典型草原与锡林河湿地反硝化细菌群落的空间分布及热区研究

典型草原与锡林河湿地反硝化细菌群落的空间分布及热区研究

论文摘要

典型草原与锡林河湿地是我国北方重要的生态屏障及国际研究的热点区域。反硝化菌是氮素生物地球化学循环的重要参与者,其类群及分布热区关系到温室气体的源汇转化及减排效能,但关于反硝化菌在典型草原与锡林河湿地分布情况的研究十分匮乏。本研究基于16S rRNA基因文献计量学构建反硝化细菌参比库,选取河床中心R1与边缘R2、低河漫滩W1与高河漫滩W2、羊草草原T1与大针茅草原T2等6个样带沉积物/土壤,通过16S rRNA和nirS基因高通量测序及生物信息学分析反硝化菌群组成、丰度、分布热区及理化因子对反硝化菌群分布热区的驱动机制。主要研究结果如下:(1)反硝化细菌参比库共包含65个属,典型草原与锡林河湿地包含33个反硝化细菌属,隶属于系统发育分支中的变形菌门、放线菌门、厚壁菌门和拟杆菌门,变形菌门是最优势的分支。(2)16S rRNA和nirS测序得到的反硝化菌群沿R1与R2、W1与W2、T1与T2样带总体呈现先升高后降低的分布趋势,并在低河漫滩W1样带达到峰值。R与W样带反硝化细菌均以共享类群为主,表现出反硝化菌群的高度相似性。(3)R1、R2、W1、W2、T2样带依次是硫杆状菌属与索氏菌属、生丝微菌属与红球菌属、黄杆菌属与气单胞菌属、鞘氨醇单胞菌属与戴尔福特菌属、链霉菌属与短杆菌属空间分布的热区;而芽孢杆菌属和寡养单胞菌属等反硝化细菌交错分布在R、W及T样带,未表现出明显的热区特征。(4)锡林河沉积物及湿地土壤是黄杆菌属和戴尔福特菌属的热区,主要由含水量、pH值、沙粒含量正向驱动;羊草及大针茅草原土壤是链霉菌属与短杆菌属的热区,主要由有机质、总氮、总磷等环境因子正向驱动。该研究结果不仅能弥补人们对内蒙古典型草原与锡林河湿地沉积物/土壤反硝化菌群空间异质性及热区认识的不足,亦能为不同空间尺度上草原退化及湿地萎缩的早期预警提供科学依据。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 一 绪论
  •   1.1 典型草原与锡林河湿地热区的研究进展及意义
  •   1.2 反硝化菌群在氮循环研究中的地位和作用
  •     1.2.1 反硝化作用及微生物
  •     1.2.2 反硝化菌的分类
  •     1.2.3 反硝化酶系及功能基因
  •     1.2.4 反硝化菌多样性研究方法
  •     1.2.5 反硝化菌多样性研究进展
  •   1.3 反硝化菌热区及其对环境因子的响应
  •   1.4 研究的目的与意义
  •   1.5 技术路线
  • 二 材料与方法
  •   2.1 样品的采集、处理与保存
  •   2.2 样品理化指标测定
  •   2.3 样品总DNA提取
  •   2.4 样品16S rRNA和 nirS基因的PCR扩增
  •   2.5 样品PCR产物纯化、定量及高通量测序
  •   2.6 反硝化菌参比数据库的构建
  •   2.7 数据处理
  • 三 结果与分析
  •   3.1 典型草原与锡林河湿地沉积物/土壤理化性质
  •   3.2 典型草原与锡林河湿地沉积物/土壤DNA提取结果
  •   3.3 典型草原与锡林河湿地沉积物/土壤PCR电泳结果
  •   3.4 典型草原与锡林河湿地沉积物/土壤样品测序结果分析
  •     3.4.1 基于16S rRNA基因的测序结果
  •     3.4.2 基于nirS基因的测序结果
  •   3.5 反硝化细菌库及系统发育分析
  •   3.6 反硝化细菌群落结构组成、丰度及空间分布特征
  •     3.6.1 基于16S rRNA基因的反硝化菌群空间分布特征
  •     3.6.2 nirS型反硝化菌群的空间分布特征
  •   3.7 典型草原与锡林河湿地反硝化细菌群落的β多样性分析
  •     3.7.1 基于16S rRNA基因的反硝化菌群β多样性分析
  •     3.7.2 nirS型反硝化菌群的β多样性分析
  • 四 典型草原与锡林河湿地反硝化菌群的空间异质性成因及热区研究
  •   4.1 反硝化细菌群落结构与环境因子的相关性分析
  •     4.1.1 基于16S rRNA基因的反硝化细菌群落结构与环境因子相关性分析
  •     4.1.2 nirS型反硝化细菌群落结构与环境因子的相关性分析
  •   4.2 反硝化细菌群落结构的热区研究
  • 五 讨论
  •   5.1 反硝化细菌生态学研究方法学解析
  •   5.2 典型草原与锡林河湿地反硝化细菌群落的空间异质性成因分析
  •   5.3 典型草原与锡林河湿地反硝化细菌群落的组装机制
  • 六 结论与展望
  •   6.1 主要结论
  •   6.2 展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 攻读学位期间发表的学术论文目录
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 芦燕

    导师: 赵吉

    关键词: 反硝化菌群,空间分布,热区,驱动力,典型草原,锡林河湿地

    来源: 内蒙古大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 生物学,环境科学与资源利用

    单位: 内蒙古大学

    基金: 国家自然科学基金项目——蒙古高原河流湿地厌氧氨氧化及反硝化菌群空间异质性与脱氮特征研究(41361053),(31160129),(31660724),内蒙古自治区自然科学基金项目——宏基因组策略解析乳房-肠道-环境菌群与奶牛乳房炎关联性](2016MS0331),(2011MS0603),(2015MS0306)

    分类号: X171;Q938

    总页数: 59

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