逆转座子LINE1在Hela细胞中的表达及转录组分析

论文摘要

为研究逆转座子LINE1(简称为L1)在Hela细胞内的作用机制,对转染L1的Hela细胞和正常细胞进行转录组测序,通过对转录组数据进行拼接组装,对差异表达基因进行了生物信息学分析。结果表明:试验共筛选出391个差异表达基因,其中45.6%的差异表达基因显著性上调,这些基因通过GO分类注释,可分为14类;通过KEGG对差异基因进行通路富集,表明差异基因主要富集在破骨细胞分化、色氨酸代谢、乙型肝炎、病毒致癌作用和可卡因成瘾等信号通路,发现了一些与细胞黏着连接、表皮相关的基因有差异性表达。研究表明,通过转录组测序,获得了丰富的关于L1在Hela细胞中表达的信息,为进一步研究L1在细胞中的作用机制供了思路和理论依据。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
•     1.2.1 Hela细胞培养
•     1.2.2 细胞转染
•     1.2.3 转染L1后的蛋白表达和定位
•     1.2.4 转录组测序
•     1.2.5 生物信息学分析
•   1.3 数据处理
• 2 结果与分析
•   2.1 L1在Hela细胞中的表达与定位
•   2.2 转录组测序及质量评估
•   2.3 差异表达基因筛选
•   2.4 差异表达基因GO功能分析和KEGG Pathway富集分析
• 3 讨论
•   3.1 L1逆转座子在细胞生长发育过程中的作用
•   3.2 L1逆转座子与致癌作用的联系
•   3.3 L1逆转座子功能研究进展
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 储旭,周涛,李文豪,邢虎,陈良标

关键词: 细胞,转录组测序,逆转座子

来源: 大连海洋大学学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室中国科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心

基金: 国家自然科学基金资助项目(31572611),上海市教委水产高峰学科项目

分类号: Q78

DOI: 10.16535/j.cnki.dlhyxb.2019.02.001

页码: 153-159

总页数: 7

文件大小: 1628K

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