牛副流感病毒3型感染MDBK细胞后影响天然免疫基因表达的筛选与验证

牛副流感病毒3型感染MDBK细胞后影响天然免疫基因表达的筛选与验证

论文摘要

为筛选与验证牛副流感病毒3型(BPIV3)感染MDBK细胞后天然免疫相关基因的差异表达变化,通过细胞病变观察、Western blot验证病毒HN蛋白表达,以及病毒增殖复制动力学曲线,确定病毒复制情况。利用转录组测序技术,对1MOI基因C型SD2014BPIV3毒株感染MDBK细胞的12h对照组与感染组的差异表达基因进行筛选,最后收集BPIV3感染MDBK不同时间点细胞样本,应用RT-qPCR在转录水平验证了天然免疫相关显著差异基因的表达变化情况。结果表明,BPIV3毒株在MDBK细胞上有较强的复制能力,从病毒感染12h的转录组数据中获得了1 401个显著差异基因,经过筛选获得了9个与天然免疫相关的基因,最后在转录水平验证了MDA5、IRF7、STAT1、ISG65、TRIM25等9个与天然免疫相关基因的表达变化,并验证了其上、下游通路或同一家族基因的表达变化。结果表明,筛选与验证的BPIV3感染MDBK细胞差异表达天然免疫相关基因,为宿主细胞影响病毒复制的分子机制研究奠定了基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •     1.1.1 细胞与病毒
  •     1.1.2 主要试剂
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 细胞培养与病毒接种MDBK细胞病变观察
  •     1.2.2 Western blot检测
  •     1.2.3 BPIV3感染MDBK细胞一步增长曲线的测定
  •     1.2.4 转录组细胞总RNA的提取与转录组测序1MOI
  •     1.2.5 转录组数据分析
  •     1.2.6 RT-qPCR验证转录组筛选的天然免疫相关显著差异基因
  • 2 结果
  •   2.1 BPIV3在MDBK细胞上的复制情况
  •   2.2 转录组测序数据质量检测
  •   2.3 转录组差异基因筛选及GO与KEGG数据库注释、显著性富集分析
  •   2.4 BPIV3感染MDBK细胞后MDA5与IRFs的mRNA表达变化
  •   2.5 BPIV3感染MDBK细胞后IFN-β1和ISGF3mRNA表达变化
  •   2.6 BPIV3感染MDBK细胞后ISGs mRNA表达
  •   2.7 BPIV3感染MDBK细胞后TRIM家族和USP家族相关成员mRNA表达变化
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 赵贵民,吕丽霞,王洪梅,乔军,夏咸柱,何洪彬

    关键词: 牛副流感病毒型,牛肾上皮细胞,转录组学,天然免疫,筛选

    来源: 动物医学进展 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 石河子大学动物科技学院,山东师范大学反刍动物疾病研究中心,军事科学院军事医学研究院军事兽医研究所

    基金: 泰山学者攀登计划专家(何洪彬)项目,国家自然科学基金项目(31872490,31672556),山东省重点研发计划(2018GNC113011),国家重点研发计划项目(2018YFD0501600)

    分类号: S852.653

    DOI: 10.16437/j.cnki.1007-5038.2019.02.002

    页码: 9-16

    总页数: 8

    文件大小: 415K

    下载量: 171

    相关论文文献

    • [1].牛病毒性腹泻病毒感染MDBK细胞后差异表达基因分析[J]. 中国生物制品学杂志 2019(03)
    • [2].间接共培养下柔嫩艾美耳球虫对MDBK细胞凋亡抑制的研究[J]. 中国兽医杂志 2017(11)
    • [3].分泌表达牛病毒性腹泻病毒E0蛋白MDBK细胞的稳定性分析[J]. 生物技术通讯 2017(06)
    • [4].牛病毒性腹泻/黏膜病毒敏感MDBK细胞克隆与鉴定[J]. 畜牧兽医科学(电子版) 2019(01)
    • [5].羊口疮病毒感染MDBK细胞的电子显微镜观察[J]. 黑龙江畜牧兽医 2018(01)
    • [6].慢病毒介导的bta-miR-222稳定过表达MDBK细胞株的构建及鉴定[J]. 中国兽医科学 2019(01)
    • [7].稳定表达小反刍兽疫病毒受体Nectin-4的MDBK细胞系的建立[J]. 农业生物技术学报 2018(10)
    • [8].冷热应激对牛PBMC和MDBK细胞活力及HSP70表达的影响[J]. 中国兽医学报 2018(07)
    • [9].山羊副流感病毒3型感染MDBK细胞的转录组分析[J]. 畜牧兽医学报 2019(02)
    • [10].IBRV在MDBK细胞中的增殖规律研究[J]. 黑龙江畜牧兽医 2016(13)
    • [11].柔嫩艾美耳球虫裂殖子对侵入细胞凋亡抑制通路的研究[J]. 中国兽医杂志 2016(01)
    • [12].MiR-222对山羊副流感病毒3型复制的影响[J]. 畜牧兽医学报 2018(12)
    • [13].江苏省羊口疮病毒的分离鉴定及B2L基因的遗传进化分析[J]. 中国畜牧兽医 2017(04)
    • [14].不同毒力牛传染性鼻气管炎病毒感染MDBK细胞的差异蛋白组学[J]. 中国兽医学报 2016(10)

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    牛副流感病毒3型感染MDBK细胞后影响天然免疫基因表达的筛选与验证
    下载Doc文档

    猜你喜欢