与植物抗逆相关的miR-398-3p基因家族进化分析及靶基因预测

论文摘要

通过生物信息学方法对miR-398-3p基因家族进行序列分析和靶基因预测。结果表明,大部分miR-398-3p基因分布在不同的染色体上,miR-398-3p序列在不同物种间具有高度的保守性。进化分析结果表明,miR-398-3p基因家族的成员呈现为7个分支,个别物种miR-398-3p的不同成员具有较远的亲缘关系;miR-398-3p的靶基因具有超氧化物歧化酶[Cu-Zn]、花粉特异性蛋白质SF3、锌指蛋白WIP2、C2H2型锌指家族蛋白等功能,参与植物的生物和非生物胁迫及生长发育调控过程。

论文目录

1 材料与方法

1.1 miR-398-3p序列检索及分析

1.2 miR-398-3p基因家族成员的多序列比对及保守位点分析

1.3 miR-398-3p基因家族成员系统进化树的构建

1.4 miR-398-3p靶基因的预测

2 结果与分析

2.1 miR-398-3p基因家族及在基因组中的定位分析

2.2 miR-398-3p基因家族序列分析

2.3 miR-398-3p基因家族系统进化树的分析

2.4 miR-398-3p靶基因的预测

3 讨论

4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 薛巨坤,王博,王莲萍,杨春雨,国会艳,郝爱平

关键词: 生物信息学,靶基因,植物抗逆

来源: 湖北农业科学 2019年14期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 牡丹江师范学院生命科学与技术学院

基金: 黑龙江省教育厅备案项目(1352MSYYB002),国家自然科学基金项目(31700587)

分类号: Q943.2

DOI: 10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.14.034

页码: 141-147

总页数: 7

文件大小: 3413K

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标签：生物信息学论文; 靶基因论文; 植物抗逆论文;

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