脊椎动物FoxO基因亚族的进化

论文摘要

本研究以脊椎动物FoxO作为研究对象,选取NCBI上公布的多个FoxO基因编码蛋白的核苷酸序列,重点分析Fox O蛋白质结构和功能的相似性与差异性,重建FoxO基因的系统发育树并进行选择压力分析,对FoxO基因亚族的起源和进化进行研究分析。结果显示:脊椎动物FoxO蛋白间Forhead结构域十分保守但核定位信号区结构差异较明显,尤其是FoxO6蛋白,并且多个磷酸化位点在哺乳动物FoxO6中缺失,削弱核输出信号,但在斑马鱼和原鸡的FoxO6中未缺失这些位点,推测其胞质定位调控作用仍十分重要。FoxO3中多个磷酸化位点可能与寿命延长作用相关。系统发育树表明FoxO1是FoxO基因的祖先基因,不同FoxO基因进化速率不同。选择压力分析结果显示FoxO基因过程每个位点经历不同的选择压,并且获得25个正选择位点,这些正选择位点可能对FoxO不同基因的形成和新功能的产生中具有十分重要的作用。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 氨基酸序列比对分析
•   1.2 系统进化树的构建
•   1.3 选择压力分析
• 2 讨论
•   2.1 FoxO转录因子结构与功能分析
•   2.2 FoxO基因亚族的进化分析
• 3 材料与方法
•   3.1 FoxO基因亚族序列收集
•   3.2 氨基酸序列比对
•   3.3 系统发育树构建
•   3.4 选择压力分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 黄林艳,张婉清,黄晓,朱广香,王勤

关键词: 基因,系统发育,磷酸化位点,选择压力分析,脊椎动物

来源: 基因组学与应用生物学 2019年07期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学

单位: 四川农业大学生命科学学院

基金: 四川省科技厅基础研究项目(2015JY0177),国家自然科学基金青年科学基金项目(NSFC31401959)共同资助

分类号: Q953

DOI: 10.13417/j.gab.038.002925

页码: 2925-2934

总页数: 10

文件大小: 3715K

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