导读:本文包含了互补密码子论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:密码子,磷酸酶,结构,耐热性,耐热,碱性,选择性。
互补密码子论文文献综述
黄惠芳[1]（2006）在《疾病相关的选择性剪接基因与密码子和互补密码子的生物信息学分析》一文中研究指出遗传密码子(Genetic Codes)是连接基因和蛋白质的桥梁。通过研究密码子与互补密码子在疾病选择性剪接形成及物种进化中使用频率的差异,将有助于从新的角度来了解选择性剪接的进化及其导致人类疾病的可能分子机制。本文统计分析了118个人类疾病相关的选择性剪接基因编码区中2,903个单核苷酸替代的特征:在选择性剪接基因的单碱基替代中,最普通的替代类型依次是C|T (C/T或T/C) (31.97 %)和A|G (28.14 %)替换、G|T (13.65 %)和C|G (12.47 %), A|C和A|T替换是较少的,分别为7.44 %和6.34 %。转换(A|G和C|T)60.11 %大于颠换(A|C、G|T、A|T和C|G)39.89 %。密码子第一、第二和第叁位碱基替代的等次分别为C > G > A > T、G > C > T > A和C > G >T > A,其比例分别为49.26 %、42.16 %和8.58 %。在对60种生物(13种真核生物,26种细菌,5种古细菌和16种病毒)基因组和60种细胞器(40种线粒体和20种叶绿体)基因组的密码子与互补密码子数据的分析中,显示密码子与互补密码子存在显着或极显着的相关性。对70个物种(5个古细菌,20个真核生物和45个细菌)基因组密码子与互补密码子的分析支持了上一步的结果,并发现密码子与互补密码子的使用相关系数和GC含量之间存在显着的相关性。基于密码子与互补密码子使用频率差异,我们构建了密码子与互补密码子使用的进化树;结果表明密码子与互补密码子使用的进化树可以反应物种的协同进化过程。(本文来源于《厦门大学》期刊2006-05-01）
黄惠芳,庄永龙,陈礼明,林鲁萍,马飞[2]（2005）在《基于密码子与互补密码子使用的进化树的重构(英文)》一文中研究指出为了更深入地了解密码子与互补密码子使用相关的内涵,70个单细胞和多细胞生物被更进一步的分析。结果得到70种细胞生物具有较高的相关系数平均值(0.5101,标准差是0.1389),表明密码子与其互补密码子使用间确实存在正的使用相关联系,进一步地支持了以前的结果。此外,通过对70个单细胞和多细胞生物在基于密码子与互补密码子使用频率差异,以及配对频率的高低信息的分析基础上,绘制进化树,得到的进化树与传统的进化树非常接近。(本文来源于《安徽农业大学学报》期刊2005年03期）
黄惠芳,林鲁萍,马飞,许晓风,陈礼明[3]（2004）在《基因密码子与互补密码子使用的相关分析》一文中研究指出遗传密码是基因与蛋白质进行信息对接的桥梁,研究不同进化阶层生物的密码子与互补密码子的使用规律是揭示物种进化的一种重要途径。为了阐明不同生物和细胞器基因密码子与互补密码子使用之间的内在联系及其在进化中的意义,作者选取了44种细胞生物、16种病毒、40种线粒体和20种叶绿体的基因密码子与互补密码子数据,并进行关联分析。结果显示:(1)无论是古细菌,真细菌,病毒,真核生物还是两类细胞器,它们的密码子与互补密码子的使用频率大多表现为显着或极显着正相关;(2)不同生物和细胞器基因密码子与互补密码子使用频率之间相关程度也存在明显的异质性。细胞生物和两类细胞器基因密码子与互补密码子使用的高度一致性反映了它们可能具有共同的起源,显着的异质性则反映了它们分别经历了不同的进化选择压力。密码子与互补密码子的使用相关程度不仅能被用作为测量物种进化过程中所经历选择压力的指标,而且也能被用作为碱基摆动和修饰的指示器。此外,文中还对生物进化早期存在DNA双链同时具有编码基因功能的可能性进行了讨论。(本文来源于《安徽农业大学学报》期刊2004年03期）
郁锋[4]（2003）在《耐热碱性磷酸酶耐热机理研究和互补密码子使用关系探讨》一文中研究指出耐热碱性磷酸酶TAP(thermostable alkaline phosphatase)来源于栖热菌Thermus sp．FD3041，全序列长501个氨基酸，和大肠杆菌等生物的碱性磷酸酶比较有40％的相似性，与活性中心相关的氨基酸残基高度保守，说明TAP也有和其他碱性磷酸酶相似的空间结构和催化机制，而其最适反应温度可以达到70℃以上，属于耐热酶。对于蛋白质耐热机理的研究，TAP是一个很好的模型材料。利用法国的NPS@服务器预测TAP的二级结构，并依据保持末端二级结构稳定性的前提选择了合适的切除位点去除TAP两端的非功能结构域，经过克隆、表达得到了有活性的TAP~(N34C25)(TAP的N端去掉34个氨基酸而C端去掉25个氨基酸)。其最适反应温度和活化能比TAPND27有所上升；而最高耐受温度和Km值有所下降。TAP的功能结构域由此被进一步定位在35～476氨基酸之间。本实验不仅更为精确地定位了TAP的功能结构域，而且提供了以二级结构预测结果指导切割位点选择的范例，为功能结构域的定位提供了一种新的有效方法。利用突变的方法研究突变位点对TAP耐热性的影响，构建了两个单位点突变体(A410→T和P396→S)和两个多位点突变体(N100→S、T320→I和N100→S、P396→S、A410→V、P490→S)，进行全序列及表达产物的最高耐受温度和最适反应温度测定和酶分子高级结构的模拟，分析突变位点、高级结构和耐热性表现叁者的关系，探讨引起耐热性变化的机理。结构模拟显示所有突变位点都仅能引起细微的、局部的结构变化，除T320→I外都未直接触及酶的活性中心；结构上的细微改变虽然对最适反应温度影响不明显，但却使最高耐受温度降低了10℃左右；T320→I由于靠近酶的活性中心，尽管未能引起结构的较大变化，但却使最高耐受温度和最适反应温度同时显着降低。可见，多数点突变对高级结构的影响都不剧烈，但对耐热性尤其是最高耐受温度的影响却比较明显，一般地，在非活性区的突变通常只能引起最高耐受温度的降低，靠近活性区的突变则能同时引起最适反应温度和最高耐受温度的降低。二价金属离子对TAP耐热性的影响也作了一些探讨，在Mn~(2+)，Zn~(2+)，Mg~(2+)和Ca四种离子存在的条件下分别检测了耐热碱性磷酸酶TAP和它的两个多位点突变体耐热性和最适反应温度的变化，结果发现Mn~(2+)，Zn~(2+)，Mg~(2+)使得这两个突变体的耐热性有所升高，而Ca~(2+)却降低了它们的耐热性。另外，对于互补密码子对的使用关系也进行了一些统计分析。使用基于．NET平台的C#语言编制了密码子使用频率统计软件CodonP。该软件利用两个本地化的数据库密码子使用频率数据库和物种分类数据库并采用自定义的脚本语言实现了对互补密码子使用频率相关性和各种密码子使用偏好性参数的统计计算，是研究密码子使用频率的生物学意义的有力工具。系统分析了古细菌，真细菌和真核生物各100种随机样本的密码子与互补密码子及同域生物内32个密码子-互补密码子对使用频率的相关性。结果发现：绝大多数生物的密码子与。互补密码子的使用都呈显着正相关；叁域生物32个密码子——互补密码子对的使用关系基本一致，但真细菌与真核生物更近，古细菌与真细菌和真核生物两者都较远；密码子——互补密码子对使用关系的性质取决于密码子氢键的左右对称性。这些新发现不仅论证了前人有关密码子偏爱使用假说的合理性，而且揭示了密码子与互补密码子使用的内在联系及其隐含的生物学意义。文中还就密码子对的使用规律与遗传密码的起源和进化之间的关系进行了讨论。(本文来源于《南京师范大学》期刊2003-05-11）
互补密码子论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为了更深入地了解密码子与互补密码子使用相关的内涵,70个单细胞和多细胞生物被更进一步的分析。结果得到70种细胞生物具有较高的相关系数平均值(0.5101,标准差是0.1389),表明密码子与其互补密码子使用间确实存在正的使用相关联系,进一步地支持了以前的结果。此外,通过对70个单细胞和多细胞生物在基于密码子与互补密码子使用频率差异,以及配对频率的高低信息的分析基础上,绘制进化树,得到的进化树与传统的进化树非常接近。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
互补密码子论文参考文献
[1].黄惠芳.疾病相关的选择性剪接基因与密码子和互补密码子的生物信息学分析[D].厦门大学.2006
[2].黄惠芳,庄永龙,陈礼明,林鲁萍,马飞.基于密码子与互补密码子使用的进化树的重构(英文)[J].安徽农业大学学报.2005
[3].黄惠芳,林鲁萍,马飞,许晓风,陈礼明.基因密码子与互补密码子使用的相关分析[J].安徽农业大学学报.2004
[4].郁锋.耐热碱性磷酸酶耐热机理研究和互补密码子使用关系探讨[D].南京师范大学.2003
论文知识图
