玉米SPP基因家族的全基因组鉴定及表达分析

论文摘要

磷酸蔗糖磷酸酶（sucrose-phosphate phosphatase, SPP）是蔗糖生物合成途径中的关键酶,其主要作用是将蔗糖-6-磷酸水解成蔗糖。本研究利用生物信息学手段从玉米基因组中鉴定了2个SPP家族基因,命名为ZmSPP1和ZmSPP2,并从系统发育关系、蛋白结构域、基因结构和表达模式等方面分析了该基因家族的特征。结果发现,ZmSPP基因在基因结构上存在明显差异,但其编码蛋白的理化性质高度相似,并且均含有S6PP结构域和S6PPC结构域。表达谱分析显示,ZmSPP在玉米各组织中均有表达,但ZmSPP1的表达水平显著高于ZmSPP2,这暗示ZmSPP1可能在玉米蔗糖-6-磷酸水解过程中扮演重要作用。进一步分析授粉阻断后的叶片RNA测序数据,结果表明阻断授粉可以抑制玉米叶片中ZmSPP1基因表达,但不影响ZmSPP2基因表达。本研究将为进一步解析玉米ZmSPP基因的功能提供重要依据。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 ZmSPP基因的确定
•   1.2 SPP基因家族的系统发育分析
•   1.3 玉米SPP家族基因的保守结构域和基因结构分析
•   1.4 玉米SPP基因的表达模式分析
•   1.5 阻断授粉对Zm SPP基因的影响
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 玉米SPP家族基因的鉴定
•   3.2 SPP家族基因进化树的构建
•   3.3 玉米SPP家族基因的结构分析
•   3.4 玉米SPP基因的表达谱分析

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 何冰,时丕彪,吕远大,陈国祥

关键词: 玉米,磷酸蔗糖磷酸酶,家族基因,生物信息学,表达谱

来源: 分子植物育种 2019年23期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 南京师范大学生命科学学院,盐城市新洋农业试验站,江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所江苏省农业生物学重点实验室

基金: 国家自然科学基金项目(31771813),江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划项目(ZX(17)2015)共同资助

分类号: S513;Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.007649

页码: 7649-7656

总页数: 8

文件大小: 2155K

下载量: 140