南瓜青枯菌RSCM菌株RipG效应子家族基因克隆分析

论文摘要

青枯菌RipG家族效应蛋白是一类含有富亮氨酸重复序列（leucine-rich repeat,LRR）的蛋白。青枯菌GMI1000菌株中RipG家族效应蛋白7个基因共同决定GMI1000的致病力,并且不同RipG基因互作影响GMI1000对不同寄主致病力;RipG2、RipG3、RipG6和RipG7是决定寄主特异性的候选基因。南瓜青枯病是新发生病害,RSCM菌株除了能侵染南瓜外,还能侵染番茄、茄子、辣椒及烟草等作物。本研究对菌株RSCM的Rip家族效应子基因进行克隆分析,结果表明,菌株RSCM基因组缺少RipG1基因,存在6个RipG效应子家族基因,分别是RpG2、RipG3、RipG4、RipG5、RipG6和RipG7,其基因大小分别为3 108 bp,1 851 bp,1 389 bp,1 674 bp,1 866 bp和1 941 bp。与GMI1000菌株的RipG效应子家族比对,基因序列同源性均在99%以上。利用SMART工具对RSCM的6个RipG效应子家族蛋白结构预测,结果显示,RipG2、RipG3、RipG4和RpG5与GMI1000菌株的RpG2、RipG3、RipG4和RipG5结构基本一致;RSCM菌株与GMI1000菌株的RipG6和RipG7蛋白结构存在较大差异。南瓜青枯菌RSCM菌株与GMI1000菌株的RipG6和RipG7蛋白基因功能是否有差异还有待下一步研究。

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文章来源

类型: 国内会议

作者: 佘小漫,蓝国兵,汤亚飞,于琳,李正刚,邓铭光,何自福

关键词: 南瓜青枯病,效应子,基因克隆

来源: 中国植物病理学会2019年学术年会 2019-07-20

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,农业基础科学,植物保护

单位: 广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室

分类号: S432.42

DOI: 10.26914/c.cnkihy.2019.020378

页码: 363

总页数: 1

文件大小: 41k

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