10株猪流行性腹泻病毒序列分析

论文摘要

为了分析2015-2018年北方地区猪流行性腹泻病毒（PEDV）遗传变异情况,通过RT-PCR分段扩增、测序,获得10株PEDV S基因序列。分析发现,10株S基因核苷酸序列同源性为96.8%～99.4%,推导编码的氨基酸序列同源性为96.5%～99.3%;与参考株核苷酸序列同源性为93.4%～99.5%,与参考株氨基酸序列同源性为92.0%～99.4%。其中,4株序列基因长度均为4 161 nt,编码1 386个氨基酸;6株序列基因长度均为4 158 nt,编码1 385个氨基酸,与目前流行的变异株和经典株CV777相比,这6株S基因推导的氨基酸序列已分别在131位、1 196位出现1个氨基酸缺失,在进化树中已形成多个小分支。由此表明,我国PEDV在流行过程中已出现较大变异。作者研究结果为监测和分析我国PEDV的变异和演化提供了有价值的基因信息数据。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 病料来源
•   1.2 试剂材料
•   1.3 病毒RNA的提取及S基因RT-PCR扩增测序
•   1.4 序列拼接与分析
• 2 结果与分析
•   2.1 S基因核苷酸序列及其推导编码的氨基酸序列同源性分析
•   2.2 依据S基因推导编码的氨基酸序列绘制遗传进化树
•   2.3 S基因推导编码氨基酸序列的变异分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 杨小蓉,马良,许磊,赵晨璐,周建民

关键词: 猪流行性腹泻,基因,序列测定,变异分析

来源: 中国兽医杂志 2019年07期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 中牧实业股份有限公司,农业部兽用生物制品与化学药品重点实验室

分类号: S852.651

页码: 34-37

总页数: 4

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