基于网络药理学的黄芩素、京尼平抗脑缺血作用机制研究

论文摘要

目的采用网络药理学及分子对接技术,以灯盏花乙素苷元（scutellarein,SE）作为参照,预测黄芩素（baicalein,BE）、京尼平（genipin,GE）抗脑缺血作用靶点,为脑缺血疾病的临床防治和开发研究提供参考。方法利用TCMSP、Swiss Target Prediction和Stitch数据库检索和文献挖掘方法,预测SE、BE、GE作用靶点,同时应用DisGeNET、CTD、NCBI Gene、OMIM、DrugBank和PharmGkb数据库预测脑缺血疾病相关靶点。通过Cytoscape 3.3.0构建小分子-靶点网络图,用DAVID软件分析SE、BE、GE特有抗脑缺血靶点的GO功能富集和KEGG通路分析。采用AutodockVina软件对SE、BE、GE与抗脑缺血共同靶点分别进行对接研究,根据受体与配体的结合能和抑制浓度排序,选择最佳的靶点蛋白。结果 SE、BE、GE分别预测出30、59、35个靶蛋白,SE与BE共同抗脑缺血疾病靶点有PIK3CG、CYP1A2、VEGFA、ALOX5、PTGS2,SE与GE共同抗脑缺血靶点为PTGS2。分子对接结果显示受体PTGS2与SE、BE、GE对接结合能及抑制浓度相对较低。GO功能富集结果显示BE-SE共同靶点主要分布于细胞质、细胞器膜、内质网膜等部位,具有与金属离子、阳离子结合功能及催化、氧化还原酶活性,参与细胞脂质、羧酸、含氧酸、有机酸代谢及脂肪酸合成等过程有关;KEGG分析结果显示受体PTGS2主要作用于花生四烯酸代谢通路和VEGF信号通路,BE与GE配伍治疗脑缺血疾病通过抑制PTGS2（COX-2）和VEGF蛋白的表达,从而减轻炎症因子造成的脑组织损伤并改善血脑屏障（Blood brain barrier,BBB）的通透性发挥脑保护作用。结论预测了BE与GE配伍治疗脑缺血疾病的潜在靶点,初步验证了治疗脑缺血疾病的作用机制,为进一步深入研究BE与GE配伍治疗脑缺血作用机制提供参考,也为下一步合成新的衍生物提供基础。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 BE、GE和SE对应靶点的预测
•   1.2 BE、GE和SE抗脑缺血作用靶点的获取
•   1.3 网络的构建及分析
•   1.4 分子对接验证
•     1.4.1 配体及受体准备
•     1.4.2 分子对接准备
• 2 结果
•   2.1 预测的靶点信息
•   2.2 相关靶点的GO功能富集分析
•   2.3 KEGG富集通路分析及预测靶点-通路网络
•   2.4 分子对接分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 向净匀,吴杰,王琰,高原雪,何林,李豪,李敏,史永恒,王斌

关键词: 黄芩素,灯盏花乙素苷元,京尼平,脑缺血,网络药理学,分子对接

来源: 中草药 2019年23期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 中药学

单位: 陕西中医药大学

基金: 国家自然科学基金资助项目（81473385）,陕西省自然科学基金项目（2018JM7111）

分类号: R285.5

页码: 5802-5811

总页数: 10

文件大小: 938K

下载量: 752