毛华菊CvCRY2基因的克隆、生物信息学及表达分析

论文摘要

蓝光受体隐花色素（Cryptochromes）在高等植物开花时间调控中发挥重要作用。结合毛华菊转录组数据库,利用RACE技术克隆得到毛华菊CRY2基因,命名为CvCRY2,并对该基因及其蛋白进行了生物信息学和表达模式分析。结果显示,CvCRY2基因编码区全长为1 839 bp,共编码613个氨基酸,预测蛋白相对分子量为69.954 kD,理论等电点（pI）为5.69,为亲水性蛋白。同源氨基酸序列比对结果表明,CvCRY2与甘菊、青蒿等功能已确认的CRY2同源性较高,氨基酸序列相似性均达80%以上,与拟南芥AtCRY2的相似性为56.82%;系统进化分析表明CvCRY2蛋白与甘菊、青蒿亲缘关系更近;CvCRY2蛋白功能结构域分析表明其具有高度保守DNA photolyase区域和FADbinding7结构域。CvCRY2蛋白二级结构中α-螺旋占38.66%和无规则卷曲占46.49%。利用qRT-PCR技术对毛华菊根、茎、叶、蕾、花和顶芽等组织器官中CvCRY2基因表达进行相对定量分析,发现CvCRY2在叶片中的表达量最高,其次是茎尖、茎、花、花蕾,在根中的表达量最低。CvCRY2响应短日照处理的表达模式分析发现该基因表达丰度受短日照的影响。随着短日照诱导时间的延长,其表达丰度逐渐升高,在短日照诱导16 d时出现一个表达高峰。本研究可为毛华菊CvCRY2基因的功能解析及调控机制研究提供参考。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 CvCRY2基因克隆及编码蛋白的理化性质分析
•   1.2 CvCRY2功能结构域分析及同源氨基酸序列比对
•   1.3 CvCRY2的系统进化分析
•   1.4 CvCRY2蛋白质亲疏水性及二级结构预测
•   1.5 CvCRY2基因表达模式分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 材料
•   3.2 毛华菊总RNA的提取与cDNA的合成
•   3.3 毛华菊CRY2基因克隆及pMD18-T载体的构建
•   3.4 毛华菊CRY2基因序列及蛋白的生物信息学分析
•   3.5 毛华菊CRY2基因表达模式分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 马朝峰,邓成燕,戴思兰

关键词: 毛华菊,隐花色素,开花时间

来源: 分子植物育种 2019年17期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,园艺

单位: 北京林业大学园林学院花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室国家花卉工程技术研究中心城乡生态环境北京实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室

基金: 国家自然科学基金(No.31471907,No.31530064)资助

分类号: Q943.2;S682.11

DOI: 10.13271/j.mpb.017.005578

页码: 5578-5585

总页数: 8

文件大小: 4018K

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