导读:本文包含了代谢网络论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:网络,针灸,模型,骨关节炎,罗勒,基因组,风湿性关节炎。
代谢网络论文文献综述
叶超,徐楠,陈修来,刘立明[1]（2019）在《应用代谢网络模型解析工业微生物胞内代谢》一文中研究指出为了快速、高效地理解工业微生物胞内代谢特征,寻找潜在的代谢工程改造靶点,基因组规模代谢网络模型(GSMM)作为一种系统生物学工具越来越受到人们的关注。文中在回顾GSMM 20年发展历程的基础上,分析了当前GSMM的研究现状,总结了GSMM的构建及分析方法,从预测细胞表型和指导代谢工程两个方面阐述了GSMM在解析工业微生物胞内代谢中的应用,并展望了GSMM未来的发展趋势。(本文来源于《生物工程学报》期刊2019年10期）
薛倩倩,刘月涛,秦雪梅[2]（2019）在《代谢组学结合网络药理学技术探讨黄芪-丹参药对预防大鼠脑缺血的药效机制》一文中研究指出目的利用代谢组学结合网络药理学技术研究黄芪-丹参药对预防大鼠脑缺血的药效机制。方法通过线栓法复制大鼠脑缺血模型,采用Longa法和TTC染色法评价黄芪-丹参药对模型大鼠的药效影响。采用NMR技术分析实验大鼠血清的代谢轮廓,寻找与药效相关的差异代谢物,并预测相关靶点。另外,采用网络药理学的技术预测黄芪-丹参药对治疗脑缺血的潜在作用靶点。结合2部分获得的靶点,进行蛋白-蛋白相互作用分析,找寻黄芪-丹参药对治疗脑缺血的重要靶点。结果行为学评价和TTC染色结果表明,黄芪-丹参药对可以显着改善脑缺血的损伤。通过代谢组学技术得到12个代谢物与脑缺血损伤密切相关,其中脂质、N-乙酰化糖蛋白、肌酸、α-葡萄糖、β-葡萄糖、丙酮酸、甘氨酸和肌苷8个代谢物在给药后有显着回调,并预测得到71个与回调代谢物相关的靶点。另外,通过网络药理学技术找到了58种潜在活性成分,并预测了84个与脑缺血相关的潜在靶点。最终通过蛋白-蛋白相互作用网络得到了排名前五的重要靶点为MAPK1,AKT1,MAPK8,VEGFA和STAT3。结论黄芪-丹参药对可以预防脑缺血带来的损伤,代谢组学和网络药理学发现其作用的机制可能与MAPK1,AKT1,MAPK8,VEGFA和STAT3靶点有关,为进一步预防和治疗脑缺血提供了依据。(本文来源于《中国药理学与毒理学杂志》期刊2019年10期）
周文婷,季志红,阿尔祖亚·多力空,阿地力江·萨吾提,艾尼瓦尔·吾买尔[3]（2019）在《基于~1H-NMR代谢组学及网络药理学方法研究罗勒黄酮类活性成分对ApoE~(-/-)模型小鼠的影响》一文中研究指出目的利用~1H-NMR代谢组学方法探讨罗勒总黄酮对ApoE~(-/-)基因缺陷动脉硬化模型小鼠的影响,并通过网络药理学方法研究罗勒黄酮类活性成分在心血管疾病中的作用及其机制。方法 6周龄雄性ApoE~(-/-)小鼠随机分成5组:模型组、辛伐他汀组、罗勒总黄酮低剂量组、罗勒总黄酮中剂量组、罗勒总黄酮高剂量组,高脂饲料喂养;C57BL/6J雄性小鼠作为正常对照组,普通饲料喂养。灌胃14周后,小鼠血清进行~1H-NMR检测,采用PLS-DA和OPLS-DA方法对~1H-NMR图谱进行分析,确定各组小鼠血清主要差异性代谢物;HE染色观察胸主动脉病理改变。从不同开源数据库中收集罗勒黄酮类活性成分,预测和筛选出活性成分的作用靶点及其作用的信号通路,构建成分-靶点-疾病网络。结果与正常对照组相比较,模型组小鼠血清中脂类、VLDL、LDL、脯氨酸、β-羟丁酸、甲胺、肌醇、β-葡萄糖和α-葡萄糖的含量增多(P<0.05);亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸、丙氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、赖氨酸、牛磺酸、乳酸、肉碱、胆碱、柠檬酸、丙酮酸和肌酸的水平有不同程度下降(P<0.05)。经网络药理学研究筛选得到9种罗勒黄酮类活性成分,通过成分-靶点-疾病网络的拓扑分析,发现有25个作用靶点与心脏病、高血压,心肌梗死和动脉粥样硬化等心血管疾病关联度较高。结论与模型组相比较,罗勒总黄酮低、中、高剂量组对上述血清代谢物具有一定程度逆转趋势,表明罗勒总黄酮可能通过调控ApoE~(-/-)动脉粥样硬化模型小鼠的脂、糖、氨基酸、胆固醇及能量代谢,从而对动脉硬化病病程发展起到一定抑制作用。罗勒中9种黄酮类活性成分主要通过DYRK1A, SLC5A11, SLC5A10, SLC5A9,ERBB2, MBNL3, MBNL2和AKR1E2等不同靶点,经CGMP-PKG信号通路、钙信号通路和甘油脂代谢等途径作用于心脏病、高血压,心肌梗死和动脉粥样硬化等心血管疾病。(本文来源于《中国药理学与毒理学杂志》期刊2019年09期）
袁帅,庞广昌[4]（2019）在《不同温度对弓鲤鱼与弓鲇鱼乳酸盐代谢网络通量的影响》一文中研究指出本研究以鲤鱼和鲇鱼为实验材料,利用弓鱼技术研究不同温度对鱼类中心代谢网络通量的影响以及弓鱼在最适温度下离水存活的时间,并探究低温诱导鲤鱼与鲇鱼进入休眠以及实现活鱼离水贮运的可行性。将弓鲤鱼和弓鲇鱼分别放置于0、4、6、10、15℃不同温度下(每个温度采用梯度降温),测定不同温度下弓鲤鱼与弓鲇鱼血清中糖酵解途径、叁羧酸循环和磷酸戊糖途径的代谢通量。结果显示,鲤鱼在6℃、鲇鱼在4℃时的中心代谢途径中代表合成代谢的戊糖途径通量最高;而代表分解代谢和呼吸强度的乳酸盐代谢通量最低,因此判定6℃和4℃分别为鲤鱼和鲇鱼的最优贮运温度,且可分别作为诱导鲤鱼与鲇鱼进入休眠的最适温度。进而在最适温度下进行存活实验,结果显示,在6℃时鲤鱼离水存活时间平均可达48.93h,最长存活时间为77h;在4℃时鲇鱼离水存活时间平均可达38.14h,最长存活时间为70h。以上结果表明,活鱼的离水贮藏运输是完全可行的,同时本实验为诱导鱼类进入冬眠或休眠提供新的方法和理论基础。(本文来源于《食品科学》期刊2019年17期）
徐斌[5]（2019）在《从针灸调控糖脂代谢网络研究分析针灸医学的发展策略》一文中研究指出结合糖脂代谢网络调控研究的新进展,介绍了针灸减肥网络机制研究的3个可能路径,以及神经刺激对针灸医学发展的影响。认为应该将针灸研究中观察到的网络调控现象提升到发现糖脂代谢调控新机制的层次,主要是从网络互作集成、组织间应答协调方面去发现针灸调控机体的独特机制,"穴位-网络-靶点"的研究路径,可能才是完善、发展针灸医学的策略。(本文来源于《南京中医药大学学报》期刊2019年05期）
李忆涛,桑潮,梁丹丹,陈天璐[6]（2019）在《基于贝叶斯网络的典型关节炎代谢谱研究》一文中研究指出目的比较类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者及痛风性关节炎(gout arthritis,GA)患者与正常对照组之间血清代谢谱的差异,构建两种关节炎共有和特有代谢物的贝叶斯网络模型。方法采用液相色谱质谱和气相色谱质谱技术检测27例RA患者及34例GA患者和60例正常对照者血清代谢产物,识别RA及GA的潜在生物标志物;构建基于贪婪搜索算法的两种关节炎特有和共有代谢物的贝叶斯网络图。结果 RA及GA组与正常对照组血清代谢物存在明显差异,基于单元及多元统计方法,RA组筛选出34个差异代谢物,GA组筛选出41个差异代谢物,其中两种关节炎共有的差异代谢物14个;基于上述代谢物构建的贝叶斯网络揭示了不同代谢物之间可能存在的因果关系。结论相比于代谢组学传统的多元统计学方法,贝叶斯网络能良好反映疾病差异代谢物之间存在的因果关系,在代谢组学中具有较好的应用前景。(本文来源于《转化医学杂志》期刊2019年04期）
吴衍,张西,张洁,张雪芹,申河清[7]（2019）在《基于液相色谱-质谱联用技术的妊娠期糖尿病患者脐带血代谢组学网络分析》一文中研究指出妊娠期糖尿病(GDM)患病率呈现逐年上升的趋势,探究其对母婴之间代谢影响变得尤为重要。该研究基于液相色谱-质谱的代谢组学技术,分析GDM条件下脐带血血清代谢组的变化。采用正交偏最小二乘判别分析模型(OPLS-DA)与网络模型结合进行分析。结果表明代谢标志物花生四烯酸(AA)为关键代谢网络节点。通路分析显示,GDM会引起不饱和脂肪酸代谢异常,而该通路变化可能是GDM影响母婴代谢的重要分子机制。该文建立的代谢组学网络分析方法为研究GDM母婴间代谢变化提供了新的思路。(本文来源于《色谱》期刊2019年08期）
赵欣,杨雪,毛志涛,马红武[8]（2019）在《基于酶约束的代谢网络模型研究进展及其应用》一文中研究指出基因组尺度代谢网络模型已经成功地应用于指导代谢工程改造,但由于传统通量平衡分析法仅考虑化学计量学和反应方向约束,模拟得到的是理论最优结果,对一些现象如代谢溢流、底物层级利用等无法准确描述。近年来人们通过在代谢网络模型中引入新的蛋白量、热力学等约束发展了新的约束优化计算方法,可以更准确真实地模拟细胞在不同条件下的代谢行为。文中主要对近年来提出的多种酶约束模型进行评述,对酶约束引入的基本思路、酶约束的数学方程表示及优化目标设定、引入酶约束后对代谢通量计算结果的影响及酶约束模型在代谢工程菌种改造中的应用等进行了全面深入的介绍,并提出了已有各种方法存在的主要问题,展望了相关方法的未来发展方向。通过引入新的约束,代谢网络模型能够更精确模拟和预测细胞在环境和基因扰动下的代谢行为,为代谢工程菌种改造提供更准确可靠的指导。(本文来源于《生物工程学报》期刊2019年10期）
刘炳春,齐鑫,王庆山[9]（2019）在《北京城市代谢预测研究——基于长短期记忆神经网络模型》一文中研究指出城市化进程提升促使城市环境污染加剧、能源消耗激增、人口密度过大等问题的深层次原因在于城市代谢失调。为精准预测北京市城市代谢变化趋势,论文通过能源消费量及人类活动时间指标测算了1980—2016年北京市体外能代谢率,表征城市代谢程度。据此运用长短期记忆神经网络模型(LSTM)预测了2017—2022年北京各部门体外能代谢率。结果表明:①基于长短期记忆神经网络的城市代谢预测模型精度较高,能够对北京各部门体外能代谢率进行更为精准的预测;②2017—2022年间,北京第一产业和总体外能代谢率呈下降趋势,其中第一产业在2017年达到峰值,第二、第叁产业及生活部门体外能代谢率将呈现增长趋势。③除第一、第叁产业和总体外能代谢率外,历史变化的时间扰动幅度先小后大。④对各部门体外能代谢率EMRT的影响贡献度最大的因子为第二产业体外能代谢率EMR2,最小的为第一产业体外能代谢率EMR1。论文研究结果可为政策制定者优化城市管理方案、提升城市综合实力提供理论依据和决策支持。(本文来源于《地理科学进展》期刊2019年06期）
肖延成,王培民,徐波,殷松江,张力[10]（2019）在《异常代谢网络调控膝骨关节炎的研究进展》一文中研究指出膝骨关节炎(Osteoarthritis,KOA)是一种以膝关节软骨退变及软骨下骨质增生为特征的慢性炎症性关节病,发病率与致残率逐年增加。有研究发现~([1,2]),高血压、糖尿病、血脂异常等代谢因素与膝骨关节炎显着相关,存在代谢因素异常的膝骨关节炎患者比单纯的膝骨关节炎患者的病情更加严重。表明代谢网络异常在某种程度上可以形成与膝骨关节炎类似的炎症内环境促进膝骨关节炎的发病进程,因此有研究者将膝骨关节炎归入代谢综合征(Metabolic Sv(本文来源于《中国中医骨伤科杂志》期刊2019年06期）
代谢网络论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的利用代谢组学结合网络药理学技术研究黄芪-丹参药对预防大鼠脑缺血的药效机制。方法通过线栓法复制大鼠脑缺血模型,采用Longa法和TTC染色法评价黄芪-丹参药对模型大鼠的药效影响。采用NMR技术分析实验大鼠血清的代谢轮廓,寻找与药效相关的差异代谢物,并预测相关靶点。另外,采用网络药理学的技术预测黄芪-丹参药对治疗脑缺血的潜在作用靶点。结合2部分获得的靶点,进行蛋白-蛋白相互作用分析,找寻黄芪-丹参药对治疗脑缺血的重要靶点。结果行为学评价和TTC染色结果表明,黄芪-丹参药对可以显着改善脑缺血的损伤。通过代谢组学技术得到12个代谢物与脑缺血损伤密切相关,其中脂质、N-乙酰化糖蛋白、肌酸、α-葡萄糖、β-葡萄糖、丙酮酸、甘氨酸和肌苷8个代谢物在给药后有显着回调,并预测得到71个与回调代谢物相关的靶点。另外,通过网络药理学技术找到了58种潜在活性成分,并预测了84个与脑缺血相关的潜在靶点。最终通过蛋白-蛋白相互作用网络得到了排名前五的重要靶点为MAPK1,AKT1,MAPK8,VEGFA和STAT3。结论黄芪-丹参药对可以预防脑缺血带来的损伤,代谢组学和网络药理学发现其作用的机制可能与MAPK1,AKT1,MAPK8,VEGFA和STAT3靶点有关,为进一步预防和治疗脑缺血提供了依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
代谢网络论文参考文献
[1].叶超,徐楠,陈修来,刘立明.应用代谢网络模型解析工业微生物胞内代谢[J].生物工程学报.2019
[2].薛倩倩,刘月涛,秦雪梅.代谢组学结合网络药理学技术探讨黄芪-丹参药对预防大鼠脑缺血的药效机制[J].中国药理学与毒理学杂志.2019
[3].周文婷,季志红,阿尔祖亚·多力空,阿地力江·萨吾提,艾尼瓦尔·吾买尔.基于~1H-NMR代谢组学及网络药理学方法研究罗勒黄酮类活性成分对ApoE~(-/-)模型小鼠的影响[J].中国药理学与毒理学杂志.2019
[4].袁帅,庞广昌.不同温度对弓鲤鱼与弓鲇鱼乳酸盐代谢网络通量的影响[J].食品科学.2019
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[7].吴衍,张西,张洁,张雪芹,申河清.基于液相色谱-质谱联用技术的妊娠期糖尿病患者脐带血代谢组学网络分析[J].色谱.2019
[8].赵欣,杨雪,毛志涛,马红武.基于酶约束的代谢网络模型研究进展及其应用[J].生物工程学报.2019
[9].刘炳春,齐鑫,王庆山.北京城市代谢预测研究——基于长短期记忆神经网络模型[J].地理科学进展.2019
[10].肖延成,王培民,徐波,殷松江,张力.异常代谢网络调控膝骨关节炎的研究进展[J].中国中医骨伤科杂志.2019
论文知识图
