金线兰黄酮相关基因的克隆与生物信息学分析

论文摘要

为了对金线兰查尔酮合成酶CHS和黄酮醇合成酶FLS进行基因的克隆和生物学信息分析,本研究参照测序得到的金线兰CHS与FLS基因的序列,设计特异性引物进行扩增。利用软件,对金线兰CHS和FLS蛋白的生物信息进行预测分析。结果显示,金线兰CHS基因的CDS总长度1 185 bp,编码394个氨基酸,金线兰FLS基因的CDS总长度1 035 bp,编码344个氨基酸。金线兰CHS蛋白与FLS蛋白皆是酸性、亲水性、无信号肽、非分泌、非跨膜蛋白,亚细胞定位在其他细胞器上,丝氨酸磷酸化位点具有调控二者构象变化的重要作用。在Blast上进行序列比对,发现金线兰CHS序列和FLS蛋白序列与一些兰科植物的相似度很高,前者序列同源性均高达85%以上,后者同源性高达82%和81%,构建的进化树显示了他们较近的亲缘关系。推测得到的CHS序列即为金线兰查尔酮合成酶的编码序列,FLS蛋白序列即为金线兰黄酮醇合成酶的编码序列。本研究为进一步研究金线兰中黄酮相关基因及其调控提供一定参考。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 金线兰基因的克隆
•   1.2 金线兰CHS基因的生物信息学分析
•     1.2.1 金线兰CHS蛋白的理化性质预测与分析
•     1.2.2 金线兰CHS蛋白的信号肽预测
•     1.2.3 金线兰CHS蛋白的亚细胞定位预测
•     1.2.4 金线兰CHS蛋白的磷酸化位点预测
•     1.2.5 金线兰CHS蛋白的跨膜结构预测
•     1.2.6 金线兰CHS蛋白的二级结构预测
•     1.2.7 金线兰CHS蛋白的三级结构预测
•     1.2.8 金线兰CHS蛋白基因进化树分析
•   1.3 金线兰FLS基因的生物信息学分析
•     1.3.1 金线兰FLS蛋白的理化性质预测与分析
•     1.3.2 金线兰FLS蛋白的信号肽预测
•     1.3.3 金线兰FLS蛋白的亚细胞定位预测
•     1.3.4 金线兰FLS蛋白的磷酸化位点预测
•     1.3.5 金线兰FLS蛋白的跨膜结构预测
•     1.3.6 金线兰FLS蛋白的二级结构预测
•     1.3.7 金线兰FLS蛋白的三级结构预测
•     1.3.8 金线兰FLS蛋白基因进化树分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 材料与仪器
•   3.2 基因的克隆
•   3.3 金线兰基因的生物信息学分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陈莹,潘王韵,林思祖

关键词: 金线兰,查尔酮合成酶,黄酮醇合成酶,基因克隆,生物信息学

来源: 分子植物育种 2019年24期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,园艺

单位: 福建农林大学园林学院,福建农林大学林学院

基金: 福建省自然基金项目(2017J01614),福建省教育厅自然科学项目(JAT160169),福建省财政厅项目(k81139231)共同资助

分类号: S682.31;Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.008020

页码: 8020-8028

总页数: 9

文件大小: 4405K

下载量: 182