导读:本文包含了分子连锁图构建论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:分子,图谱,标记,甘薯,陆地棉,黄萎病,基因。
分子连锁图构建论文文献综述
周雁,卢兴潮,边银丙[1]（2015）在《毛木耳基因内分子标记开发与遗传连锁图构建》一文中研究指出毛木耳是我国广泛人工栽培的食用菌之一,但其遗传学和分子生物学基础相对薄弱。本研究以毛木耳杂交子APM2-16营养生长期(菌丝体)和生殖生长期(成熟子实体)的转录组为基础,开发了一系列基因内分子标记,包括SSR、InDel、CAPs、SCAR等,并利用这些分子标记开展了遗传连锁图的构建。毛木耳遗传连锁图的构建以APM2-16的123个担孢子单核体后代为作图群体,选用337对SSR引物、373对InDel引物以及23对其他类型的引物作为分子标记进行亲本单核体间的多态性分析和群体基因型分型,经遗传连锁作图分析获得一张包含160个基因内标记的毛木耳遗传连锁图。该遗传连锁图由14个连锁群组成,图谱总长595.7 cM,标记间的平均遗传距离为4.1 cM,交配型A位点和B位点分别位于第9连锁群和第1连锁群,并通过基因的遗传定位发现毛木耳的8个漆酶基因分散分布于5个不同的连锁群上。本遗传连锁图全部由基因内分子标记组成,为进一步开展毛木耳数量性状的QTL定位、功能基因的图位克隆、基因组组装、比较基因组研究和分子标记辅助选择育种等研究奠定了一定的遗传学基础。(本文来源于《中国菌物学会2015年学术年会论文摘要集》期刊2015-09-20）
石玉真,卢全伟,李文坦,李爱国,葛瑞华[2]（2014）在《棉花陆海种间分子连锁图谱构建与抗黄萎病性状QTL定位》一文中研究指出海岛棉产量偏低,但大多数高抗黄萎病,而陆地棉产量高,但缺乏优异的抗病种质系和亲本材料。因此挖掘海岛棉的优异抗病基因,把海岛棉优异抗病基因转移到陆地棉背景中,对我国陆地棉抗病育种具有重要的意义。本文以生产上大面积推广的早熟陆地棉品种中棉所36为轮回亲本、高抗黄萎病的海岛棉品系海1为供体亲本,经过杂交、回交,构建了不同回交世代的群体BC_1F_1、BC_1S_1、BC_2F_1群体。以BC_1F_1的群体作为作图群体,利用不同来源的23569对SSR对亲本及F_1进行多态性筛选,共筛选出2173对含有海1显性条带的多态性引物,将所得到的多态性引物对BC_1F_1群体进行基因型检测,构建了包含2292个SSR标记位点、分布在26个连锁群、总图距为5115.16 cM的分子连锁图谱,几乎覆盖整个基因组,平均每个连锁群包含88个标记位点,覆盖196.74 cM;标记间平均距离2.23 cM。结合BC_2F_1病圃的4个不同发病高峰期及BC_1S_1和BC_2F_1大田各自黄萎病平均病指数据,利用Windows QTL Cartographer2.5复合区间作图方法进行QTL定位分析,进行多环境多世代多个不同发病时期QTL筛选。共定位47个与黄萎病抗性相关的QTL,其中32个QTL分布在A亚组的10条染色体(C1、C3、C5、C6、C7、C8、C9、C10、C11、C12)上,15个QTL分布在D亚组的9条染色体(C1、C3、C5、C6、C7、C8、C9、C10、C11、C12)上。47个QTL分别解释表型变异的5.48%~16.66%,其中,37个QTL增效(降低病指)基因来源于海岛棉海1,提高植株的抗病性,加性效应为2.2~10.7,解释的表型变异为5.48%~16.66%;10个QTL增效(降低病指)基因来源于中棉所36,提高植株的抗病性,加性效应为4.9~7.4,解释的表型变异为5.87%~11.12%。有6个QTL能在不同世代或不同环境或不同发病时期下稳定存在;有8个QTL与前人研究结果相同,这些研究结果为棉花分子抗病育种提供了重要信息。(本文来源于《中国棉花学会2014年年会论文汇编》期刊2014-08-08）
周青[3]（2014）在《高通量SSR标记开发及二倍体月季分子连锁图谱构建》一文中研究指出月季(Roses)是蔷薇科(Rosaceae)蔷薇属(Rosa L.)植物种间反复杂交形成的具有连续开花习性的一系列品种类群。月季以其独特的精神文化内涵和美学特点,多个世纪以来,一直是世界重要的观赏花卉和园林景观植物。在中国,月季文化更是历史悠久,源远流长。本研究以有刺、连续开花习性的古老月季品种月月粉(Rosa chinensis Pallida')及无刺、一季开花习性园艺品种‘光叶蔷薇’(Rosa wichuriana Basye's thornless')为父母本,以构建的164株F1分离群体为作图群体,SSR标记为作图标记,构建了二倍体月季的分子遗传连锁图谱。另外,基于草莓(Fragaria vesca)基因组和月季基因组线性关系,以开发位于月季第七连锁群上的标记位点为导向,研究利用草莓第五染色体基因组序列高通量开发SSR标记,探讨了利用近缘属植物间的基因组线性关系,以口标连锁群为导向的高通量SSR遗传作图标记的开发。二倍体月季分子遗传连锁图谱的构建对解析月季优异性状的分子机制及分子标记辅助选择育种的应用都具有着重要的意义,同时也将为月季基因组项目提供参考。本研究主要取得如下成果：1.二倍体月季实验分离群体的构建。以有刺、具连续开花习性的古老月季品种月月粉为母本,无刺、具一季开花习性‘光叶蔷薇’为父本,构建F1分离群体283株,其中有刺后代157株,无刺后代126株。2.SSR标记的引进及多态性筛选。从法国国家农科院引进SSR标记60个,其中EST-SSR标记20个,Genome-SSR标记40个,筛选出父母本间具有多态性位点29个,筛选课题组已开发EST-SSR标记30个,获得父母本间具有多态性位点13个。3.高通量SSR标记位点的开发。以草莓基因组序列为参考序列,利用MicroSAtellite (MISA)软件共识别60040个SSR位点。其中单碱基重复位点21693个,双碱基重复位点28524个,叁碱基重复位点7575个,四碱基重复位点710个,五碱基重复位点865,六碱基重复位点673个。另外,研究以草莓基因组第五染色体序列为参考序列,检测到SSR位7461个,利用primer3软件成功对3230个SSR位点设计引物。4.新开发SSR标记在蔷薇属不同种间的转移及多态性研究。随机选取100对草莓基因组开发的SSR引物对月季芹叶组：峨眉蔷薇(Rosa omeiensis);毛叶蔷薇(Rosa mairei);月季组：亮叶月季(Rosa lucidissima),香水月季(Rsa odorata);木香组：黄木香(Rosa xanthina);单瓣白木香(Rosa banksiae var.normalis);合柱组：‘光叶蔷薇’以及‘月月粉’间进行转移性及多样性分析,扩增结果表明100对引物中有37对能扩增出清晰条带,其余63对没有扩增出条带,可扩增引物扩增目的片段长度与预期接近。统计37对引物在月季种间的可转移率为67.6%-81.1%,平均值为72.3%。其中26对引物可以扩增出多态性位点,占可扩增引物总数的70.3%。单个引物扩增出等位基因数分布范围为2-6,均值为2.7个。5.二倍体月季分子遗传连锁图谱的构建。以164株F1作为作图群体,Joinmap4.0为作图软件,采用拟测交策略作图,构建了含有34个标记位点的SSR连锁遗传图。获得的分子遗传图谱包含7个遗传连锁群,总的遗传图距为285.7cM,标记间平均距离为10.58cM,达到了基本框架图的精度要求。标记间间距最大为21.5cM,间距最小为4.4cM,单个连锁群的平均长度为40.81cM,最大为69.IcM,最小长度为15.6cM。标记位点数最多出现在第七连锁群上,标记间的平均图距达到4.5cM。为下一步利用该分离群体定位二倍体月季无刺基因位点奠定了基础。(本文来源于《华中农业大学》期刊2014-06-01）
李慧[4]（2014）在《甘薯SSR分子连锁图谱的构建和块根产量相关QTL的定位》一文中研究指出1、从NCBI下载获得6130条甘薯EST序列,利用AutoSSR软件搜索出371条EST-SSR序列,利用Primer 3.0设计得到79对EST-SSR引物；从甘薯品种徐薯18全基因组的1215对SSR引物中随机抽取155对引物。利用两个甘薯作图群体的双亲和两个分离单株分别对SSR引物进行筛选,分别筛选出38对和40对多态性好的SSR引物,共计78对。两个甘薯作图群体分别是：以高产量、中等淀粉含量、感茎线虫病甘薯品种徐薯18为母本及低产量、高淀粉含量、抗茎线虫病甘薯品系徐781为父本杂交得到的由202个F。单株构成的分离群体；以高淀粉甘薯品种漯徐薯8号为母本及低淀粉甘薯品种郑薯20为父本杂交得到的由240个F1单株构成的分离群体。2、用筛选出的78对SSR引物,分别对两个甘薯作图群体进行扩增,所有引物均扩增出多态性好的条带。在徐薯18、徐781、漯徐薯8号和郑薯20中分别得到103、102、191和174个SSR标记,共计582个SSR标记。根据双假测交策略,利用JoinMap3.0作图软件,在本研究室构建图谱的基础上分别对徐薯18、徐781、漯徐薯8号和郑薯20的分子连锁图谱进行加密,分别新增55、46、126和140个SSR标记,使4张图谱均包含90个连锁群。徐薯18连锁图谱由1910个AFLP标记和192个SSR标记组成,总图距为10458 cM,标记间的平均距离为5.7 cM；徐781连锁图谱由1622个AFLP标记和176个SSR标记组成,总图距为9297 cM,标记间的平均距离为4.6 cM；漯徐薯8号连锁图谱由964个SRAP标记和126个SSR标记组成,总图距为9181 cM,标记间的平均距离为8.4 cM；郑薯20连锁图谱由826个SRAP标记和140个SSR标记组成,总图距为7798 cM,标记间的平均距离为8.1 cM。利用Duplex和Triplex标记对双亲图谱的连锁群进行同源性分析,徐薯18和徐781连锁图谱中分别得到14和15个同源连锁组；漯徐薯8号和郑薯20连锁图谱中分别得到12和11个同源连锁组。对父母本分子连锁图谱进行图谱间连锁群同源性分析,利用252个Double-simplex标记揭示出徐薯18图谱中51个连锁群与徐781图谱中45个连锁群之间具有同源连锁关系；利用156个Double-simplex标记揭示出漯徐薯8号图谱中48个连锁群与郑薯20图谱中47个连锁群之间具有同源连锁关系。3、利用MapQTL4.0软件的IM和MQM分析法,以及徐薯18和徐781杂交得到的由202个F1单株构成的分离群体,进行甘薯块根产量相关的QTL定位,共定位到9个主效QTL。徐薯18图谱上定位到4个稳定的QTL,解释表型变异的36.3%～59.3%,其中3个QTL表现正向效应；徐781图谱上定位到5个稳定的QTL,解释表型变异的37.0%-51.2%,其中1个表现正向效应。4、用SSR标记,构建了195个甘薯主栽品种的指纹图谱。用7对多态性高的SSR引物进行扩增,共得到49条多态性条带,利用NTsys进行遗传相似度分析,并利用MEGA4进行聚类分析,最终可将195个甘薯品种完全区分开。品种间遗传相似系数范围在0.3265～0.9796之间,地区内变异幅度最大的是福建,平均遗传距离为0.3900；地区内变异幅度最小的是安徽为0.1643。地区间的遗传距离最大的为广东与安徽,平均遗传距离为0.4002；地区间遗传距离最小的是江西与安徽为0.2211。(本文来源于《中国农业大学》期刊2014-05-01）
肖炳光[5]（2013）在《烟草基因组计划进展篇:3.烟草分子标记遗传连锁图构建和重要抗病基因定位》一文中研究指出分子标记遗传连锁图是基因定位、图位克隆、分子标记辅助选择育种的基础[1]。普通烟草基因组较大,分子标记多态性水平较低[2],为遗传连锁图构建、基因定位等相关研究造成较大困难。近年来,Bindler等[3-4]利用美国烟草基因组测序项目的序列数据,开发了大量SSR标记,构建了高密度烟草遗传连锁图。由于他们使用的作图群体为烤烟和晒烟品种间杂交F2群体,遗传差异相对较远,可供烤烟利用的标记数有限。在中国烟草总公司、中国烟草总公司云南省公司多个项目的资助下,云南省烟草农业科学研究院联合行业内外相关单位,开展了烟草分子标记开发、遗传连锁图构建和抗病基因定位等研究工作,取得了重要进展。(本文来源于《中国烟草科学》期刊2013年03期）
殷豪,吴俊,张绍铃[6]（2012）在《梨分子遗传连锁图构建及重要农艺性状定位》一文中研究指出梨分子遗传连锁图谱的构建始于21世纪初,构建高密度的分子遗传图谱将有助于提高梨的分子育种水平。我们就目前国内外梨分子遗传连锁图谱的构建及其在抗病虫、果实性状及树形性状的基因定位和QTL定位,包括其在梨和苹果比较作图研究中的应用等方面进行简要阐述,指出了梨分子遗传图谱构建中存在的图谱密度较低和作图群体偏小等问题。梨育种工作者在今后的梨分子遗传图谱构建工作中,应注意适当扩大作图群体,充分利用蔷薇科基因组数据开发共显性标记,提高图谱标记密度,从而为标记辅助育种和重要农艺性状基因的图位克隆奠定基础。(本文来源于《果树学报》期刊2012年05期）
石玉真,李文坦,张金凤,葛瑞华,李俊文[7]（2012）在《陆海种间高密度SSR分子连锁图谱的构建和回交高代渐渗系的初步评价》一文中研究指出陆地棉产量高,适应性广,品质差,海岛棉纤维品质好,高抗黄萎病,产量低;将海岛棉优异基因导入陆地棉栽培品种中,对拓宽陆地棉遗传基础和改良陆地棉纤维品质具有非常重要的意义。本文以生产上大面积推广的早熟陆地棉品种中棉所为轮回亲本、海岛棉品系海为供体亲(本文来源于《中国棉花学会2012年年会暨第八次代表大会论文汇编》期刊2012-08-07）
赵宁,于肖夏,揭琴,翟红,李华[8]（2011）在《甘薯高密度分子连锁图谱的构建》一文中研究指出以高淀粉含量、低产、抗茎线虫病甘薯品种徐781和中等淀粉含量、高产、感茎线虫病甘薯品种徐薯18的杂交F_1代分离群体的202株单株为材料,利用AFLP技术,在父母本中共筛选了2893对AFLP引物,从中选取了多态性好的269对引物用于构建甘薯分子连锁图谱。用筛选得到的269对引物对两亲本及其F_1群体进行AFLP分析,在徐781中得到2851个多态性标记,包括1299个Simplex标记,337(本文来源于《中国作物学会50周年庆祝会暨2011年学术年会论文集》期刊2011-10-18）
司军,李成琼,任雪松,宋洪元,宋明[9]（2011）在《结球甘蓝抗根肿病SSR分子连锁图谱的构建》一文中研究指出结球甘蓝(Brassica oleraceaL.var.capitata)简称甘蓝,是我国重要的蔬菜作物之一。甘蓝根肿病是由芸苔根肿菌(Plamodiophora brassicaeWoron.)侵染引起的一种世界性真菌病害。近年来,该病在我国的发病面积急剧增加,造成甘蓝产量和品质大幅度降低,选育抗病品种成为防治根肿病的重要途径之一。(本文来源于《植物病理学报》期刊2011年03期）
李爱贤,刘庆昌,王庆美,张立明,翟红[10]（2010）在《利用SRAP标记构建甘薯分子连锁图谱》一文中研究指出以高淀粉甘薯品种漯徐薯8号为母本,低淀粉甘薯品种郑薯20为父本,杂交得到的F1分离群体的240个单株为作图群体,利用SRAP标记技术,共得到770个母本的多态性标记和523个父本的多态性标记,用JoinMap3.0软件和"双假测交"策略,分别构建了2个亲本的分子连锁图谱。其中漯徐薯8号的图谱包括由473个SRAP标记组成的81个连锁群,总图距为5802.46cM,标记间平均图距为10.16cM;郑薯20的图谱包括由328个SRAP标记组成的66个连锁群,总图距为3967.90cM,标记间平均图距为12.02cM。该高密度分子连锁图谱的构建,为甘薯分子标记辅助选择、基因定位及克隆研究奠定了基础。(本文来源于《作物学报》期刊2010年08期）
分子连锁图构建论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
海岛棉产量偏低,但大多数高抗黄萎病,而陆地棉产量高,但缺乏优异的抗病种质系和亲本材料。因此挖掘海岛棉的优异抗病基因,把海岛棉优异抗病基因转移到陆地棉背景中,对我国陆地棉抗病育种具有重要的意义。本文以生产上大面积推广的早熟陆地棉品种中棉所36为轮回亲本、高抗黄萎病的海岛棉品系海1为供体亲本,经过杂交、回交,构建了不同回交世代的群体BC_1F_1、BC_1S_1、BC_2F_1群体。以BC_1F_1的群体作为作图群体,利用不同来源的23569对SSR对亲本及F_1进行多态性筛选,共筛选出2173对含有海1显性条带的多态性引物,将所得到的多态性引物对BC_1F_1群体进行基因型检测,构建了包含2292个SSR标记位点、分布在26个连锁群、总图距为5115.16 cM的分子连锁图谱,几乎覆盖整个基因组,平均每个连锁群包含88个标记位点,覆盖196.74 cM;标记间平均距离2.23 cM。结合BC_2F_1病圃的4个不同发病高峰期及BC_1S_1和BC_2F_1大田各自黄萎病平均病指数据,利用Windows QTL Cartographer2.5复合区间作图方法进行QTL定位分析,进行多环境多世代多个不同发病时期QTL筛选。共定位47个与黄萎病抗性相关的QTL,其中32个QTL分布在A亚组的10条染色体(C1、C3、C5、C6、C7、C8、C9、C10、C11、C12)上,15个QTL分布在D亚组的9条染色体(C1、C3、C5、C6、C7、C8、C9、C10、C11、C12)上。47个QTL分别解释表型变异的5.48%~16.66%,其中,37个QTL增效(降低病指)基因来源于海岛棉海1,提高植株的抗病性,加性效应为2.2~10.7,解释的表型变异为5.48%~16.66%;10个QTL增效(降低病指)基因来源于中棉所36,提高植株的抗病性,加性效应为4.9~7.4,解释的表型变异为5.87%~11.12%。有6个QTL能在不同世代或不同环境或不同发病时期下稳定存在;有8个QTL与前人研究结果相同,这些研究结果为棉花分子抗病育种提供了重要信息。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
分子连锁图构建论文参考文献
[1].周雁,卢兴潮,边银丙.毛木耳基因内分子标记开发与遗传连锁图构建[C].中国菌物学会2015年学术年会论文摘要集.2015
[2].石玉真,卢全伟,李文坦,李爱国,葛瑞华.棉花陆海种间分子连锁图谱构建与抗黄萎病性状QTL定位[C].中国棉花学会2014年年会论文汇编.2014
[3].周青.高通量SSR标记开发及二倍体月季分子连锁图谱构建[D].华中农业大学.2014
[4].李慧.甘薯SSR分子连锁图谱的构建和块根产量相关QTL的定位[D].中国农业大学.2014
[5].肖炳光.烟草基因组计划进展篇:3.烟草分子标记遗传连锁图构建和重要抗病基因定位[J].中国烟草科学.2013
[6].殷豪,吴俊,张绍铃.梨分子遗传连锁图构建及重要农艺性状定位[J].果树学报.2012
[7].石玉真,李文坦,张金凤,葛瑞华,李俊文.陆海种间高密度SSR分子连锁图谱的构建和回交高代渐渗系的初步评价[C].中国棉花学会2012年年会暨第八次代表大会论文汇编.2012
[8].赵宁,于肖夏,揭琴,翟红,李华.甘薯高密度分子连锁图谱的构建[C].中国作物学会50周年庆祝会暨2011年学术年会论文集.2011
[9].司军,李成琼,任雪松,宋洪元,宋明.结球甘蓝抗根肿病SSR分子连锁图谱的构建[J].植物病理学报.2011
[10].李爱贤,刘庆昌,王庆美,张立明,翟红.利用SRAP标记构建甘薯分子连锁图谱[J].作物学报.2010
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