高通量测序分析臭豆腐中的细菌菌种多样性

论文摘要

通过高通量测序的方法以及传统分离培养方法对臭豆腐中的细菌的微生物群进行分析。通过传统培养的方法分离到49株细菌,经鉴定隶属于9个属15个种。其中有乳酸菌11种,其它细菌4种。分离鉴定到属水平的细菌中,属于明串珠菌属的菌株最多。高通量测序结果显示,在样品中乳酸菌占有较高的比例,H1和H3样品中超过50%的细菌属于乳酸菌。高通量测序共检测到212种细菌,其中66种属于乳酸菌。臭豆腐的菌群构成十分复杂,暂时没有一种菌种是臭豆腐菌群中的优势菌种。沙克乳杆菌在本次研究分离的样品中所占比例相对较高,在每个样品中都能分离到。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料与试剂
•   1.2 仪器与设备
•   1.3 方法
•     1.3.1 细菌的分离纯化
•     1.3.2 DNA提取与PCR
•     1.3.3 琼脂糖凝胶电泳检测与DNA测序
•     1.3.4 高通量测序
• 2 结果与分析
•   2.1 基于传统培养分离方法分析乳酸菌多样性
•   2.2 基于高通量方法分析菌种多样性
•     2.2.1 稀释曲线
•     2.2.2丰度分布 曲线
•     2.2.3 Alpha多样性分析
•     2.2.4 PCA分析
•     2.2.5 微生物在属和种的水平进行分类比较
•   2.3 两种方法对比
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 谷静思,侯娟,何国庆

关键词: 臭豆腐,乳酸菌,多样性,高通量测序

来源: 中国食品学报 2019年03期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

专业: 生物学,轻工业手工业

单位: 浙江大学生物系统工程与食品科学学院浙江省食品微生物技术重点实验室,哈尔滨工业大学(深圳),德州职业技术学院

基金: 国家自然科学基金项目(31571808)

分类号: TS201.3

DOI: 10.16429/j.1009-7848.2019.03.032

页码: 250-255

总页数: 6

文件大小: 1736K

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