十字花科植物DFR蛋白的生物信息学分析

论文摘要

采用生物信息学的方法分析已经在GenBank上注册十字花科植物的DFR基因序列及相应氨基酸序列,并对其理化性质、结构特征、系统进化关系等进行预测。结果表明,十字花科植物的DFR蛋白大部分都有6个外显子,分子质量36 481.89～43 129.21 Da,大多数蛋白亚细胞定位于叶绿体中;除了BnaDFRA402,其他的DFR蛋白均具有酶活性部位、NADP结合位点和底物特异结合位点,这些保守区域形成了5个motifs;每个DFR蛋白均有多个磷酸化位点,以Ser为主,以Thr和Tyr磷酸化为辅;二级结构均由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成,其中α-螺旋为主要结构元件。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 数据获取
•   1.2 DFR蛋白质序列分析及亚细胞定位
•   1.3 DFR蛋白质保守结构域与磷酸化位点分析
•   1.4 DFR蛋白质二级结构分析
•   1.5 DFR蛋白质同源性比较及进化分析
• 2 结果与分析
•   2.1 DFR蛋白序列分析及亚细胞定位
•   2.2 蛋白质保守结构域与磷酸化位点分析
•   2.3 DFR蛋白的二级结构预测
•   2.4 DFR蛋白质同源性比较分析
•   2.5 DFR蛋白质系统进化树的构建
• 3 结论与讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 胡燕,尹明智,匡光炼,黄杰,严秋香

关键词: 十字花科,花青素,蛋白,生物信息学

来源: 安徽农业科学 2019年17期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 遵义师范学院生物与农业科技学院

基金: 国家自然科学基金项目(31501337),贵州省科学技术厅,遵义市科学技术局,遵义师范学院联合科技基金项目(黔科合LH字[2016]7014号),贵州省高层次创新型人才培养计划(遵市科合人才[2017] 11号),贵州省高等学校创新能力提升计划(黔教合协同创新字[2013]11)

分类号: Q946.1

页码: 103-107+110

总页数: 6

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