深度测序解析年龄及UCMSC治疗对猕猴lncRNA的影响

深度测序解析年龄及UCMSC治疗对猕猴lncRNA的影响

论文摘要

目的分析年龄和脐带间充质干细胞(UCMSC)治疗对外周血单个核细胞长链非编码RNA(lncRNA)的影响。方法分别采集、分离幼年、中年、老年和老年经UCMSC治疗后的4种不同生理状态的猕猴外周血单个核细胞,提取全基因组RNA,进行转录组测序,通过生物信息学比较筛选出差异lncRNA并进行分组比较。结果幼年与老年、中年相比,单个核细胞表达上调的lncRNA分别为54和52个,表达下调的lncRNA分别为49和46个;中年与老年相比,表达上调和下调的lncRNA分别为48和63个;老年与经UCMSC治疗组相比,表达上调和下调的lncRNA分别为41和68个。聚类分析发现,随年龄增长,幼年高表达lncRNA减少,而低表达lncRNA增加;UCMSC治疗可使低表达lncRNA升高,而高表达lncRNA降低。结论lncRNA表达谱随年龄的增加而改变,UCMSC治疗可使衰老状态的lncRNA表达谱趋向年轻化方向。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验动物及分组
  •   1.2 UCMSC来源及治疗
  •   1.3 外周血单个核细胞的采集及处理
  •   1.4 LncRNA转录组测序及数据分析
  • 2 结果
  •   2.1 测序数据统计
  •   2.2 LncRNA类型分布及主成分分析
  •   2.3 基因表达量分析
  •   2.4 聚类分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 朱向情,陈裕浩,王严影,高萌,潘兴华

    关键词: 长链非编码,猕猴,年龄,脐带间充质干细胞,单个核细胞

    来源: 西南国防医药 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 解放军920医院细胞生物治疗中心干细胞与免疫细胞生物医药技术国家地方联合工程实验室云南省细胞治疗技术转化医学重点实验室昆明医科大学昆明总医院临床学院,贵州医科大学组织工程与干细胞实验室,南方医科大学第三附属医院

    基金: 云南省科技计划重大专项(2018ZF007),云南省基础研究计划(2017FB042),云南省中青年后备人才项目(2018HB002)

    分类号: R339.38;R-332

    页码: 640-643

    总页数: 4

    文件大小: 298K

    下载量: 42

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