花生VAMP基因家族全基因组鉴定及表达分析

论文摘要

植物囊泡结合膜蛋白(VAMP)是定位在囊泡上的运输蛋白,在植物发育以及响应生物和非生物胁迫中发挥重要作用。本研究对花生VAMP基因进行了全基因组鉴定与分析,并对它们在22个组织中的表达模式进行了分析。结果表明,二倍体野生种花生Arachis duranensis基因组有18个VAMP基因,Arachisi paensis基因组有21个,栽培种有41个,剔除假基因后花生VAMP基因家族有62个成员;表达模式分析表明AdVAMP17与AiVAMP1在大部分组织中均有表达,AdVAMP18与AiVAMP21在雌蕊中表达量最高,可能有特异性表达。本研究为进一步分析VAMP家族成员,并深入探讨其在花生中的生物学功能和进化模式奠定了基础。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 序列收集
•   1.2 系统发育进化树构建与染色体定位分析
•   1.3 花生VAMP家族基因结构及保守基序分析
•   1.4 花生VAMP基因表达量分析
• 2 结果与分析
•   2.1 花生VAMP基因家族鉴定与理化性质分析
•   2.2 花生VAMP基因家族的染色体分布
•   2.3 VAMP家族基因结构及保守性分析
•   2.4 VAMP基因家族表达模式分析
• 3 讨论与结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陆晓东,张浩,苑翠玲,孙全喜,闫彩霞,赵小波,王娟,李春娟,郑奕雄,单世华

关键词: 花生,囊泡结合膜蛋白基因家族,囊泡运输,表达模式

来源: 山东农业科学 2019年09期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 仲恺农业工程学院农业与生物学院,山东省花生研究所

基金: 泰山学者特聘专家(ts201712080),山东省农业良种工程项目(2017LZN033,2017LZGC003),山东省现代农业产业技术体系(SDAIT-04-02),国家自然科学基金青年科学基金项目(31601336),广东省农业农村厅科技项目(2019KJ136),山东省重点研发计划项目(2016GGH4518),青岛市科技惠民计划项目(17-3-3-49-nsh)

分类号: S565.2;Q943.2

DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2019.09.006

页码: 42-49

总页数: 8

文件大小: 3127K

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