导读:本文包含了扇贝科论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:岩扇贝,COⅠ基因,16S,rRNA,密码子偏好性
扇贝科论文文献综述
曹善茂,朱丽洁,聂鸿涛,印明昊,刘钢[1]（2019）在《基于16S和COⅠ基因探讨岩扇贝在扇贝科中的分类地位》一文中研究指出采用PCR扩增和序列测定等技术,对岩扇贝(Crassadoma gigantea)线粒体DNA 16S rRNA和COⅠ基因片段进行初步研究,得到16S rRNA基因片段的大小在613.0～634.0 bp之间,A、T(U)、G、C的平均含量分别为26.5%、29.7%、24.5%、19.3%;COⅠ基因片段的大小为660 bp,碱基A、T、G、C的平均含量分别为17.2%、40.3%、27.2%、15.3%。16S基因在岩扇贝中偏好使用GUU、UUG、AUU、ACG、UAU、CAA、GAG、UUU、UCU、GAU、GGU、GAG、AGG和GGA等25个密码子。COⅠ系统进化树表明,与岩扇贝亲缘关系最近的是柿孔扇贝(Azumapecten farreri),其次是冰岛扇贝(Chlamys islandica)。16S系统进化树亲缘关系由近到远依次是北美扇贝(Patinopecten caurinus)、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)、Chlamys islandica。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年07期）
胡丽萍,黄晓婷,张玲玲,陆维,包振民[2]（2013）在《扇贝科染色体研究进展》一文中研究指出扇贝科(Pectinidae)有300多个现存种,是双壳贝类中重要的一支,广泛分布于世界的各大洋中,并且具有重要的经济价值[1]。栉孔扇贝(Chlamys farreri)、海湾扇贝(Argopecten irradians irradians)、虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)、华贵栉孔扇贝(Mimachlamys nobilis)是我国主要的扇贝养殖种类,养殖年产量达120万t多,居世界首位。随着近年来扇贝养殖业的快速发展,其遗传育种研究取得显着成果,细胞遗传学是遗传育种研究的基础,也是开展遗传育种工作的重要理论依据。扇贝的细胞遗传学研究主要涉及核型分析、染色体鉴别、细胞遗传学图构建以及染色体结构和功能分析。由于扇贝染色体数目多,形态接近,很难从形态上区分不同的染色体,这在较长一段时期内,阻碍着细胞遗传学(本文来源于《海洋科学》期刊2013年08期）
魏晓华[3]（2004）在《栉孔扇贝和海湾扇贝的群体遗传多样性研究及扇贝科几种贝类的分子系统学研究》一文中研究指出本文采用聚合酶链式反应(PCR)技术对栉孔扇贝(Chlamys farreri)大连、青岛、长岛、朝鲜及日本5个自然群体89个个体的核糖体转录间隔子序列(ITS-1)进行了扩增。PCR产物纯化后经T载体连接进行了克隆、测序，排序后得到长度为306bp(不含引物)的序列，A，T，G，C含量分别为33.1％、21.3％、20.6％、25.0％，AT含量高于GC含量。MEGA软件检测到44个变异位点，其中有8个插入／缺失突变的的核苷酸位点，36个转换或颠换核苷酸位点，其中3个位点(60、213、215)转换与颠换同时存在，共51种单倍型。5个群体中朝鲜群体拥有的单倍型最丰富，为18个，而且拥有最多的多态性核苷酸位点，长岛群体、日本群体和青岛群体的单倍型数分别为16个、13个和13个，大连群体的单倍型最少，为9个。各群体遗传距离在0.006～0.009之间。在多态位点数S、平均核苷酸差异数K和核苷酸多样性指数Pi叁个指标上，朝鲜群体的值相对较高，长岛群体次之，其次为日本群体、青岛群体，大连群体最低。用AMOVA软件计算出群体间差异为2.69％，群体内部差异为97.31％，表明主要的遗传变异来自于群体内部。利用ITS-1序列构建的UPGMA分子系统树显示各群体没有明显的聚类。结果表明5个群体中以朝鲜群体的遗传多样性最高，其次为长岛群体、日本群体、青岛群体，大连群体最低；不同自然分布区的栉孔扇贝未出现明显的遗传分化。 本研究对取自山东青岛地区的海湾扇贝(Argopecten irradians)养殖群体的核糖体基因转录间隔子ITS-1序列进行了PCR扩增，得到了300bp左右的清晰带，扩增产物转入T载体后进行了克隆、测序。海湾扇贝ITS-1序列排序后长度为323bp(不含引物)，A，T，G，C含量分别为34.1％、22.8％、21.2％、21.9％，AT含量高于GC含量。在海湾扇贝26条ITS-1序列中共检测到12个变异位点，其中存在3个插入／缺失突变的的核苷酸位点，8个转换位点1个颠换核苷酸位点，共11种单倍型，通过DNAsp软件，对海湾扇贝群体的遗传多样性参数进行计算，得到平均核苷酸差异数(K)为0.763、核苷酸多样性指数(Pi)为0.00238，单倍型多样性指数(Hd)为0.578。显然，海湾扇贝养殖群体的遗传多样性明显栉孔扇贝和海湾扇贝的群体遗传多样性研究及扇贝科几种贝类的分子系统学研究较低。 核糖体转录间隔子(rrs一l)片段序列是系统演化研究中非常有用的核基因序列之一。本实验对栉孔扇贝(Chla峨vsfarreri)、华贵栉孔扇贝(Chlan衫)s nobilis)、海湾扇贝(A厂g口pee ten irradians)、虾夷扇贝(Parinopecten夕essoensis)4种扇贝的ITS一1序列进行了扩增，扩增产物转入T载体后进行了克隆、测序。各物种rrs一1序列长度在337bP-360bp(包括引物)之间，四种扇贝间rrs一1序列长度差异不大，通过序列比对，四种扇贝间ITS一基因序列同源性值在38%一75%之间。在序列的中间部分具有2个保守区域，其同源性高于92%。 利用得到的4种扇贝的rrs一1序列和文献发表的4种扇贝的rrs一1序列进行了比较，采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建分子系统树。系统分析显示，采用NJ和MP方法构建的系统树表现出完全相同的拓扑结构。聚类分析显示，海湾扇贝与AqueiPecten opercularis聚在一起，结果支持了wal ler(1991，1993)将Argopecten划分到AequiPecten类群中的分类方法。rrs一1序列分析的结果显示华贵栉孔扇贝的分类地位与传统的分类有所差异;海湾扇贝与扇贝亚科的关系比与栉孔扇贝亚科的关系更近;虾夷扇贝与栉孔扇贝的关系较为相近。(本文来源于《中国海洋大学》期刊2004-06-10）
刘保忠[4]（2003）在《海湾扇贝群体遗传学和扇贝科分子系统演化的研究》一文中研究指出群体遗传学和分子系统学是遗传学研究的重要内容。本文对扇贝群体遗传学研究中的主要分子方法同工酶和RAPD标记进行了研究，利用RAPD标记分析了海湾扇贝野生群体、养殖群体和地理亚种群体的遗传结构和遗传分化，探讨了人工养殖对群体遗传多样性的影响；利用数学统计方法研究了海湾扇贝壳性状与生产性能的相关关系，得出了海湾扇贝壳性状对活体重和软体重的回归方程，分析了3个不同养殖群体的生长和产量差异；实验克隆和分析了海湾扇贝、栉孔扇贝等8种扇贝的16S rDNA基因部分序列，结合已有的5个扇贝物种的序列，利用分子数据分析了扇贝科物种的分类地位和系统演化关系。 实验以海湾扇贝为材料，研究了样品不同保存条件下DNA的提取方法，结果显示，鲜活样品、冷冻样品以及70％乙醇固定样品，都可以方便地获得高质量的DNA，但甲醛固定的样品在本实验中没能获得满意的结果。以获得的样品DNA为模板进行RAPD扩增显示，上述3种方法获得的DNA扩增后的得到稳定的产物，并且样品间电泳检测的结果表现出很好的一致性，而甲醛固定样品的提取物在进行扩增后电泳检测无阳性结果。 RAPD和同工酶是群体遗传分析中常用标记，实验以野生栉孔扇贝群体为材料，筛选了10个可用于群体分析的RAPD标记，分析显示，多态位点比例为40.74％，群体平均杂合度为0.194；通过对同工酶的筛选，共得到13种酶的22个位点，其中7个为多态位点，多态位点比例和群体平均杂合度分别为31.82％和0.113。实验表明，同一扇贝群体采用RAPD标记分析得到的多态位点比例和平均杂合度均高于同工酶标记分析结果，但两种手段得到的结果所揭示的趋势表现出较好的一致性。 利用RAPD技术分析了海湾扇贝野生种群、两个不同养殖世代的养殖群体和一个海湾扇贝地理亚种墨西哥湾扇贝养殖群体的遗传结构和群体间的遗传距 刘保志海琦扇贝娜体遗传学和扁贝料分于系挽演化的研究博士学位论丈离。研究结果显示，各群体多态位点比例介于31.54%至35.28%之间，平均杂合度为0.1248至0.163，野生海湾扇贝群体的群体多态性水平最高。大连养殖群体的多态位点比例和平均杂合度均高于莱州养殖群体，但对两群体的壳高和体重分析表明两群体无显着差异。通过对群体遗传距离的比较，墨西哥湾扇贝和野生海湾扇贝群体间的遗传距离大于海湾扇贝野生群体和养殖群体间的遗传距离。实验结果发现，随着人工养殖世代的增加，群体遗传结构发生了改变。群体遗传多样性的降低会导致扇贝抗逆性的下降，而人工养殖过程中较高的养殖密度和恶化的水质条件，也是造成养殖扇贝较高死亡率的重要原因。 为了分析海湾扇贝壳性状同体重等经济性状的关系，实验测量了3个养殖群体共139个个体样品的壳长、壳高、壳宽、前耳宽、后耳宽等壳性状和活体重、壳重和软体重等经济性状，通过计算分析表明，海湾扇贝各性状的相关系数均达到极显着水平(尸<0.01)。利用壳性状作为自变量，活体重和软体重作为依变量进行多元回归分析，回归关系达到极显着水平(尸<0.01)，活体重对壳长、壳高的偏回归系数极显着(尸<0.01)，对壳宽的偏回归系数达到显着 (尸<0.05)，软体熏对壳长、高、宽的偏回归系数均极显着(尸<0.01)，前耳和后耳宽度对活体重和软体重的回归系数均不显着。多元回归分析建立的壳长(Xl)、壳高(溉)和壳宽(X3)估计活体亚(Y)和软体重(附)的回归方程为: 卜一4 1 .427+7.SOSXI+3.877X2+0.93lX3)不乞一25.771+4.574丫!十2.421X2+0.7llX3。 通过采用多参数方差分析和新复极差法对海湾扇贝3个养殖群体的壳长、壳高和活体重、软体重等经济性状进行了比较分析，结果显示，陵水桥群体各性状指标均显着高于其它两群体，棋盘磨群体和大李家群体则没有表现出显着差异，说明陵水桥群体的生产性能和预期产量最高。 165 rDNA基因序列是系统演化研究中有效的分子手段。实验对栉孔扇贝、华贵栉孔扇贝、褶纹肋扇贝和长肋日月贝等4种我国沿海分布的扇贝和海湾扇贝、墨西哥湾扇贝、虾夷扇贝和欧洲大扇贝等4种外来物种的线粒体DNA的165 rDNA基因部分序列进行了扩增，扩增产物转入T载体后进行了序列测定。各物种165 rDNA基因部分序列长度在548一642bp之间，物种间表现出较高的长度差异，通过序列比对，表现出较高的同源性。 利用得到的8种扇贝的165 rDNA基因部分序列和文献发表的5种扇贝的刘保忠海沟扁贝群体遗传学和扇贝科分子从统演化的研究博士学位论文165 rDNA基因部分序列进行了比较，采用邻接法，最大简约法和最大似然法构建了扇贝科的分子系统树。系统分析显示，又用NJ和ML方法构建的系统树表现出完全相同的拓扑结构，MP法的系统树除了一个物种的分枝位置出现差异，其它物种的排列循序跟上述两种方法得到的系统树相同。实验结果显示，海湾扇贝和墨西哥湾扇贝以及AqueiPecten opercularis和Chla州lys glabra所在属所属的亚科，很可能同栉孔扇贝亚科和扇贝亚科居于平等的分类阶元上。实验结果显示，165 rDNA序列所提供的分子数据，在扇贝科的系统演化分析中?(本文来源于《中国科学院研究生院（海洋研究所）》期刊2003-05-01）
王祯瑞[5]（1986）在《中国近海扇贝科的研究——Ⅰ．掌扇贝属Volachlamys及环扇贝属Annachlamys》一文中研究指出本文根据中国科学院海洋研究所的标本,报道掌扇贝属(Volachlamys)2种,环扇贝属(Annachlamys)1种,并对属、种中存在的问题进行了讨论,对种名混乱现象进行了讨论和订正,对生态习性、分布及利用等也做了简要的叙述。属、种的描述如下：(本文来源于《中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学分会第二次代表会暨第叁次学术讨论会论文集》期刊1986-11-01）
王祯瑞[6]（1985）在《中国近海扇贝科的研究——Ⅶ.栉孔扇贝亚科(拟套扇贝属)》一文中研究指出拟套扇贝属(Semipallium)的种类,皆为暖水动物区系中的双壳类,分布在我国东南沿海。本文根据我所历年来在中国沿海搜集的材料,共记述该属有4种,分隶于2亚属,其中有1新种和2新记录。除对新种作了比较和讨论外,并对其他种类的形态地理分布和生活习性也作了简要的记述。(本文来源于《海洋与湖沼》期刊1985年06期）
王祯瑞[7]（1984）在《中国近海扇贝科的研究——Ⅵ.拟日月贝亚科》一文中研究指出拟日月贝亚科(Propeamussiinae)的种类都栖息在百米以上的海底。多数种壳小,薄而透明或半透明,呈圆形或椭圆形。两耳较小,略等或不相等。壳表光滑具光泽,生长纹细密,有的种具有细放射肋或放射纹。壳色淡,多呈白色或乳白色,有的具淡黄色褐花纹。贝壳内面多与壳表颜色相同,一般肌痕不明显,具有不同数目而多呈白色的内肋,少数种肋早黄色或褐色等。外套触手发达,外套眼缺或退化。(本文来源于《海洋与湖沼》期刊1984年06期）
王祯瑞[8]（1983）在《中国扇贝科的研究 Ⅲ.栉孔扇贝亚科(薄齿扇贝属)》一文中研究指出薄齿扇贝属(Bractechlamys)是栉孔扇贝亚科(Chlamydinae)中的一个暖水性属。其主要特征是贝壳较小、近圆形,壳两侧不等,左壳平,右壳凸。两耳不等,前耳大,后耳小。贝壳表面宽放射肋上具有数条圆形细肋,肋上有各种生长小鳞片。放射肋及生长鳞片细致、规则。壳色鲜艳美丽。以足丝营附着生活,栖息在潮间带和潮下带浅海底的岩石或珊瑚礁上。这一属在我国的种类不多,Kuroda(1941)和波部忠重(1977)曾报道台湾省有两种,其中方薄齿扇贝(Bractechlamys quadrilirata Lischke)我们在广东省的海南岛也有发现。此外,作者又发现1个新种(秀丽薄齿扇贝B.elegans sp.nov.)和1个新记录(彩薄齿(本文来源于《海洋与湖沼》期刊1983年06期）
王祯瑞[9]（1983）在《中国扇贝科的研究 Ⅲ.栉孔扇贝亚科(隐扇贝属新种新记录)》一文中研究指出隐扇贝属(Cryptopecten)属于栉孔扇贝亚科(Chlamydinae),该属的多数种皆为个体较小的暖水性种,仅见于印度西太平洋区,化石种出现在第叁纪的中新世。贝壳多呈圆扇形,两壳不等,壳表具有等粗的细放射肋,肋上有排列整齐的叁角形或圆形小鳞片。主肋的两侧往往具细肋,肋间生长纹多呈格子状。壳表呈淡黄色或近白色,有的具淡红色或褐色花纹。两耳不等,右壳前耳下方具较明显的足丝孔,一般有数个小栉齿,以足丝营附着生活。在研究栉孔扇贝亚科时,发现隐扇贝属有1个新种扁隐扇贝Cryptopecten complanus(本文来源于《海洋与湖沼》期刊1983年04期）
王祯瑞[10]（1980）在《中国扇贝科的研究 Ⅰ.拟日月贝亚科一新种》一文中研究指出扇贝科中的拟日月贝亚科(Propeamussiinae)与日月贝亚科(Amusiinae)相近似,但这一亚科的多数种贝壳较小、半透明,具有内肋。除少数生活在潮下带几十米深的水域外,多数生活在数百米到数千米的深海。拟日月贝亚科中虽有冷水种和暖水种,但都是些数量较少的稀有种。迄今,这一亚科在我国近海只发现2种,一种为深海拟日月贝Bathy-(本文来源于《海洋与湖沼》期刊1980年03期）
扇贝科论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
扇贝科(Pectinidae)有300多个现存种,是双壳贝类中重要的一支,广泛分布于世界的各大洋中,并且具有重要的经济价值[1]。栉孔扇贝(Chlamys farreri)、海湾扇贝(Argopecten irradians irradians)、虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)、华贵栉孔扇贝(Mimachlamys nobilis)是我国主要的扇贝养殖种类,养殖年产量达120万t多,居世界首位。随着近年来扇贝养殖业的快速发展,其遗传育种研究取得显着成果,细胞遗传学是遗传育种研究的基础,也是开展遗传育种工作的重要理论依据。扇贝的细胞遗传学研究主要涉及核型分析、染色体鉴别、细胞遗传学图构建以及染色体结构和功能分析。由于扇贝染色体数目多,形态接近,很难从形态上区分不同的染色体,这在较长一段时期内,阻碍着细胞遗传学
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
扇贝科论文参考文献
[1].曹善茂,朱丽洁,聂鸿涛,印明昊,刘钢.基于16S和COⅠ基因探讨岩扇贝在扇贝科中的分类地位[J].江苏农业科学.2019
[2].胡丽萍,黄晓婷,张玲玲,陆维,包振民.扇贝科染色体研究进展[J].海洋科学.2013
[3].魏晓华.栉孔扇贝和海湾扇贝的群体遗传多样性研究及扇贝科几种贝类的分子系统学研究[D].中国海洋大学.2004
[4].刘保忠.海湾扇贝群体遗传学和扇贝科分子系统演化的研究[D].中国科学院研究生院（海洋研究所）.2003
[5].王祯瑞.中国近海扇贝科的研究——Ⅰ．掌扇贝属Volachlamys及环扇贝属Annachlamys[C].中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学分会第二次代表会暨第叁次学术讨论会论文集.1986
[6].王祯瑞.中国近海扇贝科的研究——Ⅶ.栉孔扇贝亚科(拟套扇贝属)[J].海洋与湖沼.1985
[7].王祯瑞.中国近海扇贝科的研究——Ⅵ.拟日月贝亚科[J].海洋与湖沼.1984
[8].王祯瑞.中国扇贝科的研究Ⅲ.栉孔扇贝亚科(薄齿扇贝属)[J].海洋与湖沼.1983
[9].王祯瑞.中国扇贝科的研究Ⅲ.栉孔扇贝亚科(隐扇贝属新种新记录)[J].海洋与湖沼.1983
[10].王祯瑞.中国扇贝科的研究Ⅰ.拟日月贝亚科一新种[J].海洋与湖沼.1980