蕲蛇毒腺的转录组分析及蛇毒蛋白功能基因的挖掘

论文摘要

蕲蛇是一种传统名贵中药材,具有免疫调节、抗肿瘤、抗炎、镇痛等药理作用,临床主要用于治疗类风湿性关节炎、强直性脊柱炎、干燥综合征和肿瘤等疾病。蕲蛇毒腺中分泌的蛇毒蛋白具有凝血、抗癌、抗栓、改善微循环和神经毒性等功能。为挖掘蕲蛇中蛇毒蛋白功能基因,利用基因工程技术在体外实现大量蛇毒蛋白的表达和纯化,该研究利用高通量测序平台对蕲蛇毒腺进行了转录组测序,组装获得了32 862条unigene,其中26 589条被公共数据库成功注释,2 695条被注释到62个转录因子家族中,并且预测出5 920个SSR位点。对分泌性磷脂酶A2和C型凝集素进行序列分析和同源建模,结果显示分泌性磷脂酶A2是同源二聚体,每个单体中包含5个保守的氨基酸构成了酶的催化活性中心; C型凝集素则有一个保守的糖基化结合位点,可以特异结合N-乙酰-D-葡萄糖胺。该研究对蕲蛇毒腺进行转录组测序,为蕲蛇毒腺中蛇毒蛋白功能的研究奠定了基础,将促进蕲蛇基因资源的开发和利用。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 样品
•   1.2 RNA的提取及测序
•   1.3 数据过滤及组装
•   1.4 Unigene的注释和分类
•   1.5 结构特征分析
•   1.6 转录因子的鉴定分析
•   1.7 SSR位点分析
• 2 结果与分析
•   2.1 转录组测序与序列组装
•   2.2 unigene功能注释
•     2.2.1 序列比对及基因注释
•     2.2.2 Unigene的KOG分类
•     2.2.3 unigene的GO分析
•     2.2.4 Unigene的KEGG分析
•   2.3 转录因子的鉴定和分析
•   2.4 SSR位点分析
•   2.5 蕲蛇蛇毒蛋白功能基因的挖掘
•   2.6 蕲蛇毒腺中磷脂酶A2参与的代谢路径分析
•   2.7 分泌性磷脂酶A2的结构特征分析
•   2.8 C型凝集素的结构特征分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张声祥,施圆圆,单春苗,王涛,汪振兴,汪胜松,吴家文

关键词: 蕲蛇,毒腺,转录组,蛇毒蛋白功能基因,分泌性磷脂酶,型凝集素

来源: 中国中药杂志 2019年22期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 安徽中医药大学安徽省中医药科学院,安徽中医药大学科研实验中心新安医学教育部重点实验室,安徽祁门蛇伤研究所,安徽道地中药材品质提升协同创新中心

基金: 中央本级重大增减支项目(2060302),安徽高校自然科学研究重大项目(KJ2018ZD028),安徽省重点研究与开发计划项目(1704a0802146),黄山市科技计划项目(2017KN-21),安徽省自然科学基金项目(1608085MH177)

分类号: Q78

DOI: 10.19540/j.cnki.cjcmm.20190829.105

页码: 4820-4829

总页数: 10

文件大小: 582K

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