宿主蛋白HSP70、ZBTB-38对日本乙型脑炎病毒增殖的影响

宿主蛋白HSP70、ZBTB-38对日本乙型脑炎病毒增殖的影响

论文摘要

流行性乙型脑炎(JE)是日本乙型脑炎病毒(JEV)引起的一种重要的人兽共患病,猪是其中间放大宿主。JEV能通过多种途径感染宿主,我们前期研究也表明,JEV能在小鼠的肺脏复制并发生呼吸道传播,但是JEV导致呼吸道感染的分子机理尚不清楚。为此,本研究聚焦JEV与宿主呼吸道细胞的相互作用,探究JEV与猪肺泡巨噬细胞(PAM)互作蛋白并验证其对于JEV增殖的影响。本研究运用免疫共沉淀技术,首先筛选PAM细胞与JEV互作的宿主蛋白,并通过LC/MSMS质谱分析,确认成功筛选出宿主互作蛋白HSP70和ZBTB-38。然后,运用CRISPR/Cas9技术分别构建HSP70和ZBTB-38基因敲除细胞系,并通过DNA测序及间接免疫荧光检测其敲除效果,测序结果显示两基因的DNA序列均成功发生移码,间接免疫荧光结果显示均无特异性荧光出现,结果表明HSP70和ZBTB-38均被成功敲除。接下来,在基因敲除细胞系PAM.KO.HSP70和PAM.KO.ZBTB-38接种JEV后48h,JEV的mRNA水平分别下降了2.3倍和9倍,病毒蛋白表达水平分别下降了0.25倍和1倍;感染后72h,病毒粒子数量较对照组均有0.3倍的下降。最后,在PAM.KO.HSP70和PAM.KO.ZBTB-38细胞系中分别过表达HSP70和ZBTB-38基因并接种JEV,结果显示,JEV感染后48h,与对照组相比JEV的mRNA水平分别增加了0.9倍和1.5倍,病毒蛋白表达水平增加了8.5倍和0.5倍;感染后72h,病毒粒子数量也有提高。综上,本研究结果表明,PAM蛋白HSP70和ZBTB-38为JEV的互作蛋白,对JEV的增殖发挥正向调控作用。本研究结果将为JEV的致病机理研究,尤其是JEV感染导致的呼吸道传播,提供前期研究资料。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 英文缩略词表
  • 第一部分 文献综述
  •   1 日本乙型脑炎病毒概述
  •   2 黄病毒与宿主细胞互作蛋白的概述
  •     2.1 黄病毒细胞受体
  •       2.1.1 DC-SIGN和 L-SIGN
  •       2.1.2 甘露醇受体
  •       2.1.3 CLEC5A
  •       2.1.4 TIM受体
  •     2.2 热休克蛋白
  •     2.3 锌指蛋白
  •   3 蛋白相互作用方法的概述
  •     3.1 免疫共沉淀
  •     3.2 酵母双杂交系统
  •     3.3 GST pull-down
  •   4 CRISPR/Cas9 基因编辑技术的概述
  •     4.1 CRISPR/Cas9 基因编辑技术组成
  •     4.2 CRISPR/Cas9 基因编辑技术作用机制
  •     4.3 CRISPR/Cas9 基因编辑技术的应用
  •       4.3.1 基因编辑技术CRISPR/Cas9 对体细胞基因编辑的应用
  •       4.3.2 基因编辑技术CRISPR/Cas9 在功能基因组筛选中的应用
  •       4.3.3 基因编辑技术CRISPR/Cas9 在疾病治疗的应用
  •   5 本研究目的与意义
  • 第二部分 试验研究
  •   第一章 日本乙型脑炎病毒与宿主细胞猪肺泡巨噬细胞互作蛋白的筛选
  •     1 材料
  •       1.1 试验材料
  •     1.1.1 试验毒株
  •     1.1.2 细胞系与载体
  •     1.1.3 主要试剂
  •     1.1.4 主要溶液配制
  •     2 方法
  •       2.1 JEV感染PAM细胞
  •       2.2 PAM细胞膜蛋白提取
  •       2.3 BCA蛋白定量
  •       2.4 免疫共沉淀
  •       2.5 LC-MS/MS分析及数据库查询
  •       2.6 CRISPR/Cas9 敲除HSP70、ZBTB-38 基因
  •     2.6.1 sgRNA设计
  •     2.6.2 PX459 载体线性化
  •     2.6.3 双链sgRNA的合成
  •     2.6.4 sgRNA二聚体与PX459 线性载体连接
  •     2.6.5 重组质粒的转化
  •     2.6.6 重组质粒的PCR鉴定
  •       2.7 敲除HSP70、ZBTB-38 基因PAM细胞系的构建
  •     2.7.1 PAM细胞嘌呤霉素耐受性试验
  •     2.7.2 质粒转染
  •     2.7.3 细胞筛选
  •     2.7.4 基因敲除PAM细胞DNA测序
  •     2.7.5 基因敲除PAM细胞的间接免疫荧光(IFA)检测
  •     3 结果
  •       3.1 JEV感染PAM细胞
  •       3.2 免疫共沉淀结果
  •       3.3 LC-MS/MS质谱分析
  •       3.4 重组质粒PCR鉴定
  •       3.5 PAM细胞嘌呤霉素耐受性试验
  •       3.6 HSP70、ZBTB-38 基因敲除细胞稳定株的基因组DNA测序
  •       3.7 基因敲除PAM细胞的间接免疫荧光(IFA)结果
  •     4 讨论
  •     5 小结
  •   第二章 宿主蛋白HSP70、ZBTB-38 对乙脑病毒的增殖影响
  •     1 材料
  •       1.1 试验材料
  •     1.1.1 细胞系与载体
  •     1.1.2 主要试剂
  •       1.2 主要仪器
  •     2 方法
  •       2.1 敲除HSP70、ZBTB-38 基因对乙脑病毒增殖的影响验证
  •     2.1.1 荧光定量PCR检测JEV增殖量
  •     2.1.2 Western-blot检测病毒蛋白表达水平
  •     2.1.3 噬斑实验检测病毒的滴度
  •       2.2 过表达HSP70、ZBTB-38 基因对乙脑病毒增殖的影响验证
  •     2.2.1 引物设计
  •     2.2.2 基因扩增及纯化
  •     2.2.3 真核表达载体的构建
  •     2.2.4 真核表达载体的鉴定
  •     2.2.5 细胞转染
  •     2.2.6 荧光定量PCR检测JEV增殖量
  •     2.2.7 Western-blot检测病毒蛋白表达水平
  •     2.2.8 噬斑实验检测病毒的滴度
  •     2.2.9 统计学方法
  •     3 结果
  •       3.1 荧光定量PCR检测基因敲除对JEV增殖影响的结果
  •       3.2 Western blot检测基因敲除对JEV增殖影响的结果
  •       3.3 噬斑实验检测基因敲除对病毒滴度影响的结果
  •       3.4 HSP70、ZBTB38 基因扩增
  •       3.5 真核表达载体酶切及测序鉴定
  •       3.6 真核重组质粒细胞转染结果
  •       3.7 荧光定量PCR检测基因过表达对JEV增殖影响的结果
  •       3.8 Western blot检测基因过表达对JEV增殖影响的结果
  •       3.9 噬斑实验检测基因过表达对病毒滴度影响的结果
  •     4 讨论
  •     5 小结
  • 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简历
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 柴春霞

    导师: 伍锐

    关键词: 病毒增殖

    来源: 四川农业大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 四川农业大学

    分类号: S852.65

    DOI: 10.27345/d.cnki.gsnyu.2019.000605

    总页数: 62

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