丝组二肽论文_刘艳,林铭堃,陈培燕,留筱厦,杜海莲

导读:本文包含了丝组二肽论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:机理,聚酰胺,核酸,蛋白,白蛋白,多肽,蛋白酶。

丝组二肽论文文献综述

刘艳,林铭堃,陈培燕,留筱厦,杜海莲[1](2011)在《丝组二肽——现代蛋白酶分子进化过程中的原始雏形》一文中研究指出系统阐述了我们实验室近十五年来对丝组二肽的生物活性的研究.丝组二肽是目前报道的具有多种切割活性的最小活性肽,它不仅能够切割DNA,而且可以切割蛋白质及羧酸酯.丝组二肽是迷你的磷酸酯酶和蛋白水解酶,是现代蛋白酶分子进化过程中的原始雏形.(本文来源于《中国科学:化学》期刊2011年04期)

何骏,麻远,赵玉芬[2](2006)在《结合丝组二肽的树状多肽对λDNA的切割》一文中研究指出Artificial nucleic acid cleavage agents have received considerable attention due to their very important applications in biochemistry and molecular biology.Seryl-histidine is a dipeptide possessing DNA,protein and ester cleavage activity.Since peptide dendrimers have a lot of unique physical and chemical properties compared to normal peptide chain and have a great varieties of applications in biological areas,two and four branched seryl-histidine planted peptide dendrimers were synthesized by Fmoc solid phase peptide synthesis approach.The products were purified by HPLC and characterized by ESI-MS.Their DNA cleavage activities were tested by means of Agarose Gel Electrophoresis.In the cleavage reaction,peptide dendrimer showed a strong combining inclination to DNA,highly concentrated dendrimer solution can quench the fluorescence of EB.Even though,the DNA cleavage activity of the dendrimers was lower than that of seryl-histidine dipeptide monomer.(本文来源于《高等学校化学学报》期刊2006年10期)

朱长进,刘建平[3](2006)在《丝组二肽衍生物和类似物合成及其DNA切割活性》一文中研究指出本文主要研究丝组二肽的衍生物和类似物的合成以及它们的DNA切割活性。研究人工的DNA特异性切割试剂最大的挑战在于设计和合成。而要获得设计与合成的成功,小分子化合物将是最佳的选择目标之一。本研究将主要集中于设计开发合成以水解机理切割DNA的小分子化合物。(本文来源于《第七届全国磷化学化工暨第四届海峡化学生物学、生物技术与医药发展讨论会论文集》期刊2006-04-01)

何骏,麻远,赵玉芬[4](2005)在《结合丝组二肽的树状多肽的DNA切割活性》一文中研究指出1988年Tam等最先合成了以多聚赖氨酸为骨架的树状多肽,并在末端连接各种不同的抗原,称为多抗原肽(multiple antigen peptide,MAP)。该种多肽具有一般树枝状大分子的普遍理化特性,如规则的多分支类球型结构、密集的表面集团、分子中较大的空腔等,并且相对于线性多肽具有更好的水溶性。目前主要被用于诱导免疫反应和作为药物或基因载体等。丝组二肽是本实验室发现的一种能够(本文来源于《第四届全国化学生物学学术会议暨国际化学与生物/医学交叉研讨会论文集》期刊2005-10-01)

牛明玉[5](2005)在《人工核酸酶—寡聚酰胺与丝组二肽缀合物的合成研究》一文中研究指出化学合成的DNA、RNA定位切割试剂是国际上80年代开始发展起来的一类新型的非酶断裂工具,被称为人工核酸酶或化学核酸酶。人工核酸酶是分子生物学及基因工程的重要工具,它可以作为研究核酸结构和功能方面的探针。因此开发出高效的人工核酸切割试剂,具有非常重要的理论意义和应用价值。人工核酸酶主要由识别试剂和切割试剂通过某种连接物缀合而成。 本论文设计合成出了寡聚酰胺/丝组二肽缀合物这样一类新型的人工核酸酶。它以单体N—甲基吡咯为原料,合成的寡聚酰胺作为该分子的核酸识别系统。同时,连接物(己二胺部分)与切割系统(丝组二肽部分)的组氨酸残基C端相连,这样就可以保证切割活性基团一丝氨酸残基上氨基和侧链羟基的相对位置。实验主要用到了DCC/HOBt偶合反应,Chloroform反应,Pd-C催化氢化反应,该系列的合成反应条件温和,反应时间短,除少数步骤产率较低外,大部分收率较高。 我们利用氢谱、碳谱、红外光谱、电喷雾质谱、高分辨质谱及多种二维核磁共振谱等分析手段对化合物结构进行了详细的表征,并从中总结出了一些规律,这对以后判别此类化合物提供了参考。例如,利用~1H NMR可以很方便的判断化合物中含有几个N—甲基吡咯环,利用电喷雾质谱可从化合物的断裂途径判断出各个基团的连接顺序。 同时为了保证合成的化合物在生物活性测试时的纯度,我们利用高效液相与质谱联机方式(HPLC—ESI—MS)对多步合成的寡聚酰胺/丝组二肽缀合物进行分析。与清华大学合作,初步实验发现合成的多聚酰胺/丝组二肽缀合物对DNA的切割活性高出丝组二肽数百倍。(本文来源于《郑州大学》期刊2005-05-20)

钟儒刚,赵丽娇,赵玉芬[6](2004)在《丝组二肽对DNA切割作用的QM-MM研究》一文中研究指出运用QM MM方法对丝组二肽切割DNA作用的机理进行了研究 .通过计算得到了丝组二肽与DNA形成多氢键作用的有效分子识别模型及相关分子结构参数 ,从理论上解释了丝组二肽与DNA通过形成五配位磷中间体而使磷酸二酯键发生水解 ,从而使得DNA被切断的作用机理 .(本文来源于《化学学报》期刊2004年24期)

杨晓丽[7](2004)在《寡聚酰胺-丝组二肽缀合物的设计合成、质谱解析及其切割DNA活性研究》一文中研究指出核酸切割剂在核酸化学研究领域中有至关重要的作用。在DNA突变、癌变以及细胞死亡等研究领域,核酸切割剂是一个很好的分子生物学工具,更是设计基因药物的模版。基于丝组二肽对DNA的切割活性和聚酰胺的特异性识别功能,本论文主要研究了寡聚酰胺-丝组二肽缀合物(NO_2-PyPyIm-SerHis)的设计合成、质谱解析及其切割DNA活性研究。 1.通过卤仿反应和DCC/HOBt偶合反应合成酰胺键,首次合成了寡聚酰胺-丝组二肽缀合物。该合成路线反应条件温和,产率适中。在目标分子的合成设计中,由寡聚酰胺作为该分子的DNA识别片断(DNA-BindingMotif,DBM),同时,柔性链(Linker Motif,LM)与活性片断(Active Motif,AM)Ser-His的组氨酸残基C端相连,保证切割活性基团-丝氨酸残基上氨基和侧链羟基的状态和相对位置。生物活性实验验证此设计是合理的。 2.利用高分辨质谱、红外光谱、核磁共振谱(~1H NMR和~(13)C NMR)和电喷雾质谱(ESI-MS和ESI-MS/MS)分析鉴定化合物的结构,并分析总结了其质谱裂解规律。 3.在电喷雾质谱研究过程中,首次发现:质谱裂解过程中产生的某些酰胺类碎片离子和酯类化合物在离子阱中容易发生水解现象,并利用分子内的氨基催化分子离子水解反应的原理对此不常见的特征性裂解进行了详细解释。这可为同类酰胺或酯的质谱裂解规律和结构解析提供快捷、准确的依据。 4.论文首次提出在电喷雾质谱的裂解过程中,分子离子/碎片离子经过四元环、五元环和六元环过渡态发生氢重排,失去一个较为稳定的中性分子,趋于生成共轭体系的碎片离子。而当分子有羟基存在时容易发生酰胺键脱水现象。 5.利用紫外光谱和琼脂糖凝胶电泳两种方法测定了在B-R和Tri-HCl缓冲溶液中寡聚酰胺-丝组二肽缀合物与DNA的相互作用。发现Tri-HCl抑摘要 制目标分子切割DNA。两种方法得到的实验结论是相吻合的。虽然我们 没有观察到寡聚酞胺一丝组二肤缀合物特异性地切割DNA,但琼脂糖凝 胶电泳图谱证明我们所合成的寡聚酞胺一丝组二肤缀合物 (N 02一PyPylm一serHis)切割DNA的活性明显高于丝组二肤。这可归因 于识别片断·(DBM)寡聚酞胺的存在增加了活性片断(AM)Se卜His的 局部浓度,相应地提高了活性片断(AM)丝组二肤切割DNA的活性。 寡聚酞胺一丝组二肤缀合物(N仇一PyPylm一serHis)是一个高效全新的DNA切割剂,同时具有发展成为抗肿瘤前药的潜力。为设计合成更有效的特异性切割DNA化合物,提供了理论和实践基础。(本文来源于《郑州大学》期刊2004-03-28)

陈晶,万荣,刘海,蒋宇扬,赵玉芬[8](2001)在《丝组二肽对牛血清白蛋白的切割作用研究》一文中研究指出It has been found that Ser His could cleave bovine serum albumin(BSA), with the most suitable pH around 6.0. The kinds of buffers have different influences on the cleavage activity. The phosphate buffer and BR buffer are the most effective. The hydroxyl group of the serine residue is the essential functional group for the cleavage, while the amide bond, imidazole, and carboxyl group of Ser His increase the cleavage activity.(本文来源于《高等学校化学学报》期刊2001年08期)

万荣,王宁,赵玉芬[9](2001)在《丝组二肽对DNA的切割作用的研究》一文中研究指出Linear and supercoiled DNA were cleaved by HPLC purified seryl histidine dipeptide(SH). It was found that the DNA fragments produced by the reaction of SH and DNA could be ligated together by T 4 DNA ligase. This result implied that the SH was the first example of the ion free artificial DNA cleavage agent that could split DNA by hydrolysis mechanism.(本文来源于《高等学校化学学报》期刊2001年04期)

万荣,王宁,赵刚,赵玉芬[10](2000)在《丝组二肽所含基团在其切割DNA反应中的作用》一文中研究指出The effects of the amino, hydroxyl, imidazole and carboxyl groups of Ser His on DNA cleavage reaction were studied. It was found that the amino and hydroxyl groups were essential for the DNA cleavage activity of Ser His, and that anyone of them blocked would result into the loss of cleavage activity. The carboxyl group was not the necessary group. The presence of the imidazole group would enhance the cleavage activity. However, the histidyl serine dipeptide, as the formula isomer of Ser His with the inverse peptide sequence, could not cleave DNA at all. Based on the above experimental results, a presumed cleavage mechanism of Ser His on DNA was proposed. [WT5HZ](本文来源于《高等学校化学学报》期刊2000年12期)

丝组二肽论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

Artificial nucleic acid cleavage agents have received considerable attention due to their very important applications in biochemistry and molecular biology.Seryl-histidine is a dipeptide possessing DNA,protein and ester cleavage activity.Since peptide dendrimers have a lot of unique physical and chemical properties compared to normal peptide chain and have a great varieties of applications in biological areas,two and four branched seryl-histidine planted peptide dendrimers were synthesized by Fmoc solid phase peptide synthesis approach.The products were purified by HPLC and characterized by ESI-MS.Their DNA cleavage activities were tested by means of Agarose Gel Electrophoresis.In the cleavage reaction,peptide dendrimer showed a strong combining inclination to DNA,highly concentrated dendrimer solution can quench the fluorescence of EB.Even though,the DNA cleavage activity of the dendrimers was lower than that of seryl-histidine dipeptide monomer.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

丝组二肽论文参考文献

[1].刘艳,林铭堃,陈培燕,留筱厦,杜海莲.丝组二肽——现代蛋白酶分子进化过程中的原始雏形[J].中国科学:化学.2011

[2].何骏,麻远,赵玉芬.结合丝组二肽的树状多肽对λDNA的切割[J].高等学校化学学报.2006

[3].朱长进,刘建平.丝组二肽衍生物和类似物合成及其DNA切割活性[C].第七届全国磷化学化工暨第四届海峡化学生物学、生物技术与医药发展讨论会论文集.2006

[4].何骏,麻远,赵玉芬.结合丝组二肽的树状多肽的DNA切割活性[C].第四届全国化学生物学学术会议暨国际化学与生物/医学交叉研讨会论文集.2005

[5].牛明玉.人工核酸酶—寡聚酰胺与丝组二肽缀合物的合成研究[D].郑州大学.2005

[6].钟儒刚,赵丽娇,赵玉芬.丝组二肽对DNA切割作用的QM-MM研究[J].化学学报.2004

[7].杨晓丽.寡聚酰胺-丝组二肽缀合物的设计合成、质谱解析及其切割DNA活性研究[D].郑州大学.2004

[8].陈晶,万荣,刘海,蒋宇扬,赵玉芬.丝组二肽对牛血清白蛋白的切割作用研究[J].高等学校化学学报.2001

[9].万荣,王宁,赵玉芬.丝组二肽对DNA的切割作用的研究[J].高等学校化学学报.2001

[10].万荣,王宁,赵刚,赵玉芬.丝组二肽所含基团在其切割DNA反应中的作用[J].高等学校化学学报.2000

论文知识图

丝组二肽的正离子电喷雾多级质谱...丝组二肽标样的线性回归曲线丝组二肽切割DNA示意图丝组二肽的多级裂解质谱中氢迁移...反应混合物的全质谱图分子模拟软件界面图

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