分子对接预测病毒表位的研究进展

论文摘要

分子对接技术是基于相互作用分子的结构特征,预测蛋白质或酶与配体相互作用细节和反应机制的方法。与一般的实验方法比较,其具有快捷、自动化、高通量、低成本和信息丰富等特点。至今,由于局限于有限的结构信息,特别是分子的相互作用,人们对诸多病毒被受体识别并感染细胞过程和产生免疫保护仍然缺乏详细的理论基础,同时许多病毒导致的疾病仍缺乏有效的疫苗或药物。另一方面利用实验方法进行病原体的研究需要消耗大量的资源和时间,如何加速病毒学相关的基因组学信息分析和新发突发病毒的药物开发等过程,分子对接技术起到了不可或缺的作用。本文主要概述了分子对接技术的理论、搜索算法、打分函数、准确性及其在病毒表位预测中的应用,为计算机模拟的病毒表位预测及疫苗或药物研发提供参考。

论文目录

• 1 分子对接的搜索算法
•   1.1 系统搜索
•   1.2 随机搜索
•   1.3 确定性搜索
• 2 分子对接的打分函数
•   2.1基于力场的评分函数
•   2.2 基于经验的评分函数
•   2.3 基于知识的评分函数
• 3 分子对接的准确性验证
• 4 分子对接技术在病毒表位预测中的应用
• 5 总结与展望

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李子真,黄洋,俞海,李少伟,夏宁邵

关键词: 分子对接,搜索算法,打分函数,表位预测,肽疫苗,病毒表位

来源: 中国病毒病杂志 2019年04期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学,基础医学

单位: 厦门大学生命科学学院国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心,厦门大学公共卫生学院分子疫苗学和分子诊断学国家重点实验室

基金: 国家自然科学基金(81571996),福建省自然科学基金(2017J07005)

分类号: R392

DOI: 10.16505/j.2095-0136.2019.0040

页码: 296-302

总页数: 7

文件大小: 183K

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