基于SNP标记的菜豆品种真实性和纯度鉴定技术

论文摘要

为了探索SNP标记技术在菜豆真实性和品种纯度鉴定中的应用,采用2b-RAD技术对200份国内外菜豆品种进行全基因组扫描、分析和评价,从中筛选出3 302个高分辨率、单拷贝和分布比较均匀的SNP标记,可以将除2个近等基因材料以外的198份品种资源区分开。基于组合最优化算法,利用Haploview 4.2软件获得了菜豆资源鉴定最少SNP位点组合一套,包含46个Tag-SNP标记,与3 302个SNP标记区分结果相同。本研究可为菜豆真实性和品种纯度鉴定技术体系的建立和指纹数据库的构建奠定基础。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 试验材料
•   1.2 DNA提取和2b-RAD测序
•   1.3 测序质量分析和SNP基因分型
•   1.4 数据分析
• 2 结果与分析
•   2.1 SNP位点分布
•   2.2 核心SNP位点筛选
•   2.3 品种鉴别方法
•   2.4 系统进化树
• 3 讨论与结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 颜廷进,蒲艳艳,张文兰,田茜,王栋,李群,戴双,丁汉凤

关键词: 菜豆,标记,品种真实性,品种纯度,鉴定

来源: 山东农业科学 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 园艺

单位: 山东省农作物种质资源中心

基金: 山东省农业科学院农业科技创新工程项目“新品种测试与检测公共服务平台”(CXGC2017A02),山东省农业科学院农业科技创新工程项目“特色作物与蔬菜种质资源收集保护与共享利用”(CXGC2016A02),山东省现代农业产业技术体系杂粮产业创新团队建设项目(SDARS-16-01)

分类号: S643.1

DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2019.12.023

页码: 111-119

总页数: 9

文件大小: 2678K

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