嗜麦芽寡养单胞菌全基因组测序及降解荧蒽特性研究

论文摘要

随着当前工业化社会的发展,由多环芳烃等石油污染物造成的土壤污染已经成为了世界性的环境问题。本实验在天津滨海石油污染场地分离筛选出一株多环芳烃高效降解菌株W18,经过细胞形态、理化实验和分子生物学鉴定该菌株为嗜麦芽寡养单胞菌（Stenotrophomonas maltophilia）。在表面活性剂吐温80诱导下,该菌对荧蒽降解率可达到73%。利用细菌全基因组De novo测序技术发现,其包括1个环状拓扑结构,基因大小为4 738 432 bp,GC含量为66.69%。通过与主要数据库（COG, GO, KEGG）进行比对注释,发现W18菌株中有25个基因编码了与PAHs降解有关的加氧酶。嗜麦芽寡养单胞菌为土壤石油污染处理的研究提供菌种资源,对其降解功能基因的研究将为微生物-多环芳烃高效修复体系提供重要的理论依据。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 W18分子生物学鉴定
•   1.2 生长曲线测定及降解情况研究
•   1.3 基因组组装和基因组组分分析
•   1.4 基因通用功能注释
•     1.4.1 GO功能分类
•     1.4.2 KEGG代谢途径分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 菌种培养
•   3.2 培养基与试剂盒
•   3.3 实验仪器
•   3.4 菌种的鉴定及生长特性
•   3.5 菌种DNA提取
•   3.6 基因组测序及组装
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 关晶晶,王红旗,朱宜,许洁

关键词: 嗜麦芽寡养单胞菌,全基因组测序,荧蒽

来源: 基因组学与应用生物学 2019年07期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技,工程科技Ⅰ辑

专业: 生物学,环境科学与资源利用

单位: 北京师范大学水科学研究院城市水循环与海绵城市技术北京市重点实验室,北京市顺义区环境保护局

基金: 国家自然科学基金资助面上项目(41772234),青年科学基金项目(41807406)共同资助

分类号: X53;X172

DOI: 10.13417/j.gab.038.003037

页码: 3037-3045

总页数: 9

文件大小: 1696K

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