基于核基因的黄绿卷毛菇系统发育与谱系地理学分析

论文摘要

黄绿卷毛菇（Floccularia luteovirens）隶属于伞菌目（Agaricales）口蘑科（Tricholomataceae）是一种主要分布在青藏高原的产子实体的外生菌根真菌。本研究以青藏高原黄绿卷毛菇（F. luteovirens）的23个野生居群,404个个体为研究对象,利用rDNA三个片段（ITS+5.8 s, IGS-1以及LSU）研究了青藏高原黄绿卷毛菇种內的系统发育关系。研究表明:联合序列共获得15种基因型,基因型多样性（h）的范围从0.374 3 （MD）到1.000 0 （DR）,平均值为0.723 3。歧点分布分析走势呈现单峰曲线,表明黄绿卷毛菇居群近期经历过扩张过程。对黄绿卷毛菇基因型变异的分布模式进行验证,得到NST>GST（p<0.05）,表明黄绿卷毛菇基因型之间具有显著地分子系统地理结构。分子变异分析（AMOVA）表明,黄绿卷毛菇的遗传变异主要存在于居群内部（79.17%）。基于MP树和ML树的研究发现基因型H3、H4、H5、H15首先和其他基因型分开,而在贝叶斯分析中则不存在这一分支。没有一个居群拥有特有的基因型,但是就基因型多样性地域分布格局来看,各个基因型的多样性由北向南呈明显的减少趋势。结合软件NETWORK的分析可以知道,几种主要分布在阿尼玛卿山以南的基因型都位于网路结构的边缘,说明这几种基因型是较晚形成的。本研究是对之前利用蛋白质编码基因研究的很好地补充。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 测序结果分析
•   1.2 谱系地理学与遗传多样性研究
•   1.3 系统发育研究
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 样品采集
•   3.2 DNA提取、PCR扩增及测序
•   3.3 数据分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 邢睿,徐明行,王久利,陈世龙

关键词: 青藏高原,黄绿卷毛菇,系统发育,谱系地理学,菌根真菌

来源: 基因组学与应用生物学 2019年07期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学

单位: 中国科学院高原生物适应与进化重点实验室,青海省作物分子育种重点实验室,青海大学生态环境工程学院,中国科学院大学

基金: 国家自然科学基金青年基金(31600409),青海省创新平台建设专项项目-青海省作物分子育种重点实验室(2017-ZJ-Y14),科技基础性工作专项(2015FY110100),中国科学院“西部之光”人才培养引进计划共同资助

分类号: Q949.32

DOI: 10.13417/j.gab.038.003057

页码: 3057-3064

总页数: 8

文件大小: 1323K

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