核盘菌几丁质酶基因家族分析与表达特性研究

论文摘要

核盘菌菌核以子实体形式萌发是作物菌核病病害循环中关键性的一环,研究菌核子实体萌发分子机理将为菌核病的安全控制提供线索.该研究通过生物信息学方法对核盘菌几丁质酶基因家族进行分析,并利用实时荧光RT-PCR对其在菌核子实体萌发阶段的表达进行探讨.生物信息学分析表明核盘菌中共有12个基因编码假定的几丁质酶,它们均具有GH18结构域,部分蛋白还具有几丁质结合结构域和纤维素结构域;除SS1G11212外其余蛋白均为亲水性蛋白;亚细胞定位预测表明其中10个假定几丁质酶位于胞外,其余2个分别位于细胞核和细胞质中.通过构建系统发育树分析发现假定几丁质酶可以分为2大类,其中3个与酵母几丁质酶CTS1归为一类,其余9个与CTS2归为另一类.除SS1G00773外,其余11个几丁质酶基因在核盘菌菌核子实体萌发过程中表达量均有变化,推测几丁质酶家族蛋白可能参与核盘菌菌核子实体萌发过程.

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•     1.1.1 菌株
•     1.1.1 主要试剂
•   1.2 方法
•     1.2.1 核盘菌假定几丁质酶氨基酸序列的获取及其生物信息学分析
•     1.2.2 核盘菌菌核子实体萌发的诱导
•     1.2.3 核盘菌假定几丁质酶基因表达分析
• 2 结果与分析
•   2.1 核盘菌几丁质酶家族分析
•   2.2 核盘菌几丁质酶家族系统发育关系分析
•   2.3 核盘菌假定几丁质酶基因的表达
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 杜娇,王娅波,肖继芬,李雪华,杨宇衡,毕朝位,余洋

关键词: 核盘菌,菌核子实体萌发,几丁质酶,基因表达

来源: 西南大学学报(自然科学版) 2019年01期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农业基础科学,植物保护

单位: 西南大学植物保护学院,凉山民族师范学校

基金: 重庆市基础与前沿研究一般项目(cstc2017jcyjAX0096),中央高校基本科研业务费“创新团队”专项(XDJK2017A006)

分类号: S432.44

DOI: 10.13718/j.cnki.xdzk.2019.01.006

页码: 39-45

总页数: 7

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