健康与感染黑胫病烟株根际土壤与茎杆真菌群落结构与多样性

健康与感染黑胫病烟株根际土壤与茎杆真菌群落结构与多样性

论文摘要

烟草黑胫病是烟草种植的毁灭性土传病害之一,一旦发生便会对烟草生产造成巨大的经济损失。为了解感染黑胫病烟株根际土壤、发病茎杆真菌群落结构与多样性的变化情况。以健康与感染黑胫病烟株根际土壤和茎杆为研究对象,通过PCR技术扩增样本中真菌转录间隔区的ITS1-ITS2区域,采用Illumina Miseq高通量测序技术对扩增片段进行测序,分析健康与感染黑胫病烟株根际土壤和茎杆真菌群落结构与多样性。本研究20个测试样品,共获得755599条高质量序列片段,最短序列为200 bp,最长序列为356 bp,平均序列长度248 bp。结果表明,健康烟株和发病烟株根际土壤的优势真菌为子囊菌门(Ascomycota)、接合菌门(Zygomycota)、担子菌门(Basidiomycota),而所有茎杆样品优势真菌为子囊菌门、担子菌门。在属水平上,健康与感染黑胫病烟株根际土壤样品相对丰度大于1%的属有镰刀菌属(Fusarium)、被孢霉属(Mortierella)、隐球菌属(Cryptococcus)、链格孢属(Alternaria)、赤霉菌属(Gibberella)等,其中,健康烟株根际土壤优势菌属为镰刀菌属(39.35%)和被孢霉属(14.19%),发病烟株根际土壤镰刀菌属和被孢霉属相对丰度分别为40.26%和20.77%;健康茎杆样品优势菌属为隐球菌属(31.12%)、链格孢属(18.28%)、镰刀菌属(15.67%)和Rhodotorula(13.34%);病健交界茎杆样品优势菌属为镰刀菌属(41.36%)、隐球菌属(28.15%)和链格孢属(22.32%);发病茎杆优势菌为隐球菌属(62.14%)、链格孢属(27.75%)。感染黑胫病后根际土壤与茎杆样品真菌优势属种类较健康烟株无明显变化,但各属相对丰度变化显著。发病烟株根际土壤与茎杆样品真菌群落Sobs、Chao、Shannon指数较健康烟株降低,Simpson指数上升,表示烟株发病后根际土壤真菌与茎杆内生真菌群落丰富度与多样性降低。了解健康与感染黑胫病烟株根际土壤和茎杆真菌群落结构与多样性,对于研究烟草黑胫病发生的微生态机制及其防治具有一定的指导意义。

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文章来源

类型: 国内会议

作者: 向立刚,郭珍妮,汪汉成,蔡刘体,余知和

关键词: 烟草黑胫病,高通量测序,真菌多样性,群落结构

来源: 多彩菌物 美丽中国——中国菌物学会2019年学术年会 2019-08-03

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,植物保护

单位: 长江大学生命科学学院贵州省烟草科学研究院

分类号: S435.72;S154.3

DOI: 10.26914/c.cnkihy.2019.001980

页码: 60

总页数: 1

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