东北三省棕黑锦蛇(Elaphe schrenckii)与赤峰锦蛇(Elaphe anomala)基于Cyt b基因的序列多态性及遗传多样性

论文摘要

棕黑锦蛇和赤峰锦蛇均为分布于我国东北和华北地区体型较大的蛇类物种,在我国东北地区两栖爬行动物学研究和保护中占有重要地位。通过分析来自黑龙江省、吉林省、辽宁省的棕黑锦蛇和赤峰锦蛇共41个样本（棕黑锦蛇18个样本,赤峰锦蛇23个样本）的线粒体DNA细胞色素b基因部分序列（均为1086 bp）,分别研究二者DNA序列多态性和种群遗传多样性。结果在棕黑锦蛇18条序列中共发现3个变异位点,定义4个单倍型,赤峰锦蛇23条序列中共发现3个变异位点,定义3个单倍型,两种锦蛇在不同群体间均存在共享单倍型。两种锦蛇的种群整体呈现较低的遗传多样性,但棕黑锦蛇略高于赤峰锦蛇;基于Cyt b基因序列的系统发育树将二者分为两大支系。遗传分化指数FST值和基因流Nm值表明个别种群间存在不同程度的遗传分化。遗传距离GD值较小,表明种群间的遗传变异较小。分子方差分析显示,棕黑锦蛇和赤峰锦蛇的种群变异主要来自种群间。中性检验分析和岐点分布分析显示,棕黑锦蛇与赤峰锦蛇种群的大小相对稳定,近期内均未发生过明显的种群扩张。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 样品采集
•   1.2 基因组DNA提取及PCR扩增
•   1.3 数据处理与分析
• 2 结果与分析
•   2.1 序列变异
•   2.2 遗传多样性与群体遗传结构
•   2.3 系统发育关系
•   2.4 单倍型间关系
•   2.5 种群历史动态
• 3 讨论
•   3.1 遗传多样性
•   3.2 遗传分化
•   3.3 群体历史
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 苏思博,黄松,董丙君

关键词: 单倍型,群体遗传学,种群大小,种群历史,中性检验

来源: 长春师范大学学报 2019年04期

年度: 2019

分类: 社会科学Ⅱ辑,基础科学

专业: 生物学

单位: 沈阳师范大学生命科学学院,黄山学院生命与环境科学学院

分类号: Q953

页码: 76-86

总页数: 11

文件大小: 1325K

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