基因启动子多态性论文-文苏麟

基因启动子多态性论文-文苏麟

导读:本文包含了基因启动子多态性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:水稻(Oryza,sativa),GLK转录因子,启动子,多态性

基因启动子多态性论文文献综述

文苏麟[1](2019)在《水稻转录因子GLK的启动子多态性及基因表达模式分析》一文中研究指出GLK转录因子隶属于GARP家族,广泛存在于高等植物中,其编码的转录因子能够起到促进叶绿体发育的调控机制,水稻中有一对GLK基因,分别为OsGLK1与OsGLK2。为深入探究该基因的功能,本文克隆了水稻中OsGLK2的启动子序列,并对水稻GLK基因的表达进行分析。在OsGLK2启动子上发现了8个TATA-box,13个CAAT-box,5个G-box位点;不同水稻种质上OsGLK2基因启动子存在很大多态性,OsGLK1及OsGLK2主要在叶子及根中表达,不同种质间的表达差异明显,3个基因型的表达量明显低于及其他样;分析发现CAAT-box是影响OsGLK2表达量的调控位点。(本文来源于《山地农业生物学报》期刊2019年05期)

王艳艳,郦银芳,张莉,王晓花[2](2019)在《儿童STING基因启动子区序列多态性分析》一文中研究指出目的:分析儿童外周血干扰素基因刺激因子(stimulator of interferon genes,STING)启动子-436~+267区域序列变化。方法:采用PCR产物直接测序的方法,对48例儿童的STING基因启动子区进行序列分析,构建重组报告质粒pGL-3/STING(TT)和pGL-3/STING(CC),转染人类胚胎肾(human embryonic kidney,HEK)293T细胞,检测其荧光素酶活性,计算相对活性单位(the relative luciferase activity unit,RLU)。结果:发现STING基因启动子区的1个新的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点(-401)T/C;该位点TT、TC、CC这3种基因型的频率分布分别为45.8%、37.5%、16.7%;经酶切、测序鉴定,成功构建了含有该位点的STING启动子序列(-436~+267)的表达质粒pGL-3/STING(TT)和pGL-3/STING(CC)。与pGL-3/STING(TT)质粒比较,pGL-3/STING(CC)启动子的RLU明显降低。结论:STING基因(-401)T/C是一个新的SNP,该SNP可降低STING基因启动子的活性,进而可能影响基因的转录调控,影响机体对疾病的易感性。(本文来源于《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊2019年10期)

孙曼妮,刘雨琪,孟涛,陈海英[3](2019)在《Fas基因启动子区670A/G多态性与子痫前期发病风险关系的Meta分析》一文中研究指出目的系统评价Fas基因启动子区670A/G基因多态性与子痫前期发病风险的关系。方法计算机检索Pub Med、EMBASE、Cochorane、CNKI、万方和维普数据库,搜集Fas基因多态性与子痫前期相关性的病例对照研究,检索时限从建库至2017年10月31日。由两名研究者分别独立按照纳入与排除标准筛选文献、提取资料并评价纳入研究的偏倚风险后,采用Stata11. 0软件进行数据分析。结果共纳入8个病例对照研究,9组数据,Meta分析结果显示Fas基因启动子区670A/G等位基因多态性与子痫前期相关(G/A:OR=1. 606,95%CI:1. 268~2. 033,P=0. 000; GA/AA:OR=1. 764,95%CI:1. 211~2. 570,P=0. 003; GG/AA:OR=2. 647,95%CI:1. 963~3. 569,P=0. 000; GG+AG/AA:OR=1. 978,95%CI:1. 344~2. 912,P=0. 001;GG/AA+GA:OR=1. 843,95%CI:1. 432~2. 373,P=0. 000)。因存在异质性,按文献来源所在大洲进行分组后,Meta分析发现欧洲国家的文章不存在异质性,基因多态性与子痫前期的发病风险存在相关性(隐形模型GG/AA+GA除外)。结论 Fas基因670A/G多态性与子痫前期发病风险有关,特别是欧洲人群的研究可信性更大,G等位基因是其潜在危险因素。(本文来源于《中国妇幼保健》期刊2019年18期)

刘纯宏,陆玉兰,黄华佗,王艳,王春芳[4](2019)在《LncRNA GAS5基因启动子区5 bp插入/缺失多态性在广西地区人群中的分布》一文中研究指出目的探讨广西地区人群中LncRNA GAS5基因启动子区1个功能性插入/缺失位点(rs145204276I/D)多态性的分布特点,并分析广西地区人群与其他地区人群rs145204276I/D位点多态性的分布差异。方法采用SNPscan技术对289例广西地区人群GAS5基因rs145204276I/D位点进行基因分型检测,统计其基因型和等位基因在广西地区人群不同性别间的分布,并分析其多态性与国际千人基因组计划(1000 genome project)数据库公布的欧洲人群(European,EUR)、日本人群(Japanese in Tokyo;JPT,)、西亚人群(South Asian,SAS)、美国人群(Ad Mixed American,AMR)、非洲人群(African,AFR)、北京人群(Han Chinese in Beijing,CHB)以及文献报道的南京、吉林、重庆和昆明人群的分布差异。结果广西地区人群GAS5基因rs145204276I/D位点I/I、I/D和D/D基因型频率分别为48.4%、43.6%和8.0%,I和D等位基因频率分别为70.2%和29.8%。rs145204276I/D基因型和等位基因频率在广西地区人群不同性别间比较差异无统计学意义(P>0.05)。广西地区人群GAS5基因rs145204276I/D位点的基因型和等位基因频率与EUR、AFR、AMR和JPT人群比较差异均有统计学意义(P均<0.05),而与CHB、南京、吉林、重庆和昆明人群比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论广西地区人群LncRNA GAS5基因rs145204276I/D位点基因多态性在男性和女性人群中分布无差异,而其多态性与其他地区人群间比较存在不同程度的差异。(本文来源于《临床检验杂志》期刊2019年08期)

赵志东,田宏山,蒋艳艳,石斌刚,刘秀[5](2019)在《牦牛ACSL1基因启动子多态性及其与乳品质性状的关联分析》一文中研究指出长链脂酰辅酶A合成酶1 (long chain acyl-CoA synthetase 1, ACSL1)在甘油叁酯、磷脂、胆固醇酯的合成及脂肪酸氧化中起关键作用,是乳品质性状的重要候选基因。牦牛(Bos grunniens)乳营养丰富,乳脂率高;但受分布地域环境、经济及生产条件制约,对其乳品质性状的遗传机理研究较少。本研究以甘南牦牛为研究对象,采用DNA测序方法,检测牦牛ACSL1基因启动子区多态位点,分析不同基因型、组合单倍型与甘南牦牛乳品质性状的相关性。结果表明,甘南牦牛群体ACSL1基因启动子区存在g.2079A>T、g.2409G>A突变和g.1235_g.1236delTG插入/缺失突变。ACSL1基因启动子F1区,基因型MN牦牛个体的乳蛋白率显着高于MM型(P<0.05),基因型BB牦牛个体的总固体物质含量、乳脂率显着高于AA和AB型(P<0.05);启动子F2区,基因型DD牦牛个体的乳脂率显着高于CC型(P<0.05);构建8种潜在的单倍型和5种组合单倍型,其中组合单倍型H4H4乳脂率和总固体物质含量最高,且显着(P<0.05)或极显着(P<0.01)高于其他组合单倍型。因此,牦牛ACSL1基因启动子区突变可作为甘南牦牛乳品质性状潜在的分子遗传标记,进而为丰富牦牛乳品质性状分子遗传研究提供理论依据。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年09期)

廖娟,王钢,曹珊,喻世刚[6](2019)在《MSTN基因启动子区多态性与黄杂鸡体重和体尺指标的相关性研究》一文中研究指出试验旨在研究MSTN基因启动子区多态性与黄杂鸡体重和体尺指标间的相关性,探寻可用于黄杂鸡选育的分子遗传标记。从乐山市井研养鸡场随机选取92只黄杂鸡,其中母鸡58只,公鸡34只,分别对其体重和各体尺指标进行测定,同时采用PCR-RFLP方法检测MSTN基因启动子区的单核苷酸多态性(SNP)。结果表明,在ATG上游1782位(A→G)发现1个SNP位点,即SNP(c.-1782A>G)。分析MSTN基因多态性与体重和体尺指标的关系,表现为叁种基因型:CC、CT和TT,CC基因型的个体在各项指标中显着高于CT和TT基因型个体。基因型与体重和体尺指标的相关性分析结果表明,CC基因型的黄杂鸡体斜长极显着高于CT和TT基因型黄杂鸡的(P<0. 01),CC基因型的个体体重显着高于CT和TT基因型黄杂鸡(P<0. 05),其余黄杂鸡指标性状在不同基因型组间差异不显着(P>0. 05)。说明MSTN基因启动子区SNP(c.-1782A>G)与黄杂鸡的体重和体斜长密切相关,该SNP可以作为黄杂鸡选育的分子遗传标记之一。(本文来源于《乐山师范学院学报》期刊2019年08期)

张玉超,李艾帆,李永芳,袁树华,郑红[7](2019)在《MMP-2基因启动子区1306位点C/T多态性与河南汉族急性缺血性脑卒中的关系》一文中研究指出目的探讨基质金属蛋白酶2(MMP-2)基因启动子区1306位点C/T(C1306T)多态性与河南汉族急性缺血性脑卒中(AIS)的关系。方法采用SNaPshot微测序技术,检测300例AIS患者[AIS组,大动脉粥样硬化型(LAA)240例、小动脉闭塞型(SAO)55例、不明原因型(SUE)5例]和300例健康志愿者(对照组)MMP-2基因C1306T位点基因型。以MMP-2基因C1306T多态性、高血压、糖尿病、高脂血症、高同型半胱氨酸为自变量,以AIS是否发生作为因变量,分析AIS发病危险因素。结果 AIS组MMP-2基因1306位点TT基因型和T等位基因频率低于对照组(P均<0.05)。在显性模式和隐性模式中,AIS组CT+TT基因型和TT基因型频率低于对照组(P均<0.05)。AIS组各亚型MMP-2基因C1306T的T等位基因频率均低于对照组(P均<0.05)。Logistic分析示高脂血症、高血压、糖尿病、MMP-2基因C1306T多态性均可增加AIS的发病风险(P均<0.05)。结论 MMP-2基因C1306T多态性与急性缺血性脑卒中的发病有关。携带TT基因型可降低患AIS的发病风险,携带CC基因型和C等位基因可能增加患AIS的风险。(本文来源于《山东医药》期刊2019年20期)

张娟娟,梅芬,李瑞玮,左荣霞,郑永钦[8](2019)在《ALOX5基因启动子SP-1结合位点多态性与急性髓系白血病易感性的关系》一文中研究指出目的探讨花生四烯5-脂氧合酶基因(arachidonate 5-lipoxygenase gene, ALOX5)基因启动子SP-1结合位点的多态性与成人急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)的相关性。方法采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析236例成人AML(实验组)和179例健康体检者(对照组)中ALOX5基因启动子SP-1结合位点的多态性,经PCR产物直接测序法进行验证,利用DNAStar软件对测序结果进行分析。结果检测到ALOX5基因启动子SP-1结合位点有6种基因型,包括4/4、4/5、4/6、5/5、5/6和6/6。在实验组和对照组中,基因型4/4的分布频率为20.30%和10.10%(OR=1.976,95%CI:1.050~3.719,χ~2=4.539,P<0.05);基因型4/6的分布频率为10.60%和26.80%(OR=0.386,95%CI:0.215~0.692,χ~2=10.513,P<0.05);等位基因6的分布频率为26.90%和30.20%(OR=0.736,95%CI:0.528~1.025,χ~2=3.291,P<0.05);SP-1位点的其余基因型、等位基因在实验组和对照组中分布频率差异无统计学意义(P>0.05),其可能不是成人AML发病风险的预警指标。结论 ALOX5基因启动子区SP-1结合位点的基因型4/6,等位基因6可能与AML发病风险降低有关,而携带基因型4/4人群可能易患AML。(本文来源于《临床与实验病理学杂志》期刊2019年06期)

胡晓飞,朱先华,刘鹏,金笑平[9](2019)在《基质金属蛋白酶13血清水平及基因启动子区-77A/G多态性与无症状性颈动脉狭窄的关联分析》一文中研究指出目的探讨基质金属蛋白酶13(MMP-13)血清水平及基因启动子区-77A/G多态性与无症状性颈动脉狭窄(asymptomatic carotid stenosis,ACS)的相关性。方法选取2015年6月—2017年12月期间在台州医院神经内科住院的621例ACS患者,通过颈动脉超声检查分为狭窄组(117例,狭窄≥50%)和对照组(504例,狭窄0~49%)。采用酶联免疫吸附试验方法检测所有患者MMP-13血清水平,运用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法分析MMP13-77A/G多态性。结果狭窄组MMP-13血清水平与对照组相比差异有统计学意义(P<0.01)。狭窄组A等位基因携带者频率较对照组高,差异有统计学意义[OR=1.861;95%CI(1.398~2.478)]。经logistic回归分析校正多种危险因素后,狭窄组AG、AA基因型频率均较对照组高,差异有统计学意义[AG:OR=1.833,95%CI(1.108~3.033),AA:OR=3.197,95%CI(1.777~5.792)]。结论 MMP-13血清水平及其基因-77A/G多态性与中度以上狭窄的ACS的发病风险密切相关,-77A等位基因可能是发病的一个遗传易患因子。(本文来源于《中华全科医学》期刊2019年07期)

殷成,赵冬冬,何森[10](2019)在《特发性癫痫与载脂蛋白E启动子基因多态性的相关性研究》一文中研究指出目的本研究从载脂蛋白E(APOE)启动子基因多态性的角度探索特发性癫痫可能的发病机制。方法纳入122例特发性癫痫患者,其中78例为局灶性癫痫患者,44例为全面性癫痫患者,使用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术检测APOE启动子基因型,运用检验和Logistic回归分析来检测其相关性。结果发现携带有-427T的癫痫患者中,其局灶性发作的比例显着高于携带-427C的患者,且单因素和多因素回归分析提示-427T是局灶性发作的危险因素。结论特发性癫痫患者中的局灶性癫痫发作可能与患者携带有APOE启动子-427T相关。(本文来源于《西部医学》期刊2019年06期)

基因启动子多态性论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的:分析儿童外周血干扰素基因刺激因子(stimulator of interferon genes,STING)启动子-436~+267区域序列变化。方法:采用PCR产物直接测序的方法,对48例儿童的STING基因启动子区进行序列分析,构建重组报告质粒pGL-3/STING(TT)和pGL-3/STING(CC),转染人类胚胎肾(human embryonic kidney,HEK)293T细胞,检测其荧光素酶活性,计算相对活性单位(the relative luciferase activity unit,RLU)。结果:发现STING基因启动子区的1个新的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点(-401)T/C;该位点TT、TC、CC这3种基因型的频率分布分别为45.8%、37.5%、16.7%;经酶切、测序鉴定,成功构建了含有该位点的STING启动子序列(-436~+267)的表达质粒pGL-3/STING(TT)和pGL-3/STING(CC)。与pGL-3/STING(TT)质粒比较,pGL-3/STING(CC)启动子的RLU明显降低。结论:STING基因(-401)T/C是一个新的SNP,该SNP可降低STING基因启动子的活性,进而可能影响基因的转录调控,影响机体对疾病的易感性。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

基因启动子多态性论文参考文献

[1].文苏麟.水稻转录因子GLK的启动子多态性及基因表达模式分析[J].山地农业生物学报.2019

[2].王艳艳,郦银芳,张莉,王晓花.儿童STING基因启动子区序列多态性分析[J].南京医科大学学报(自然科学版).2019

[3].孙曼妮,刘雨琪,孟涛,陈海英.Fas基因启动子区670A/G多态性与子痫前期发病风险关系的Meta分析[J].中国妇幼保健.2019

[4].刘纯宏,陆玉兰,黄华佗,王艳,王春芳.LncRNAGAS5基因启动子区5bp插入/缺失多态性在广西地区人群中的分布[J].临床检验杂志.2019

[5].赵志东,田宏山,蒋艳艳,石斌刚,刘秀.牦牛ACSL1基因启动子多态性及其与乳品质性状的关联分析[J].农业生物技术学报.2019

[6].廖娟,王钢,曹珊,喻世刚.MSTN基因启动子区多态性与黄杂鸡体重和体尺指标的相关性研究[J].乐山师范学院学报.2019

[7].张玉超,李艾帆,李永芳,袁树华,郑红.MMP-2基因启动子区1306位点C/T多态性与河南汉族急性缺血性脑卒中的关系[J].山东医药.2019

[8].张娟娟,梅芬,李瑞玮,左荣霞,郑永钦.ALOX5基因启动子SP-1结合位点多态性与急性髓系白血病易感性的关系[J].临床与实验病理学杂志.2019

[9].胡晓飞,朱先华,刘鹏,金笑平.基质金属蛋白酶13血清水平及基因启动子区-77A/G多态性与无症状性颈动脉狭窄的关联分析[J].中华全科医学.2019

[10].殷成,赵冬冬,何森.特发性癫痫与载脂蛋白E启动子基因多态性的相关性研究[J].西部医学.2019

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