillus(45. 83%～95. 51%)占绝对优势;细菌在"发汗"中后期优势菌属主要为肠杆菌属Enterobacter和克雷伯菌属Klebsiella,二者此消彼长,总比例≥56. 05%。同时,芽胞杆菌属Bacillus、异常球菌属Deinococcus、鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas、薄层菌属Hymenobacter、Jatrophihabitans等亦为优势菌属。首次开展厚朴"发汗"过程中微生物多样性研究,发现"发汗"后其"气味浓厚,内表面变为棕褐色"这一性状特征的形成可能与曲霉属Aspergillus和假丝酵母菌属Candida等微生物群落代谢有关,为进一步研究"发汗"过程中微生物对厚朴药材质量的影响提供理论依据。

论文目录

• 1 材料
• 2 方法
•   2.1 样品DNA的提取、PCR扩增和Miseq测序
•   2.2 PCR扩增和Miseq测序
•   2.3 数据分析
• 3 结果与分析
•   3.1 测序数据统计及alpha多样性统计
•   3.2 蒸后“发汗”过程中厚朴样品物种Beta多样性分析
•   3.3 微生物群落结构组成及其动态变化
•     3.3.1“发汗”过程中的厚朴样本微生物门水平群落组成特征
•     3.3.2“发汗”过程中的厚朴样本微生物属水平群落组成特征
•   3.4“发汗”过程中的厚朴样本微生物属水平相对丰度分布
• 4 讨论与结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 魏担,吴清华,刘钰萍,唐雪梅,任超翔,陈江,裴瑾

关键词: 厚朴,发汗,微生物群落,多样性分析,高通量测序

来源: 中国中药杂志 2019年24期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 中药学

单位: 中药资源系统研究与开发利用国家重点实验室培育基地,成都中医药大学药学院

基金: 国家自然科学基金青年基金项目(81703654),成都中医药大学校基金项目(ZRQN1774)

分类号: R284

DOI: 10.19540/j.cnki.cjcmm.20190916.305

页码: 5405-5412

总页数: 8

文件大小: 396K

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