分子总能量论文_李辉

导读:本文包含了分子总能量论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:能量,分子,原子价,电负性,参数,理论,密度。

分子总能量论文文献综述

李辉[1](2014)在《应用ABEEMσπ/MM方法计算一些有机分子及寡肽分子的总能量》一文中研究指出本文应用ABEEMσπ/MM方法计算了环烷烃CnH2(nn=6~12)、醇CnH2n+1OH(n=1~8)、醛CnH2nO(n=1~8)和羧酸CnH2n+1COOH(n=0~8)分子的总能量。将计算结果与从头算(MP2/6-311+G(d,p))方法计算所得的结果相比,绝对偏差最小的是0.0000kal/mol,最大的是9.0601kal/mol;相对偏差最小的是0.0000,最大的是3.1134×10-5;环烷烃、一元醇、醛、酸的均方根偏差(RMSD)分别为1.3068kal/mol,1.8952kal/mol,2.3504kal/mol和3.1269kal/mol,相对均方根偏差分别为0.3211×10-5,0.5650×10-5,0.7769×10-5和0.7715×10-5;两种方法计算能量的线性相关系数都为1.0000。可见应用ABEEMσπ/MM方法计算分子的能量是十分准确的。将该方法应用到大的体系(甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸、亮氨酸二肽到八肽)中,计算了这些分子在反β-折迭和α-右手螺旋构象下分子的总能量。将计算结果与从头算(MP2/6-311++G(d,p))方法计算所得的结果相比,在反β-折迭构象下,绝对偏差均小于1.7893kcal/mol,相对偏差均小于0.4828×10-5;均方根偏差和相对均方根偏差分别为1.0554kcal/mol和0.1170×10-5;线性相关系数均为1.0000。在α-右手螺旋构象下,绝对偏差均小于5.1523kcal/mol,相对偏差均小于0.6016×10-5;均方根偏差和相对均方根偏差分别为2.6671kcal/mol和0.1695×10-5;线性相关系数均为1.0000。上述结果表明,ABEEMσπ/MM方法能够快速、准确地计算分子的总能量,尤其对于大分子体系,更体现了速度快的优势,同时也验证了参数具有很好的可转移性。说明ABEEMσπ/MM方法是快速、准确计算分子总能量的好方法,是值得信赖和发展的。(本文来源于《辽宁师范大学》期刊2014-04-01)

李辉,杨忠志[2](2013)在《应用ABEEMσπ/MM方法计算一些有机分子的总能量》一文中研究指出应用ABEEMσπ/MM方法计算烷烃Cn H2n+2(n=1~14)的总能量,以从头算(MP2/6-311+G(d,p))的结果为依据,拟合了不同类型原子的价态能量参数.通过这些参数又计算了环烷烃Cn H2n(n=6~12)、烯烃Cn H2n(n=2~8)和一元醇Cn H2n+1OH(n=1~8)体系的总能量,将结果与从头算(MP2/6-311+G(d,p))方法相比,绝对偏差均小于27.878 9kJ/mol,相对偏差均小于3.874 4×10-5,环烷烃、烯烃、醇的均方根偏差分别为5.581 1,10.255 6,7.921 9kJ/mol;相对均方根偏差分别为0.327 3,0.910 9,0.565 0,线性相关系数全部达到1.000 0.由此可见,ABEEMσπ/MM方法计算的分子能量与从头算(MP2/6-311++G(d,p))相比具有很好的一致性,验证了我们所拟合的参数的合理性和可转移性,而且计算速度很快.(本文来源于《分子科学学报》期刊2013年06期)

杨忠志,赵洪伟[3](2011)在《应用ABEEMσπ/MM方法计算小分子肽的总能量》一文中研究指出把分子力场(MM)和原子-键电负性均衡方法(ABEEMσπ)协调融合在一起,采用ABEEMσπ/MM方法的分子能量计算方法,选取直链烷烃(n=1~10)、丙酮、丁酮、3-戊酮、N-甲基乙酰胺(NMA)、丙氨酸二肽和若干种氨基酸作为模型分子,计算模型分子能量,从而得到不同类型原子价态能量参数.应用这些原子价态能量参数,计算小分子肽的能量.把所得结果与从头算(MP2/6-311++G(d,p))方法计算的结果相比,得出小分子肽能量的绝对偏差小于9.000 0 kcal/mol,相对偏差小于19.000 0×10-6,且均方根偏差3.450 0 kcal/mol,相对均方根偏差6.919 0×10-6.以上结果表明,ABEEMσπ/MM方法计算的分子能量结果与从头算(MP2/6-311++G(d,p))方法计算的结果具有较好的一致性,此外,用ABEEMσπ/MM方法计算分子能量要远远快于从头算(MP2/6-311++G(d,p))方法.(本文来源于《辽宁师范大学学报(自然科学版)》期刊2011年03期)

赵洪伟[4](2011)在《应用ABEEMσπ/MM方法计算小分子肽及二肽分子不同构象的总能量》一文中研究指出生物体中的肽具有极其重要的生理功能,在细胞内发挥一定的生物活性,因此研究肽的性质是非常必要的。本文研究了小分子肽及二肽分子不同构象的总能量。本文把原子-键电负性均衡方法(ABEEMσπ)和分子力场(MM)结合在一起,采用ABEEMσπ/MM方法的分子总能量计算方法,计算小分子肽及二肽分子不同构象的总能量。首先,通过计算模型分子的总能量调节不同类型的原子价态能量参数,进而计算小分子肽的总能量。把所得的分子总能量结果与从头算(MP2/6-311++G(d,p))方法计算的结果相比,得出小分子肽总能量的绝对偏差小于9.0000kcal/mol,相对偏差小于19.0000×10-6,且均方根偏差3.4500 kcal/mol,相对均方根偏差6.9190×10-6。其次,又对二肽分子不同构象的总能量进行了计算,所得的分子总能量结果与从头算(MP2/6-311++G(d,p))方法计算的结果相比,得出二肽分子不同构象总能量的绝对偏差小于2.0000 kcal/mol,相对偏差小于4.0000×10-6,且均方根偏差1.0647 kcal/mol,相对均方根偏差2.7016×10-6。以上结果表明,ABEEMσπ/MM方法计算的分子总能量结果与从头算(MP2/6-31 1++G(d,p))方法计算的结果具有较好的一致性,同时,也说明所调的原子价态能量参数具有很好的可转移性。此外,应用ABEEMσπ/MM方法计算分子总能量远远快于从头算(MP2/6-311++G(d,p))方法。这些工作为以后计算更大的生物肽分子总能量及其相关性质等奠定了良好的基础。(本文来源于《辽宁师范大学》期刊2011-04-01)

王阔,李振鹏,孙兆林,陈永昌,宋丽娟[5](2008)在《基于模拟退火法的氨分子总能量分析》一文中研究指出采用模拟退火(simulated annealing,SA)法,依据量子化学从头计算(Ab initio)原理,实现氨分子总能量优化STO-3G高斯基组函数线性系数的过程。研究中以氨分子总能量为目标函数,以高斯基组函数的线性系数为决策变量,同时以氨分子轨道正交性为约束条件,通过模拟退火过程实现氨分子总能量的最小化。退火运算结果表明:应用模拟退火法时目标函数氨分子总能量对于高斯基组函数线性系数的初始选取并不敏感。不同高斯基组函数线性系数经退火运算后,可使氨分子总能量依概率收敛于-72~-91a.u.,本文同时讨论氨分子能量可能有多解性。(本文来源于《计算机与应用化学》期刊2008年02期)

李良超,冯志云,赵元力[6](2000)在《聚并苯和氯代聚并苯同系分子的总能量与同系序数的相关性研究》一文中研究指出聚并苯和氯代聚并苯同系分子的总能量与同系序数之间满足下列相关方程ET=aN +b,N =2n +1 ,R≈ 1 ,N为同系序数 ,n是苯环的结构单元数 .本文的计算值与文献值吻合 .(本文来源于《荆州师范学院学报》期刊2000年05期)

巴音贺希格[7](1999)在《共轭分子π电子总能量公式的理论诠释的修正》一文中研究指出本文对共轭分子π电子总能量公式Eπ=rρrαr+2r<sPrsβrs的理论诠释做了分析,通过用群论方法解决两个具体问题,指出了以往说法的局限性,给出了几点新结论(本文来源于《内蒙古民族师院学报(自然科学版)》期刊1999年01期)

王雅红,汪方儒[8](1996)在《计及电子相关能的XHn分子体系基态总能量》一文中研究指出在单中心球对称模型近似下,将单中心的XHn分子体系的基态总能量公式进行相关能修正,并把得到的理论公式编成程序,计算了XHn(X=C、N、O、Si、P、S)分子基态总能量,其结果比用其它方法的计算结果更接近实验值,且计算量小,为解决多中心分子问题提供一有效途径(本文来源于《辽宁师范大学学报(自然科学版)》期刊1996年03期)

王鲁红,沈尔忠,杨忠志[9](1996)在《密度泛函理论下的分子电负性(Ⅳ)──大环分子的总能量和电荷分布的直接计算》一文中研究指出以密度泛函理论表述的电负性定义及其均衡原理为基础,提出了一个修正电负性均衡方法(MEEM),可直接用于计算各类分子的总能量和原子电荷分布。通过对3个较大环状分子18-crown-6,24-crown-8和24-cryptand的实际计算,发现其计算结果与从头计算结果接近。(本文来源于《高等学校化学学报》期刊1996年05期)

沈尔忠,杨忠志[10](1996)在《密度泛函理论下的分子电负性 Ⅲ.分子总能量的直接计算》一文中研究指出本文根据密度泛函理论,在分子基态总能量表达式中,考虑了组成原子的内在能量、电负性和硬度的价态特征,并引入协调原子间相互作用能项的k因子,不仅使处理和解释更为合理,而且大大提高了计算精度和适用范围.据此,我们提出和设计了一个直接计算体系基态总能量的新方案,可广泛应用于各类分子和基团,同时给出了一套较为普遍的实用参数,通过上百个大小分子或基团的实际计算,结果与从头计算结果符合相当好,相对误差不到千分之一.此外,该方案具有简单快速、易于执行等优点,为大分子体系的能量计算提供了一个切实有效的方法.(本文来源于《化学学报》期刊1996年02期)

分子总能量论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

应用ABEEMσπ/MM方法计算烷烃Cn H2n+2(n=1~14)的总能量,以从头算(MP2/6-311+G(d,p))的结果为依据,拟合了不同类型原子的价态能量参数.通过这些参数又计算了环烷烃Cn H2n(n=6~12)、烯烃Cn H2n(n=2~8)和一元醇Cn H2n+1OH(n=1~8)体系的总能量,将结果与从头算(MP2/6-311+G(d,p))方法相比,绝对偏差均小于27.878 9kJ/mol,相对偏差均小于3.874 4×10-5,环烷烃、烯烃、醇的均方根偏差分别为5.581 1,10.255 6,7.921 9kJ/mol;相对均方根偏差分别为0.327 3,0.910 9,0.565 0,线性相关系数全部达到1.000 0.由此可见,ABEEMσπ/MM方法计算的分子能量与从头算(MP2/6-311++G(d,p))相比具有很好的一致性,验证了我们所拟合的参数的合理性和可转移性,而且计算速度很快.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

分子总能量论文参考文献

[1].李辉.应用ABEEMσπ/MM方法计算一些有机分子及寡肽分子的总能量[D].辽宁师范大学.2014

[2].李辉,杨忠志.应用ABEEMσπ/MM方法计算一些有机分子的总能量[J].分子科学学报.2013

[3].杨忠志,赵洪伟.应用ABEEMσπ/MM方法计算小分子肽的总能量[J].辽宁师范大学学报(自然科学版).2011

[4].赵洪伟.应用ABEEMσπ/MM方法计算小分子肽及二肽分子不同构象的总能量[D].辽宁师范大学.2011

[5].王阔,李振鹏,孙兆林,陈永昌,宋丽娟.基于模拟退火法的氨分子总能量分析[J].计算机与应用化学.2008

[6].李良超,冯志云,赵元力.聚并苯和氯代聚并苯同系分子的总能量与同系序数的相关性研究[J].荆州师范学院学报.2000

[7].巴音贺希格.共轭分子π电子总能量公式的理论诠释的修正[J].内蒙古民族师院学报(自然科学版).1999

[8].王雅红,汪方儒.计及电子相关能的XHn分子体系基态总能量[J].辽宁师范大学学报(自然科学版).1996

[9].王鲁红,沈尔忠,杨忠志.密度泛函理论下的分子电负性(Ⅳ)──大环分子的总能量和电荷分布的直接计算[J].高等学校化学学报.1996

[10].沈尔忠,杨忠志.密度泛函理论下的分子电负性Ⅲ.分子总能量的直接计算[J].化学学报.1996

论文知识图

金属离子(Li+,Na+,K+,Be2+,Mg2+,Ca2...键长是1.367,1.4301.587时的纯硼...在60℃下模拟16ps的总能量、势能和...双原子分子的能级示意图(A、B为电子...(v=1)分子的激励截面与电子温度关系:叁聚氰胺分子在Cu(100)面上的异构...

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