导读:本文包含了差异表达文库论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:抑制,基因,文库,黑穗病,家蝇,幼虫,差异。
差异表达文库论文文献综述
陆宁,陈剑成,郑郁善[1]（2016）在《凹叶厚朴低温胁迫SSH文库的构建及差异基因的表达分析》一文中研究指出[目的]通过凹叶厚朴差减文库的构建及序列分析,找出其主要抗寒相关功能基因。[方法]随机挑选单克隆菌落进行PCR检测,对837个阳性克隆测序后进行拼接得到97个unigenes,将97个unigenes在NCBI进行BLAST比对,后进行BLAST2GO功能分类,推定出11个相关基因进行荧光定量PCR。[结果]CHS、APX、TRX、ERF、DREB、LHCB、WRKY、HSP、PP2C、GAPDH 10个基因在凹叶厚朴受到低温侵害时出现差异表达,推断这10个基因在低温时可能表现出防御机制。[结论]该研究为与凹叶厚朴亲缘关系相近的植物抗低温特性遗传育种提供理论基础。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2016年14期）
唐艳,裴志花,王莹,张惠,左红梅[2]（2015）在《四种病原菌诱导家蝇幼虫后构建的抑制性消减杂交文库中差异表达基因的分析》一文中研究指出对分别以猪致病性大肠杆菌、猪肺炎支原体、鸡白痢沙门氏菌及牛多杀性巴氏杆菌诱导家蝇幼虫后构建的四个抑制性消减文库中筛选到的差异表达基因进行分析。结果显示,不同病原菌诱导家蝇幼虫后筛选到了大量与家蝇免疫防御、信号传导、及物质能量代谢功能相关的基因和117个在Genbank数据库中没有同源相似序列的基因。除了4个库都筛选到的家蝇防御素基因、家蝇溶菌酶基因、家蝇细胞色素氧化酶基因外,各个库筛选到的差异表达基因的数量和种类都各有不同,为获得新型家蝇抗菌肽基因奠定基础。(本文来源于《中国畜牧兽医学会兽医药理毒理学分会第十一届会员代表大会暨第十叁次学术讨论会与中国毒理学会兽医毒理专业委员会第五次学术研讨会论文集》期刊2015-10-20）
黄宁,凌辉,张玉叶,苏亚春,肖新换[3]（2015）在《黑穗病菌胁迫下甘蔗SSH文库构建及差异表达基因分析》一文中研究指出甘蔗黑穗病是一种由黑穗病菌引起的气传真菌病害,然而目前甘蔗与黑穗病菌互作的分子机制仍有待进一步厘清。本研究以接种黑穗病菌和接种无菌水的甘蔗感黑穗病品种ROC22为材料,利用SSH(Suppression Subtractive Hybridization,抑制消减杂交)技术结合反向Northern杂交技术,在黑穗病菌胁迫下的甘蔗正、反向SSH文库中筛选获得190个差异表达基因,对这些基因进行测序后得到174条EST序列,经在NCBI中甘蔗EST数据库中进行blastn同源比对和TGICL软件组装后,获得155条Unigene,其中正向文库中数目为83条,反向文库中数目为72条,通过blastx将Unigene序列比对到蛋白数据库Nr、Swiss-Prot、KEGG和COG(evalue<0.00001),从而得到Unigene的蛋白功能注释信息,并根据nr及KEGG注释信息,对所有Unigene进行GO功能分类统计及Pathway注释。功能注释结果显示:这些Unigene可能与胁迫反应、物质代谢、信号转导、转录因子、跨膜通道、蛋白合成、蛋白相互作用及未知或假定蛋白等有关,其中假定和未知功能的Unigene的数目为41条,占总数的26.5%,在nr数据库中比对不到同源序列的Unigene的数目为36条,占总数的23.2%;GO注释显示155条Unigene被分为34个子分类;69条Unigene得到Pathway注释。根据生物信息学分析结果,选择与信号转导与调控、细胞死亡、过敏反应、能量代谢、氨基酸代谢和蛋白质合成相关的26个差异表达Unigene,在感病品种ROC22和抗病品种YC05-179中,通过实时荧光定量PCR技术,结合R语言及SPSS17.0对这26个基因在黑穗病菌胁迫下的表达模式进行相关性分析和聚类分析,结果显示26个Unigene-在两品种中不同程度响应黑穗病菌胁迫,且在抗病品种和感病品种中的表达模式不同,其中2-脱氢-3-脱氧庚糖酸醛缩酶基因(2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase),14-3-3类似蛋白基因(14-3-3-like protein)和叁磷酸腺苷双磷酸酶基因(apyrase 3-like)在抗病品种和感病品种中的表达模式显着不同.。根据已报道的植物防御机制中涉及的基因,比较其在两品种中的表达模式,相关性及聚类情况,为进一步了解甘蔗与黑穗病菌互作的分子机制提供一定的理论基础。(本文来源于《中国植物病理学会2015年学术年会论文集》期刊2015-07-21）
赵莉,石保新,李军,张壮志,马正海[4]（2015）在《细粒棘球蚴原头蚴包囊和原头蚴成虫抑制差减杂交文库中差异表达基因的筛选及分析》一文中研究指出细粒棘球绦虫原头蚴(PSC)具有双向发育的特点,本文旨在利用SSH和生物信息学方法筛选原头蚴包囊(CW)和成虫(AW)特异性的基因。将PSC-CW和PSC-AW双相发育差减cDNA文库的差减PCR产物克隆入pGEM-T载体并测序,利用CAP3sequence assembly在线软件、Blast2GO软件与GenBank数据库对测序结果进行分析,筛选原头蚴成囊和成虫特异性的基因,并探讨这些基因的功能。结果显示:对PSC-CW和PSC-AW文库进行扩增,分别得到280和200个阳性克隆,菌落PCR鉴定结果表明,这些克隆均插入200~1 000bp片段。测序结果显示从PSC-CW和PSC-AW SSH文库中分别得到16和10个特异性基因。其中PSC-CW SSH文库中得到4个出现频率较高的基因,其余12个基因仅出现1次,其中5个为未知基因,已知基因分别编码细胞色素C氧化酶Ⅰ、热休克蛋白70和铁蛋白等功能蛋白质。PSC-AW SSH文库中得到10个基因,其中2个出现频率较高基因,8个基因仅出现1次,4个为未知基因,6个已知基因分别编码基质蛋白1、延伸因子1α和脂肪酸结合蛋白等功能蛋白质。本研究筛选获得原头蚴成囊和成虫发育时差异表达的基因,对这些基因的功能进行分析表明,PSC-CW SSH文库中多是与营养和能量转运功能的相关基因,而PSC-AW SSH文库中多为发育与分化相关的基因,这些基因的差异表达可能与原头蚴处于不同的生长环境和发育方向有关,同时也为棘球蚴病免疫诊断、药物筛选和疫苗研制提供候选基因。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2015年07期）
薛浩,张志宏,傅俊范,王丰,马跃[5]（2015）在《利用抑制消减杂交技术构建苹果同源四倍体差异表达基因文库研究》一文中研究指出寒富苹果是沈阳农业大学育成的二倍体、抗寒大苹果品种,通过秋水仙素诱导获得寒富苹果同源四倍体在田间表现明显矮化等特性。为了探寻苹果同源四倍化后表型差异的分子机理,采用抑制消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术,分别建立寒富四倍体上调和下调表达cDNA文库。分别从这两个cDNA文库中各随机挑取200个阳性克隆测序,发现其中有211条序列与已知植物基因同源性大于80%,定量RT-PCR验证了部分uni ESTs的表达趋势和表达水平。初步筛选获得了与植株矮化相关的BKI1和DWF4基因,与植物光合特性相关的光系统II中的关键基因Psb Z;发现了四倍体中表达显着上调的Chitinase基因,推测四倍体可能在真菌病害的胁迫中表现更为优良的抗性。本研究为探究同源多倍体差异表型的分子机理奠定基础。(本文来源于《沈阳农业大学学报》期刊2015年03期）
蒋小珍,彭金霞,韦嫔媛,陈晓汉[6]（2014）在《低温处理与常温凡纳滨对虾基因差异表达文库的构建及分析》一文中研究指出【目的】筛选出对虾耐寒相关基因,为今后进一步研究对虾耐寒分子机理提供科学依据。【方法】利用SSH技术构建低温处理与常温凡纳滨对虾的基因差异表达文库,并通过斑点杂交、克隆测序分析及候选基因RT-PCR扩增等对差减获得的耐寒相关功能基因进行验证。【结果】在构建的正、负文库768个克隆中有152个为低温高表达克隆、331个为常温高表达克隆;将正文库100个克隆拼接可获得ESTs同源群39个,其中已知基因29个,主要涉及能量代谢、表达调控、信号传导、细胞免疫、抗细胞凋零、蛋白质加工及其他基因等;将负文库50个克隆拼接可获得ESTs同源群18个,其中已知基因17个,主要涉及细胞免疫、维持细胞代谢、物质转运、信号传导及其他基因等。经RT-PCR验证,从正文库中筛选出的HSPB1、NGT4和NGT7基因在低温条件下的表达量显着高于常温。【结论】综合运用SSH、斑点杂交、克隆测序和RT-PCR可有效筛选并验证凡纳滨对虾耐寒相关基因,为揭示对虾耐寒分子调控机制奠定基础。(本文来源于《南方农业学报》期刊2014年09期）
罗远莉[7]（2014）在《根肿病菌侵染茎瘤芥差减文库的构建及其差异表达基因鉴定》一文中研究指出茎瘤芥（Brassica juncea var. tumida Tsen）,是重庆市涪陵区的特色农业资源，其收获物瘤茎（俗称青菜头）是世界叁大名腌菜之一“涪陵榨菜”的主要原料。茎瘤芥营养丰富，加工后形成的榨菜脆嫩爽口、味道独特，深受国内外消费者的喜爱。榨菜业的发展为涪陵地区带来了稳定的经济效益和社会效益。可近年来，由于十字花科根肿病的扩展蔓延，严重影响茎瘤芥的产量，造成巨大的经济损失。根肿病是由芸薹根肿菌（Plasmodiophora brassicae）侵染所致。鉴于根肿病菌是一种单科单属的活体专性寄生真菌，不能进行体外人工培养，病原菌全基因组未测序，已知功能基因甚少，与其他病原菌的同源性不高，加之抗性材料缺乏，给抗病育种带来较大的影响。培育抗病品种是防治根肿病最有效的途径，抗性品种的选育，需要探明根肿病菌和茎瘤芥之间的分子互作关系，阐明根肿病的致病机理。因此，本论文从芸苔根肿菌和宿主茎瘤芥之间的分子互作入手，发掘茎瘤芥受根肿菌侵染后差异表达基因并研究其潜在的功能，将为阐明根肿病的致病机理、获得抗病相关基因，为病害的防治奠定基础。本研究通过几年研究工作，取得了以下主要成果。1）成功构建茎瘤芥抑制差减杂交文库：基于建立的稳定重复利用的茎瘤芥苗无土快繁种植体系，即采用珍珠岩加MS营养液，在光照培养箱中大量培育茎瘤芥幼苗。茎瘤芥苗两周达到出四叶期，为芸苔根肿菌的致病性接种及病原菌和寄主植物的互作提供了充足试验材料。利用抑制差减杂交文库技术，以人工接种感染芸苔根肿菌的感病植株和健康植株分别作为实验组和驱动组成功构建抑制差减杂交文库。经蓝白斑筛选，菌落PCR验证和斑点杂交，获得224个阳性克隆子。将阳性克隆子测序，得到高质量的EST序列196条，平均长度为332bp。将聚类、拼接的173条EST序列和NCBI的NT、EST数据库进行比对，其中146条(84.4%) EST序列和植物已知序列具有同源性。将聚类、拼接的173条EST序列所编码的蛋白质与NCBI的NR数据库进行比对，其中58条EST序列（33.5%）所编码的蛋白质和已知蛋白基因具有相似性，15条EST序列（8.7%）和假想蛋白基因具有相似性，100条EST序列（57.8%）与已知蛋白的基因没有同源性。利用在线软件对编码的蛋白质功能进行生物信息学分析显示，这些基因编码的蛋白质参与了多种细胞结构和分子过程，如能量代谢(11.11%)、压力反应和防御(5.56%)、运输(5.56%)、转录调控(5.56%)、翻译和生物合成（33.33%）及其他功能(38.91%)。EST序列在线提交NCBI的dbEST数据库，登录号是JK615948-JK616120。2）茎瘤芥SSH文库重要差异基因的筛选验证：采用实时荧光定量PCR分析了正向差减文库中随机挑取的四个基因的在不同时间表达水平。生物信息学分析表明这四个基因JK616040，JK616031， JK615948和JK615982分别是ATP合成酶链基因，40S核糖体蛋白基因，细胞色素b5氧化还原酶基因和热休克转录因子基因。同茎瘤芥健康植株相比，四个基因在罹病植株中均呈现明显的上调表达，证实本文所构建茎瘤芥SSH差减文库可信度高，从中筛选差异表达EST序列准确可靠。3）茎瘤芥重要差异基因的动态表达分析：对文库中的重要EST序列进行生物信息学分析，筛选出与植物防御或者感病响应相关的6类蛋白或受体的编码基因。与健株相比，病株中的乙烯反应转录因子（JK616020）在接种后10天到15天表达下调，而在接种20天以后，病株中的表达量几乎都大于健株。脱落酸受体（JK616120）基因在接种25天以前在病株中的表达量相对健株降低，而在接种后30天和40天在病株中的表达量远远大于健株。钙依赖蛋白激酶基因（JK616046）在病株中的转录水平与健株相比，从接种后10天到25天表达上调，而在接种30天和40天时表达降低。醌还原酶家族蛋白（JK616070）基因在接种后15天到30天，相对健株，在病株中的表达量均降低，只在接种后40天在病株中的表达量大于健株。热休克转录因子(JK616021)和JK616047（MYB家族转录因子）的转录量在接种后15天以前,在病、健组织中无显着区别，在接种15天以后病株表达量均大于健株。病程相关蛋白基因PR4（JK616077）在病株中的表达量均大于健株，在接种后40天，在病株的表达量显着增高。其中，乙烯反应转录因子、钙依赖蛋白激酶基因、热休克转录因子和病程相关蛋白基因可能与植物的抗病性相关，而脱落酸受体、醌还原酶家族蛋白、MYB家族转录因子可能与根肿病的病程相关。4）茎瘤芥防御应答的激素诱导测定：采用脱落酸、茉莉酸甲酯、乙烯和水杨酸四种不同激素诱导处理茎瘤芥植株，检测处理植株CDPK（钙依赖型蛋白激酶）基因和PR4(病程相关蛋白)基因的表达，结果显示，脱落酸（abscisic acid, ABA）处理能显着诱导CDPK（钙依赖型蛋白激酶）基因的表达，茉莉酸甲酯(methyljasmonate, MeJA)、乙烯（ethylene, ET）和水杨酸（salic acid, SA）均抑制CDPK的表达。水杨酸能显着诱导PR4基因的表达，脱落酸、乙烯、茉莉酸甲酯均抑制PR4基因的表达。5）重要功能基因序列全长克隆与特性鉴定：利用RACE技术扩增了乙烯反应转录因子（ERF）基因和病程相关蛋白PR4基因的全长序列，对2个基因进行了结构和功能的生物学信息分析。所测的乙烯反应转录因子序列（943bp）包括666bp开放阅读框，277bp的3'非翻译区，编码221个氨基酸。所测得的的病程相关蛋白PR4序列（584bp）包括423bp开放阅读框，161bp的3'非翻译区，编码141个氨基酸。对蛋白质基本特性分析表明，乙烯反应转录因子编码的蛋白质的相对分子质量为24413.1Da，理论等电点为6.35；病程相关蛋白编码的蛋白质的相对分子质量为15.5kD，理论等电点为8.13。信号肽和跨膜结构预测表明，乙烯反应转录因子基因编码的蛋白质没有信号肽和跨膜结构；病程相关蛋白基因编码的蛋白存在信号肽，没有跨膜结构。疏水性预测表明乙烯反应转录因子基因编码的蛋白质和病程相关蛋白具有亲水性。功能位点预测表明，乙烯反应转录因子编码的蛋白质具有AP2/ERF功能域；而PR4基因编码的蛋白质具有完整的DPBB-1超家族保守结构域。系统进化树分析表明，茎瘤芥ERF蛋白与甘蓝、油菜等十字花科作物亲缘关系较近，与白菜的PR4蛋白亲缘关系最近。在完成ERF基因的克隆与鉴定基础上，已成功构建ERF超表达载体,通过农杆菌遗传转化，获得2株拟南芥抗性植株。转基因阳性植株的PCR验证、外源基因表达分析，致病性接种功能验证工作正依序进行。结论：基于茎瘤芥SSH差减文库重要EST序列的研究，筛选鉴定茎瘤芥根肿病病程初期关键上调表达基因，这些基因参与植物防御反应。初步证实乙烯反应转录因子、钙依赖蛋白激酶基因、病程相关蛋白基因和热休克转录因子可能与植物的抗病性相关，而脱落酸受体、醌还原酶家族蛋白、MYB家族转录因子很可能与根肿病的病程相关。(本文来源于《重庆大学》期刊2014-04-01）
黄宁[8]（2014）在《黑穗病菌胁迫下甘蔗SSH文库构建及差异表达基因的克隆与分析》一文中研究指出甘蔗黑穗病是由黑粉菌(Sporisorium scitamineum)引起的一种气传真菌性病害,已经成为世界各植蔗区的主要病害之一。甘蔗黑穗病能引起蔗茎产量降低和蔗糖分的减少,给甘蔗产业造成较为严重的损失。杂交育种是甘蔗抗黑穗病育种最主要也是最重要的途径,但是,由于甘蔗抗黑穗病基因大多来源于野生种,而野生种中高产高糖基因与一些不利基因存在紧密连锁的关系,使得甘蔗传统杂交育种在导入抗病基因的同时,也导入了一些不良的非目标性状基因。因此,如果能在解析甘蔗与黑穗病菌互作的分子机理的基础上,挖掘抗病关键基因,进而通过转基因手段将此类基因转导入目标甘蔗品种中,达到定向改良品种抗性的目的,既可以避免不良性状基因的导入,又能保持目标甘蔗品种原有的优良性状和品质特性,同时兼具抗黑穗病的特性,是解决甘蔗抗黑穗病育种瓶颈的一种有效途径。本研究以甘蔗品种新台糖22号(ROC22)为实验材料,首先,使用抑制消减杂交(suppression subtractive hybridization, SSH)技术构建cDNA文库；其次,利用反向Northern杂交技术,筛选差异表达基因；再次,通过电子克隆和RT-PCR相结合的技术,克隆目的基因；最后,在对所克隆基因进行生物信息学分析的基础上,利用实时荧光定量PCR技术,检测这些基因的组织特异性表达情况以及在黑穗病菌、SA (salicylic acid)、MeJA (methyl-jasmonate)和ABA (abscisic acid)胁迫下的表达特性,以期揭示这些候选基因在甘蔗对黑穗病抗性中的作用机制,为后续利用甘蔗基因工程手段定向改良甘蔗品种对黑穗病的抗性,提供具有自主知识产权的基因资源,课题研究具有较为重要的理论和实践意义。主要实验结果如下：1、以接种甘蔗黑穗病菌48h和接种无菌水48h时间点的蔗芽为材料,利用抑制消减杂交技术,构建黑穗病菌胁迫下的甘蔗正、反向SSH文库。随后从文库中随机挑取24个克隆进行PCR鉴定,结果显示插入片段长度主要分布于150～750bp之间,说明本研究构建的SSH文库质量良好。2、从SSH文库中,筛选768个阳性克隆,进行反向Northern杂交,经过分析杂交信号强度,筛选获得190个差异表达基因。3、对经反向Northern杂交验证到的190个阳性克隆进行测序及生物信息分析,去除重复、污染及低质量(<100bp)序列后,获得了174个差异表达基因,这些基因主要存在于高分子配体(macromolecular complex)或细胞器(organelle)中,具有催化活性(catalytic activity)和结构分子活性(structural molecule activity),参与糖酵解(Glycolysis/Gluconeogenesis)、光合作物固碳(Carbon fixation in photosynthetic organisms)、半胱氨酸和蛋氨酸代谢(Cysteine and methionine metabolism)、二羧酸代谢(Glyoxylate and dicarboxylate metabolism)、氨基糖和核苷酸糖代谢(Amino sugar and nucleotide sugar metabolism)、氧化磷酸化(Oxidative phosphorylation)等代谢途径。4、在差异表达基因测序及生物信息学分析的基础上,开展如下工作：首先,从SSH文库中挑选6个差异表达EST序列,经电子克隆和RT-PCR扩增验证获得6个差异表达基因的全长cDNA序列,分别命名为细胞色素b5还原酶基因(Scb5R,GenBank登录号：KJ577591)、14-3-3蛋白基因(Sc14-3-3, GenBank登录号：KJ577592)、乙醇脱氢酶基因(ScADH, GenBank登录号：KJ577593)、泛素结合酶基因(ScUBc E2, GenBank登录号：KJ577594)、真核翻译起始因子5A基因(SceIF5A, GenBank登录号：KJ577595)、S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(ScSAM, GenBank登录号：KJ577596)；其次,对这6个基因进行生物信息学分析：甘蔗Scb5R基因全长1257bp,ORF长840bp,编码氨基酸297个,编码蛋白是一种无信号肽,定位于内质网的稳定、亲水、碱性、非分泌蛋白,蛋白质二级结构主要为无规则卷曲,主要功能为转运结合；甘蔗Sc14-3-3基因全长1048bp, ORF长771bp,编码氨基酸256个,编码蛋白是一种无信号肽,定位于细胞质的稳定、亲水、酸性、非分泌蛋白,蛋白质二级结构主要为α-螺旋,主要功能为翻译和能量代谢；甘蔗ScADH基因全长1644bp, ORF长1140bp,编码氨基酸379个,编码蛋白是一种无信号肽,定位于叶绿体基质的稳定、亲水、酸性、非分泌蛋白,蛋白质二级结构主要为无规则卷曲,主要功能为能量代谢和翻译；甘蔗ScUBc E2基因全长997bp, ORF长447bp,编码氨基酸148个,编码一种无信号肽,定位于细胞质的不稳定、亲水、碱性、非分泌蛋白,蛋白质二级结构主要为无规则卷曲；甘蔗SceIF5A基因全长1174bp, ORF长483bp,编码氨基酸160个,编码蛋白是一种无信号肽,定位于细胞质的稳定、亲水、酸性、非分泌蛋白,蛋白质二级结构主要为无规则卷曲,主要功能为翻译和能量代谢；甘蔗ScSAM基因全长1788bp, ORF长1196bp,编码氨基酸396个,是一种无信号肽,定位于细胞质的稳定、亲水、酸性、非分泌蛋白,蛋白质二级结构主要为无规则卷曲,主要功能为能量代谢和翻译。最后,通过实时荧光定量PCR技术,对这6个基因在叶片、侧芽、蔗髓和根等不同组织中的表达情况及其在黑穗病菌、SA、MeJA和ABA胁迫下的表达特征进行分析,结果显示：这6个基因的转录本,除甘蔗Sc14-3-3基因、ScADH基因外,其余均在侧芽中检测到最高的转录水平。在品种YC05-179中,甘蔗Scb5R基因在受黑穗病菌胁迫及SA、MeJA和ABA诱导后表达均呈“扬-抑-扬”的趋势；甘蔗Sc14-3-3基因的表达受到黑穗病菌、SA、MeJA和ABA强烈诱导表达；甘蔗ScADH基因受ABA诱导表达,同时受黑穗病菌先抑制后诱导表达,SA和MeJA先诱导后抑制表达；甘蔗ScUBc E2基因受SA和MeJA诱导表达。甘蔗SceIF5A基因受黑穗病菌、SA、MeJA和ABA诱导表达；甘蔗ScSAM基因在接种黑穗病菌后呈“扬-抑-扬”表达趋势,受SA诱导后,呈“扬-抑”趋势。(本文来源于《福建农林大学》期刊2014-04-01）
周前凯,张彩霞,王华,魏广兵,李娟[9]（2013）在《从SAGE文库筛选的家蚕正反交F_1代3个差异基因的组织表达分析》一文中研究指出家蚕许多数量遗传性状在品种的正反交之间存在明显差异,研究产生性状差异的分子机制对于家蚕育种具有重要指导意义。基于家蚕品种75新与7532正反交F1代同性别间的SAGE文库,比较、筛选出与家蚕抗逆性相关的3个表达差异显着基因——线粒体硫氧还蛋白2(TRx2)基因、谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)基因、抗菌肽(AMPs)基因。在幼虫5龄期设置高温(34℃)饲养环境,利用竞争性半定量RT-PCR方法检测3个差异基因在75新与7532的正反交F1代幼虫脂肪体、中肠和丝腺组织中的转录水平。TRx2基因和GPx基因在正反交F1代雌、雄幼虫的3个组织中均有表达,其中:TRx2基因在反交F1代雌、雄幼虫3个组织的转录水平总体上略高于正交F1代,表达趋势为先升高后降低,至5龄第6天的表达最高;GPx基因在正反交F1代雌性幼虫3个组织的转录水平在整个5龄期无明显差异,但雄性幼虫中该基因的转录水平在5龄第3天和第6天以反交F1代雄性幼虫略高,推测其抗氧化性能高于正交F1代雄性幼虫。AMPs基因在正反交F1代幼虫脂肪体中的转录水平最高,且正反交之间、雌雄之间无明显差异,推测该基因在脂肪体中的高水平表达对维持家蚕在高温环境下的体内稳态环境起重要作用。(本文来源于《蚕业科学》期刊2013年04期）
王莹[10]（2013）在《牛多杀性巴氏杆菌诱导家蝇幼虫抑制性消减文库的构建及部分差异表达基因的分析》一文中研究指出随着抗生素耐药性问题的日趋严峻,研究和筛选具有新型作用机理的抗菌药物已成为当前医药领域里亟待解决的问题。而抗菌肽具有独特的,不同于抗生素的抗菌机制,仅作用于原核细胞和发生病变的真核细胞,对正常的真核细胞几乎没有影响,且不易产生耐药性。家蝇长期生长于杂菌横生的恶劣环境,却具备极强的生存能力,这说明其体内的自身免疫防御机制发挥着作用,自身产生抗菌活性物质的结果。因此,越来越多的人将目光投向家蝇抗菌肽的研究,并期望成为新一代有效抗癌、抗病毒、抗细菌药物。本研究以3日龄家蝇幼虫为材料,将全部家蝇幼虫随机分为两组,其中一组以致病性较强的牛源多杀性巴氏杆菌为诱导菌对虫体进行针刺诱导,作为实验组(Tester);另一组以同样的方法对虫体进行无菌针刺,作为对照组(Driver)。相同条件培养24h后,分别提取活体RNA并分离纯化mRNA,逆转录获得cDNA。运用抑制性消减杂交技术成功构建了牛多杀性巴氏杆菌诱导家蝇幼虫的正向、反向cDNA文库,以PCR法和反Northern点杂交法进行两次筛选成功获取差异表达基因,最后利用RACE技术成功获得部分差异表达基因的全长序列,并进行核酸、氨基酸等功能的分析预测。主要实验结果如下：正向cDNA文库中的586个单克隆经反Northern点杂交筛选得到147个差异表达基因；反向cDNA文库中的553个阳性克隆经反Northern点杂交筛选得到82个差异表达基因。测序比对分析,正向cDNA文库得到包括家蝇防御素基因、角质蛋白基因、过氧化物歧化酶基因等在内的家蝇相关基因及32个未知功能基因；反向cDNA文库得到包括家蝇溶菌酶基因、丝氨酸蛋白酶抑制剂编码基因、精氨酸激酶基因等在内的家蝇相关基因及4个未知功能基因。通过RACE技术获得了159号溶菌酶基因、479号防御素基因、328号无同源基因的完整核苷酸序列。核酸及氨基酸序列功能分析预测结果表明159号溶菌酶基因及479号防御素基因分别与GenBank注册的家蝇溶菌酶1基因(AY344589.1)、家蝇防御素基因(AY260152.1)有较高同源性,尚未发现与328号无同源基因核苷酸序列同源性较高的基因序列。上述实验结果为进一步筛选牛多杀性巴氏杆菌诱导家蝇幼虫产生的差异表达基因奠定基础,为新型家蝇抗菌肽的研究提供依据。(本文来源于《吉林农业大学》期刊2013-06-01）
差异表达文库论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
对分别以猪致病性大肠杆菌、猪肺炎支原体、鸡白痢沙门氏菌及牛多杀性巴氏杆菌诱导家蝇幼虫后构建的四个抑制性消减文库中筛选到的差异表达基因进行分析。结果显示,不同病原菌诱导家蝇幼虫后筛选到了大量与家蝇免疫防御、信号传导、及物质能量代谢功能相关的基因和117个在Genbank数据库中没有同源相似序列的基因。除了4个库都筛选到的家蝇防御素基因、家蝇溶菌酶基因、家蝇细胞色素氧化酶基因外,各个库筛选到的差异表达基因的数量和种类都各有不同,为获得新型家蝇抗菌肽基因奠定基础。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
差异表达文库论文参考文献
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