基于16S rRNA基因高通量测序的太原地区健康成年人肠道菌群结构分析

论文摘要

目的探讨太原地区健康成年人的肠道菌群结构及多样性。方法采集太原地区20份健康成年人的粪便样本,提取DNA、构建菌群16S rRNA基因克隆文库、高通量测序并进行生物信息学分析。结果测序获得优质序列1 383 680条,平均序列为69 184条±551条,归类于455个OTUs;所有样本共含有10个菌门,101个菌属,141种菌;其中核心菌门3个,依次为拟杆菌门(63.13%)、厚壁菌门(31.14%)和变形菌门(5.10%),占所有样本微生物总量的99.37%;丰度最高的前10个菌属依次为拟杆菌属(43.34%)、普氏菌属(15.51%)、栖粪杆菌属(4.92%)、罗氏菌属(4.73%)、毛螺菌属(3.27%)、萨特菌属(2.50%)、粪球菌属(2.38%)、布劳特菌属(2.31%)、瘤胃球菌属(2.18%)和副杆状菌属(1.61%),占样本微生物总量的82.75%,未分类的菌属占6.84%。结论健康成年人肠道微生物群落复杂,但主要菌群相对稳定,为进一步研究人体肠道菌群结构与功能提供了参考依据。

论文目录

• 1 对象与方法
•   1.1 研究对象
•     1.1.1 来源
•     1.1.2 纳入与排除标准
•   1.2 研究方法
•     1.2.1 样本采集
•     1.2.2 16S rRNA基因V3-V4区测序
•     1.2.3 生物信息学分析
• 2 结 果
•   2.1 样本序列及OTUs
•   2.2 Alpha多样性分析
•   2.3 OTU的Core-Pan分析
•   2.4 肠道菌群整体结构分析
•     2.4.1 肠道菌群在门水平上的结构分析
•     2.4.2 肠道菌群在属水平上的结构分析
•     2.4.3 物种在属水平上的系统进化树分析
•   2.5 不同个体厚壁菌门与拟杆菌门的比值 （F/B值） 及主要菌属分析
•   2.6 PICRUSt分析
• 3 讨 论
•   3.1 太原地区健康成年人肠道菌群在门水平上的分布特点
•   3.2 太原地区健康成年人肠道菌群在属水平上的分布特点
•   3.3 太原地区健康成年人肠道核心菌属及其功能

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王慕华,彭晓光,麻杰,赵玉明,杜莹,李海涛,宫俊峰,张国柱,刘斌

关键词: 太原地区,肠道菌群,核心菌群

来源: 中国微生态学杂志 2019年07期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学,基础医学

单位: 山西省生物研究院有限公司,山西维尔生物乳制品有限公司,山西省信息产业技术研究院有限公司

基金: 山西省重点研发计划项目(201703D421025),山西省平台基地和人才专项(201805D211014)

分类号: R37

DOI: 10.13381/j.cnki.cjm.201907001

页码: 745-751

总页数: 7

文件大小: 3257K

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