应用高通量测序研究三文鱼片冷藏过程中的菌相变化

论文摘要

分析三文鱼片在冷藏过程中的微生物群落多样性及菌相变化,确定其优势腐败菌。以4℃冷藏条件下三文鱼片为研究对象,分别于第0、1、2、3、4天提取鱼片上的细菌总DNA,采用高通量测序技术分析细菌群落变化,确定其优势菌。结果表明,高通量测序分析共获得281个菌属,其中丰度大于1%的有6个,大于0.1%的有16个。在三文鱼冷藏过程中,其菌相不断变化,但其主要优势菌属保持不变,主要为假单胞菌属、发光杆菌属、希瓦氏菌属、不动杆菌属、黄杆菌属及金黄杆菌属,且随着储存时间的延长,假单胞菌属的丰度(优势性)逐渐增加。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 主要仪器、设备及试剂
•   1.2 试验方法
•     1.2.1 三文鱼样品的处理
•     1.2.2 细菌总DNA的提取
•     1.2.3 PCR反应
•     1.2.4 DNA回收及高通量测序
• 2 结果与分析
•   2.1 细菌总DNA的提取及PCR扩增结果
•   2.2 测序基本数据分析
•   2.3 样品的菌群结构
•   2.4 样品多样性分析
•   2.5 不同时间的三文鱼样品上的菌群结构的比较
• 3 结语

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 房杰,孟永宏,张英,尤毅娜,郭玉蓉

关键词: 高通量测序,三文鱼片,菌相分析,优势菌

来源: 食品与生物技术学报 2019年07期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 轻工业手工业

单位: 陕西师范大学食品工程与营养科学学院

基金: 国家重点研发计划项目（2017YFD0400702）

分类号: TS254.4

页码: 94-99

总页数: 6

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