SPF鸡和商品蛋鸡粪便菌群及大肠杆菌抗药性的比较分析

论文摘要

通过粪菌移植可以调节肠道菌群的组成,已成为降低肠道菌群抗药性的方法之一,而筛选合适的粪菌移植供体尤为重要。本研究利用16S rRNA基因高通量测序技术分析了两种候选供体SPF鸡和商品蛋鸡在不同养殖模式下5个不同日龄粪便菌群的组成,并利用药物敏感性试验比较了粪便中大肠杆菌的抗药性水平。结果表明,两种蛋鸡粪便菌群的丰富度都表现出随日龄增加而增加的趋势,其中商品蛋鸡粪便菌群的种类更加丰富,而SPF鸡粪便菌群的组成更加均一。在门水平上,SPF鸡拥有更多的厚壁菌门细菌,而商品蛋鸡含有更多的变形菌门、拟杆菌门和放线菌门细菌。在属水平上,两种蛋鸡粪便中的优势菌均为乳酸杆菌属和埃希氏-志贺氏菌属,其中SPF鸡存在更多的乳酸菌属和隐秘杆菌属,而商品蛋鸡含有更多的拟杆菌属、假单胞菌属、不动杆菌属、梭菌属、链球菌属和克雷伯菌属。药敏试验结果表明,SPF鸡粪便中大肠杆菌对抗生素的抗药率、多重抗药性比例和最低抑菌浓度（MIC）的频率分布均显著低于商品蛋鸡。该结果深入分析了两种养殖模式下不同日龄蛋鸡的粪便菌群,结合粪便中大肠杆菌抗药性水平的比较分析,进一步表明SPF鸡粪便菌群更加安全、敏感,可以作为粪菌移植的供体用于降低肠道菌群的抗药性。

论文目录

• 1 方法与材料
•   1.1 样品采集
•   1.2 粪样DNA抽提和PCR扩增
•   1.3 Illumina Miseq测序
•   1.4 数据处理
•   1.5 大肠杆菌的分离鉴定和药敏试验
•   1.6 生物信息学和数据统计分析方法
• 2 结果
•   2.2 SPF鸡粪便菌群丰富度低于商品蛋鸡, 但组成更加均一
•   2.3 两种蛋鸡粪便菌群在门
•   2.4 SPF鸡粪便中大肠杆菌的抗药性水平低于商品蛋鸡
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 朱见深,王曦,张印,王怀中,张庆,骆延波,李璐璐,胡明,戴美学,刘玉庆,齐静

关键词: 商品蛋鸡,粪便菌群,抗药性

来源: 家禽科学 2019年05期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室,山东大学生命科学学院,山东师范大学生命科学学院

基金: 国家自然科学基金面上项目(31672609),中国国家留学基金(CSC NO.201909370004),山东省政府公派出国留学项目(No.201802018),山东省农业科学院农业科技创新工程(CXGC2017A01,CXGC2018E10),中央引导地方科技发展专项资金项目(家禽及涉牧人员共患病原菌的抗药性监测与控制技术研究)

分类号: S852.61

页码: 3-10

总页数: 8

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