闽西地区猪流行性腹泻病毒N基因分子进化及序列分析

论文摘要

分析闽西地区猪流行性腹泻病毒（PEDV）N基因的遗传进化特征,收集闽西地区猪流性腹泻病例组织样品8份,用逆转录PCR（RT-PCR）扩增N基因,连接至pMD-18T载体进行测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及遗传进化分析。结果显示,8株闽西流行毒株之间N基因核苷酸的同源性为9.8%～100.0%,推导的氨基酸序列的同源性为99.5%～100.0%,而闽西毒株与早期疫苗毒株CV777和SM98的同源性较远。氨基酸序列分析表明,闽西毒株氨基酸序列存在15处突变,与2010年后中国流行毒株变异位点相同。提示闽西地区毒株为目前国内流行毒株,与疫苗毒株亲缘关系较远,可能导致机体针对疫苗毒株产生的抗体不能够有效抵抗变异毒株,不能给猪群提供很好的免疫保护,因此需要基于变异毒株研究出有针对性的疫苗来预防PEDV。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 样品
•   1.2 主要试剂
•   1.3 提取病毒总RNA及逆转录
•   1.4 E基因的扩增
•   1.5 重组质粒的构建和鉴定
•   1.6 序列分析
• 2 结果与分析
•   2.1 N基因的扩增、纯化、克隆及测序
•   2.2 N基因的序列比对及同源性分析
•   2.3 N基因的氨基酸结构特征
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 董波,李静楠,曹雪珍,安永帅,戴爱玲,李晓华,杨小燕

关键词: 猪流行性腹泻病毒,基因,遗传分析

来源: 江苏农业科学 2019年17期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 龙岩学院生命科学学院,福建省生猪疫病防控工程技术研究中心,华南农业大学兽医学院

基金: 福建省高校自然基金青年重点项目(编号:JZ160481),福建省教育厅中青年科技项目(编号:JAT160483)

分类号: S852.651

DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.17.014

页码: 59-62

总页数: 4

文件大小: 289K

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