纳米孔测序技术在1例呼吸道感染患者病原检测中的应用

论文摘要

目的探索快速识别呼吸道感染患者致病病原的方法,为临床早期诊断与治疗提供支持。方法基于纳米孔掌上测序仪MinION对1例患者肺泡灌洗液进行实时测序,用BGI测序平台对样本开展宏基因组测序,并对样本进行病原菌分离培养实验。结果基于纳米孔测序技术的宏基因组测序在55 min内即检测到铜绿假单胞菌特异序列,后续的二代测序及分离培养实验进一步证实了致病病原为铜绿假单胞菌。结论在该例病原检测中,纳米孔测序技术将检测周期缩短至12 h左右,与其他方法相比具有更短的检测周期,有望成为临床感染病原实时检测的重要辅助手段。

论文目录

• 1 材料与方法
•    1.1 临床资料
•    1.2 材料
•      1.2.1 试剂
•      1.2.2 仪器设备
•    1.3 方法
•      1.3.1 核酸提取方案
•      1.3.2 MinION平台测序
•      1.3.3 BGISEQ-500平台测序
•      1.3.4 数据分析
•      1.3.5 病原分离培养
• 2结果
•   2.1 MinION测序结果
•   2.2 BGI测序结果
•   2.3病原体培养结果
• 3讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 林彦锋,李逢将,李中浤,刘慧莹,苑鑫,牛文凯,柏长青,杜昕颖,李鹏,刘雪林,宋宏彬

关键词: 纳米孔测序技术,宏基因组测序,铜绿假单胞菌,病原检测,呼吸道感染

来源: 军事医学 2019年08期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 临床医学,呼吸系统疾病

单位: 军事科学院军事医学研究院,解放军疾病预防控制中心,解放军总医院第五医学中心呼吸与危重症医学科

基金: 国家科技重大专项课题（2018ZX10712001-002-002）,北京市科技新星计划（Z181100006218110）

分类号: R56;R446.5

页码: 608-611+636

总页数: 5

文件大小: 1848K

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