葡萄PRC1-like核心组分基因克隆及序列分析

论文摘要

克隆葡萄PRC1-like核心组分基因并预测其功能。在NCBI中分别查找与拟南芥PRC1核心组分基因同源性最高的葡萄序列,采用CTAB法提取葡萄品种‘赤霞珠’（Cabernet sauvignon）嫩叶中总RNA,运用RT-PCR技术进行克隆,得到葡萄PRC1-like核心组分基因的CDS序列,并通过各种在线软件对葡萄PRC1-like核心组分基因及其编码的蛋白质进行生物信息学分析。获得4个葡萄PRC1-like核心基因,这些基因CDS全长分别为1 614 bp、1 362 bp、1 293 bp和1 275 bp,分别编码568个、453个、430个和424个氨基酸,预测其蛋白质的相对分子量分别为64.17 kD、50.69 kD、47.99 kD和47.71 kD,推测这些蛋白均为亲水性不稳定蛋白,与已知拟南芥PRC1相应的核心蛋白具有高度的同源性,亚细胞定位预测结果表明这些蛋白主要存在于细胞核中。推测葡萄PRC1-like在葡萄发育中起着重要作用,这为进一步阐明葡萄PRC1-like的功能及作用机制提供了理论依据。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 克隆编码葡萄PRC1-like复合体的成员蛋白基因
•   1.2 葡萄PRC1-like核心蛋白系统进化树的构建
•   1.3 葡萄PRC1-like核心蛋白的基本理化性质分析
•   1.4 葡萄PRC1-like核心蛋白的亚细胞定位分析
•   1.5 葡萄PRC1-like核心蛋白的跨膜和保守结构域分析
•   1.6 葡萄PRC1-like核心蛋白的二级结构预测分析
•   1.7 组织表达特异性预测分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 材料
•   3.2 葡萄总RNA的提取及c DNA的合成
•   3.3 引物设计和目的基因克隆
•   3.4 对目的基因进行生物信息学分析

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 丰景,卢江

关键词: 葡萄,基因克隆,序列分析

来源: 基因组学与应用生物学 2019年08期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

专业: 生物学,园艺

单位: 广西农业科学院,广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,广西民族大学海洋与生物技术学院,上海交通大学农业与生物学院

基金: 广西自然科学基金项目(2016GXNSFCA380020),广西农业科学院博士后基金项目(桂农科博2016025),广西农业科学院基本科研业务专项(2015YT95)共同资助,中国博士后科学基金(2017M613268XB)

分类号: S663.1;Q943.2

DOI: 10.13417/j.gab.038.003637

页码: 3637-3645

总页数: 9

文件大小: 1401K

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