基因组寡核苷酸芯片论文-范俊梅,李娜,刘忠宇,马慜悦,王辉

基因组寡核苷酸芯片论文-范俊梅,李娜,刘忠宇,马慜悦,王辉

导读:本文包含了基因组寡核苷酸芯片论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:植入前诊断,染色体异常,aCGH,SNParray

基因组寡核苷酸芯片论文文献综述

范俊梅,李娜,刘忠宇,马慜悦,王辉[1](2014)在《应用基因组杂交、单核苷酸芯片及二代测序技术开展植入前染色体异常诊断》一文中研究指出流产是导致妊娠失败的最常见原因,其中因染色体异常导致的流产占早期自然流产的一半。胚胎染色体异常一部分是由于胚胎发育异常,一部分与遗传相关。我国普通人群中染色体异常的发生率为0.5%~1.0%,而在有不良孕产史的患者中发生率则高达2%~10%[1]。随着辅助生殖技术的发展,体外受精-胚胎移植(IVF-ET)的临床妊娠率有了显着提高,但胚胎着床率却维持在20%左右,其中染色体异常是造成人类胚胎低着床率和早期妊(本文来源于《中国实用妇科与产科杂志》期刊2014年07期)

干小强,丁学华,卢亦成,胡国汉,陈菊祥[2](2010)在《利用全基因组寡核苷酸芯片初步筛选无功能垂体腺瘤相关基因》一文中研究指出目的探讨人无功能垂体腺瘤发生、发展中相关基因的表达与功能。方法应用人全基因组寡核苷酸芯片HG-U133Plus2.0分别检测4例无功能垂体腺瘤组织(2例促性腺激素腺瘤、2例裸细胞激素腺瘤)和正常垂体组织的基因表达谱,并对差异表达基因进行筛选和生物信息学分析。同时随机选择EDG3基因予以实时荧光定量PCR验证。结果与正常垂体组织相比,促性腺激素腺瘤中上调基因223条,下调基因678条;而裸细胞腺瘤中上调基因156条,下调基因665条;两者共同表达基因中上调基因50条,下调基因136条。共同差异表达基因的功能主要涉及分子结合、凋亡或肿瘤相关、代谢、信号传导、细胞周期、物质运输等多个生物过程。结论基因芯片技术有助于在分子水平上了解垂体腺瘤发病机制。(本文来源于《中国微侵袭神经外科杂志》期刊2010年08期)

江华,沈晓莹,宋振云,胡晔东,徐文[3](2009)在《全基因组寡核苷酸芯片筛选与胰腺癌相关的基因信号通路》一文中研究指出背景:胰腺癌的发病率有所上升,且缺乏诊断标记物和治疗措施。近年研究表明,基因信号通路在胰腺癌发病中起重要作用。目的:探讨与胰腺癌相关的基因信号通路。方法:6例经病理证实的胰腺癌及其癌旁组织纳入研究。抽提总RNA,合成两种组织探针,探针荧光标记和纯化后,与Agilent全基因组寡核苷酸芯片进行杂交,对差异基因进行生物信息学分析,筛选与胰腺癌相关的信号通路。结果:差异基因的KEGG Pathway分析发现肾细胞癌通路分类对胰腺癌最具生物学意义,其中TGFβ3、EPAS1、PIK3R3、EGLN1、PGF、ETS1、VEGFB、CREBBP和PIK3R5九个关键基因的表达有显着差异(P<0.05)。结论:胰腺癌发病与肾细胞癌通路激活密切相关,可能为胰腺癌的研究提供新的思路。(本文来源于《胃肠病学》期刊2009年06期)

肖非,黄加权,余海静,习东,严伟明[4](2006)在《应用人类全基因组寡核苷酸芯片筛查自身免疫性肝炎相关基因》一文中研究指出为研究自身免疫性肝炎发病过程中基因表达改变与免疫反应的关系,我们采用人类全基因寡核菅酸芯片筛查自身免疫性肝炎差异表达基因,并对结果进行聚类分析,筛选出与疾病关系最密切的基因功能群,为进一步阐明发病机制,寻找致病基因提供参考。(本文来源于《中华肝脏病杂志》期刊2006年12期)

肖耀军[5](2005)在《应用全人类基因组寡核苷酸芯片检测肾透明细胞癌与癌旁肾组织的基因表达谱差异性研究》一文中研究指出研究背景:肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)是最常见的一种肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC),占肾癌70~80%,其形态多不规则,切面常呈黄色,肿瘤多为实性,以单侧单发病灶多见。cc-RCC同其它类型的RCC一样,对放、化疗及激素治疗均不敏感。目前除对早期RCC施行手术治疗疗效较好外,无其它有效治疗办法。因其起病隐匿,不易早期诊断,死亡率高。而人们对其发病机制不甚了解,是目前缺乏有效治疗方法的主要原因。近年来,国内外针对其展开了积极研究,基因芯片的出现更为其提供了有力的工具。基因芯片技术是依据DNA双链碱基互补配对、变性和复性的原理,以大量已知序列的寡核苷酸、cDNA或基因片段作探针并固定在支持物表面制成芯片;再以双色荧光标记待测靶基因,与芯片探针进行杂交,扫描芯片分析得出待测样品的基因表达信息。基因芯片技术能在转录水平高通量、大规模、平行地处理大量基因信息,尤其是近来全基因组基因芯片技术的出现,使全面、综合分析某些生命现象成为可能。我们欲借助单位现有的临床优势,偿试采用目前较先进的60~70mer长链寡核苷酸做探针的基因芯片,检测cc-RCC和癌旁正常肾组织的基因表达谱差异,对cc-RCC的发病机制进行探讨性研究。 目的: 1、应用较先进的长链寡核苷酸基因芯片,检测cc-RCC的基因表达谱,试图发现新的cc-RCC相关基因;(本文来源于《第一军医大学》期刊2005-04-01)

孙薏[6](2003)在《利用寡聚核苷酸芯片进行急性白血病疾病基因组检测及基因分型的初步研究》一文中研究指出白血病是一种复杂的、以庞杂的基因水平异常为特征的疾病。有关白血病特异性基因的研究有助于我们了解该病的复杂机制及其多态性。现有的诊断和预后分类法仍不足以反映白血病的异质性。新近有关人类基因组研究以及高通量的基因芯片技术的发展,使我们有可能最终揭示恶性疾病的复杂的分子机制。疾病基因组分析能够揭示本病复杂的转录水平异常所导致的基本的生物学改变。例如,特异性刺激反应产生的细胞信号转导以及细胞增殖、分化及凋亡改变。自从1999年将基因芯片技术应用于急性白血病分型以来,越来越多的资料提示,虽然白血病发生发展过程中累积异常基因群可能十分庞大,但是起关键的,核心作用的基因数量有限。从庞杂的基因群体中筛选影响白血病发生发展的主要基因,有的放矢地进行药物筛选和设计,将有可能得到事半功倍的效果。基因芯片技术作为一种高通量、快速、平行的基因表达信息监测和分析技术,对于研究白血病发病机理及基因分型是一个很好的方法。 本研究利用寡聚核苷酸基因芯片技术,初步筛选和鉴定出急性白血病相关基因,并对于急性白血病的基因分型诊断进行了有益的探讨。白血病相关基因的筛选基于以下两种设计比照:1.急性白血病患者与其有高度遗传关联的兄弟姐妹供者的差异比照;2.AML与ALL基因表达谱的差异比照。1、应用寡聚核苷酸芯片检测白血病与其同胞供者的白血病相关基因表达差异 目的 应用寡聚核苷酸基因表达谱芯片研究9对白血病患者/同胞供受者对之间的基因表达谱差异以识别主要的疾病相关基因。方法 将163条白血病/肿瘤发病相关基因组群列入芯片设计;合成寡聚核苷酸探针,用点样仪点片制成基因芯片。提取病初白血病患者及其相对应的健康同胞供者经G-CSF动员后经CS-3000细胞分离机采集的浓集的9份外周血造血干细胞总RNA,分别逆转录并进行寡聚核苷酸芯片杂交。结果 与其相应的正常供者配对比较,发现4中文摘要 例外L患者中存在6条显着差异表达基因:其中上调表达基因5条仅已打卜1, T-cellleukemia/lylllphoma IA,Cbp/p300,0P18),下调表达1条(he。atopoetic 9””上的g好闲nc。repr。tei巾;5例见卜M和巩卜MS患者中亦存在7条显着 差异表达基因:上调表达 6条(STATSB fig。ld p62 for th6 L。k SHZ,CST3, LTC4S,。veloid leukemia factor 2,enb72),下调表达1条(CCRS)。结论 选 择有高度遗传关联的兄弟姐妹供受者对作为差异研究比照对象,利用寡聚核着 酸基因芯片技术进行疾病基因的筛查,筛查出了13条基因表达上调或下调的 主要异常基因;进一步确认了上述基因在白血病分子发病机制中的关键性作 用。 2.急性白血病的分类及初步基因分型探讨 目的ALL与AML的鉴别诊断是化疗成功的关键。虽然目前基于细胞形 态学、组织化学、免疫表型以及细胞遗传学分析的白血病诊断分型方法业己建 立,但还远不足以全面反映临床白血病各亚型之间的异质性。基因组分析已成 为目前白血病分型、诊断的重要指标。方法本研究利用寡聚核着酸芯片技术 检测16例急性白血病样本;根据样本的基因表达谱数据进行初步分类预测及分 型研究。采用生物信息学方法(1)Tclass系统对AML和ALL样本进行分类精度 评估。(2)利用系统性聚类的方法分析16例急性白血病样本之间分子水平的 相似性。结果 通过对外L和A见的分类预测研究,发现基因XM-005707、 HUMMLCISA、NM-002524、HU’MBPIGE、HSMYHllFP在分类预测中有很高的分类精 确度,可以作为ALL和AML的分类预测因子。通过以变异系数(CV)为基础的 特征性基因选择,鉴定出了6个特征性基因:AF049498、HSDOCKP、AF202996、 HSA243995、HSU46751、HSWNCP,它们在急性白血病的初步基因分型中具有十 分重要的贡献。结论(二)通过生物信息学交叉有效性分析表明:寡聚核着酸 芯片技术能够基于少数几个基因表达谱聚类结果对于急性白血病样本来进行 精确的AML/ALL分类;o)系统聚类分析能够根据疾病的基因表达谱特征进行 聚类。其分型诊断与以往传统的分型结果呈现高度一致性。(3)与以往分类不 尽相同的是,寡聚核着酸芯片技术通过基因表达谱聚类分析能够发现更多的个 体特异性的基因异常。寡聚核着酸芯片技术作为继传统的细胞学、组化染色、 免疫学和遗传学分型以后所发展的重要的分子生物学研究技术可应用于急性 4中文摘要 白血病基因的进一步精细分类研究。(本文来源于《中国人民解放军军事医学科学院》期刊2003-06-01)

基因组寡核苷酸芯片论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的探讨人无功能垂体腺瘤发生、发展中相关基因的表达与功能。方法应用人全基因组寡核苷酸芯片HG-U133Plus2.0分别检测4例无功能垂体腺瘤组织(2例促性腺激素腺瘤、2例裸细胞激素腺瘤)和正常垂体组织的基因表达谱,并对差异表达基因进行筛选和生物信息学分析。同时随机选择EDG3基因予以实时荧光定量PCR验证。结果与正常垂体组织相比,促性腺激素腺瘤中上调基因223条,下调基因678条;而裸细胞腺瘤中上调基因156条,下调基因665条;两者共同表达基因中上调基因50条,下调基因136条。共同差异表达基因的功能主要涉及分子结合、凋亡或肿瘤相关、代谢、信号传导、细胞周期、物质运输等多个生物过程。结论基因芯片技术有助于在分子水平上了解垂体腺瘤发病机制。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

基因组寡核苷酸芯片论文参考文献

[1].范俊梅,李娜,刘忠宇,马慜悦,王辉.应用基因组杂交、单核苷酸芯片及二代测序技术开展植入前染色体异常诊断[J].中国实用妇科与产科杂志.2014

[2].干小强,丁学华,卢亦成,胡国汉,陈菊祥.利用全基因组寡核苷酸芯片初步筛选无功能垂体腺瘤相关基因[J].中国微侵袭神经外科杂志.2010

[3].江华,沈晓莹,宋振云,胡晔东,徐文.全基因组寡核苷酸芯片筛选与胰腺癌相关的基因信号通路[J].胃肠病学.2009

[4].肖非,黄加权,余海静,习东,严伟明.应用人类全基因组寡核苷酸芯片筛查自身免疫性肝炎相关基因[J].中华肝脏病杂志.2006

[5].肖耀军.应用全人类基因组寡核苷酸芯片检测肾透明细胞癌与癌旁肾组织的基因表达谱差异性研究[D].第一军医大学.2005

[6].孙薏.利用寡聚核苷酸芯片进行急性白血病疾病基因组检测及基因分型的初步研究[D].中国人民解放军军事医学科学院.2003

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