毛薯硒代半胱氨酸甲基转移酶SMT基因的克隆与表达分析

论文摘要

硒代半胱氨酸甲基转移酶（SMT,Selenocysteine methyltransferase）是植物硒代谢的关键酶,在植物硒积累的过程中发挥着重要作用。为了探究毛薯中SMT基因的功能,本研究以优质富硒毛薯Ds148为研究对象,利用RT-PCR技术从中克隆到了毛薯SMT基因,命名为DsSMT。DsSMT（登录号:MH046782）包含1038 bp完整开放阅读框（ORF）,预测编码345个氨基酸,理论分子量（Mw）为37.24 kD,等电点（pI）为5.01,编码的蛋白与其他植物的SMT蛋白同源性较高,具有较高的保守性。系统进化树分析显示,毛薯与海枣和菠萝的SMT蛋白的亲缘关系较近,聚为同一类。利用PSORTⅡ在线软件对DsSMT蛋白进行预测,结果表明其可能定位于细胞质中。实时荧光定量PCR分析显示,DsSMT基因在毛薯生长发育的各个时期的根、茎、叶、块茎以及块茎的皮组织中均有所表达,其中在毛薯的根和成熟期表达量最高。本研究从毛薯中克隆出了硒代谢相关酶DsSMT基因的cDNA序列,并对其进行了生物信息学分析;同时又对DsSMT基因在毛薯块茎形成的不同时期、不同组织中的表达情况进行相对定量的研究和分析,为深入研究DsSMT基因的调控机理提供分子依据,同时也为毛薯硒吸收、同化的分子机理研究奠定基础。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
•     1.2.1 毛薯总RNA提取和c DNA合成
•     1.2.2 DsSMT基因的克隆
•   1.3 DsSMT基因的生物信息学分析
•   1.4 DsSMT基因的实时荧光定量分析
• 2 结果与分析
•   2.1 毛薯总RNA的提取
•   2.2 DsSMT基因的克隆
•   2.3 DsSMT基因的生物信息学分析
•   2.4 DsSMT基因的表达分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 杨亚飞,黎丹,黄东益,符晓,夏薇,吴文嫱

关键词: 毛薯,硒代半胱氨酸甲基转移酶,基因克隆,生物信息学,表达分析

来源: 植物遗传资源学报 2019年04期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,园艺

单位: 海南大学热带农林学院

基金: 农业部热带作物种质资源保护(zzzz002007168)~~

分类号: Q943.2;S632.9

DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20181027002

页码: 1087-1092

总页数: 6

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